化工儀器網(wǎng)手機(jī)版
移動端訪問更便捷
今日焦點(diǎn) Today's Focus
查看更多+-
2025年上半年液相色譜儀海關(guān)數(shù)據(jù)盤點(diǎn)：進(jìn)口金額高達(dá)14.88億元！國產(chǎn)液相色譜技術(shù)亟待加強(qiáng)
據(jù)化工儀器網(wǎng)整理，我國2025年上半年液相色譜儀[詳細(xì)]
熱門視頻 Popular videoS
查看更多+
專題
專題
突破性新方法DeepSecMS助力深入解析硒蛋白質(zhì)組 為疾病機(jī)制研究開辟新路徑
2025年08月01日 16:20:42
來源：化工儀器網(wǎng) 作者：宋池 點(diǎn)擊量：829
中科院上海有機(jī)所團(tuán)隊(duì)在《Advanced Science》發(fā)表創(chuàng)新方法DeepSecMS，攻克硒蛋白質(zhì)組研究難題。該方法利用深度學(xué)習(xí)技術(shù)，基于硒代半胱氨酸（Sec）與半胱氨酸（Cys）的化學(xué)相似性，創(chuàng)新采用Cys數(shù)據(jù)代理訓(xùn)練策略構(gòu)建理論譜圖庫。
硒蛋白是一類含有稀有氨基酸硒代半胱氨酸(Sec)的特殊蛋白質(zhì)，在維持細(xì)胞氧化還原平衡、調(diào)控關(guān)鍵生理過程以及與神經(jīng)退行性疾病、癌癥、心血管疾病和糖尿病等多種重大疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。然而，受限于Sec的稀有性及檢測分析難度，人類迄今僅鑒定出25種硒蛋白，全面繪制硒蛋白圖譜并發(fā)現(xiàn)新成員仍是該領(lǐng)域面臨的重大挑戰(zhàn)。
針對這一難題，中國科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所生物與化學(xué)交叉研究中心張耀陽研究員課題組取得了重要進(jìn)展。該團(tuán)隊(duì)在前期研究中開發(fā)了硒代半胱氨酸特異性質(zhì)譜方法(SecMS)和非SECIS依賴的硒蛋白數(shù)據(jù)庫(SIS)，首次繪制了小鼠組織特異性硒蛋白圖譜并發(fā)現(xiàn)了新硒蛋白(PMID: 30174312)。近日，課題組在國際知名期刊《Advanced Science》上發(fā)表了題為“DeepSecMS Advances DIA-Based Selenoproteome Profiling Through Cys-to-Sec Proxy Training”的研究論文，介紹了其最新開發(fā)的創(chuàng)新方法——DeepSecMS。
DeepSecMS方法的核心創(chuàng)新在于巧妙地結(jié)合了深度學(xué)習(xí)技術(shù)，并利用了硒代半胱氨酸(Sec)與其結(jié)構(gòu)類似物半胱氨酸(Cys)的高度化學(xué)相似性特性。由于已知含Sec肽段的真實(shí)譜圖數(shù)據(jù)極其稀少，難以直接用于訓(xùn)練深度學(xué)習(xí)模型，研究團(tuán)隊(duì)創(chuàng)新性地采用了“Cys-to-Sec取代訓(xùn)練策略”。該策略通過利用大量易獲得的含Cys肽段數(shù)據(jù)，成功構(gòu)建了一個(gè)大規(guī)模的理論含Sec肽段譜圖庫。
研究結(jié)果表明，DeepSecMS能夠高精度預(yù)測含Sec肽段的關(guān)鍵質(zhì)譜特征，包括二級質(zhì)譜(MS2)譜圖、保留時(shí)間(RT)和離子淌度(IM)。將DeepSecMS與數(shù)據(jù)非依賴性采集(DIA)質(zhì)譜技術(shù)相結(jié)合，研究人員在多種人源細(xì)胞系和小鼠組織樣本中顯著提升了對已知硒蛋白的鑒定能力，并發(fā)現(xiàn)了大量高可信度的潛在新型硒蛋白。
這項(xiàng)研究開發(fā)的DeepSecMS方法，為全面解析哺乳動物硒蛋白質(zhì)組提供了強(qiáng)大且高效的新工具，有望推動在更深層次上探索硒蛋白在人體健康與疾病中的作用。研究團(tuán)隊(duì)指出，該工作中提出的“Cys-to-Sec”代理訓(xùn)練策略具有潛在的普適性，可推廣應(yīng)用于研究其他低豐度蛋白質(zhì)變體或翻譯后修飾，為微量蛋白質(zhì)組學(xué)研究提供了一個(gè)可擴(kuò)展的技術(shù)框架。
相關(guān)閱讀 Related Reading
查看更多+-
就等你啦！“第三屆工業(yè)園區(qū)污水監(jiān)測方案線上會議”報(bào)名開啟
2025年8月19日14:00，化工儀器網(wǎng)特聯(lián)合哈希水質(zhì)分析儀器(上海)有限公司，舉辦“第三屆工業(yè)園區(qū)污水監(jiān)測方案線上會議”。2025-08-01 10:47:53 -
預(yù)算264萬 昆明市延安醫(yī)院采購檢驗(yàn)設(shè)備
近日，昆明市延安醫(yī)院就“2025年昆明市延安醫(yī)院檢驗(yàn)科設(shè)備采購項(xiàng)目（三次）”發(fā)布公開招標(biāo)公告，預(yù)算金額為264.8萬元。2025-08-01 10:19:30 -
涉及質(zhì)譜、光譜法 2025年山西檢驗(yàn)檢測機(jī)構(gòu)能力驗(yàn)證項(xiàng)目公布
2025年山西檢驗(yàn)檢測機(jī)構(gòu)能力驗(yàn)證項(xiàng)目公布，項(xiàng)目檢測方法主要涉及電感耦合等離子體質(zhì)譜法、電感耦合等離子體發(fā)射光譜法等。2025-07-31 14:58:07 -
預(yù)算996萬元 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)采購光譜質(zhì)譜設(shè)備
2025年食品重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室光譜質(zhì)譜設(shè)備的預(yù)算為996萬元，項(xiàng)目編號為N5100012025002095。2025-07-31 10:20:56 -
預(yù)算250萬元 保定市纖維檢驗(yàn)所采購檢驗(yàn)儀器
近日，保定市纖維檢驗(yàn)所委托河北蘊(yùn)藏隆工程管理有限公司組織公開招標(biāo)，采購高效液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用儀等檢驗(yàn)儀器，預(yù)算250萬元。2025-07-31 09:05:45
版權(quán)與免責(zé)聲明
- ①凡本網(wǎng)注明“來源：化工儀器網(wǎng)”的所有作品，均為浙江興旺寶明通網(wǎng)絡(luò)有限公司-化工儀器網(wǎng)合法擁有版權(quán)或有權(quán)使用的作品，未經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)不得轉(zhuǎn)載、摘編或利用其他方式使用上述作品。已經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)使用作品的，應(yīng)在授權(quán)范圍內(nèi)使用，并注明“來源：化工儀器網(wǎng)”。違反上述聲明者，本網(wǎng)將追究其相關(guān)法律責(zé)任。
- ②本網(wǎng)轉(zhuǎn)載并注明自其他來源（非化工儀器網(wǎng)）的作品，目的在于傳遞更多信息，并不代表本網(wǎng)贊同其觀點(diǎn)和對其真實(shí)性負(fù)責(zé)，不承擔(dān)此類作品侵權(quán)行為的直接責(zé)任及連帶責(zé)任。其他媒體、網(wǎng)站或個(gè)人從本網(wǎng)轉(zhuǎn)載時(shí)，必須保留本網(wǎng)注明的作品第一來源，并自負(fù)版權(quán)等法律責(zé)任。
- ③如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)等問題，請?jiān)谧髌钒l(fā)表之日起一周內(nèi)與本網(wǎng)聯(lián)系，否則視為放棄相關(guān)權(quán)利。
