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中外團(tuán)隊(duì)合作開(kāi)發(fā)空間代謝組學(xué)定量新技術(shù) 揭示腦卒中后遠(yuǎn)程代謝重塑

2025年08月21日 08:36:58 來(lái)源:化工儀器網(wǎng) 作者:宋池 點(diǎn)擊量:257

,復(fù)旦大學(xué)與荷蘭萊頓大學(xué)團(tuán)隊(duì)在《Nature Metabolism》發(fā)表研究,開(kāi)發(fā)出一種基于¹³C標(biāo)記酵母提取物內(nèi)標(biāo)的質(zhì)譜成像方法,實(shí)現(xiàn)了200多種代謝物的空間精準(zhǔn)定量,克服了傳統(tǒng)技術(shù)定量可靠性低的局限。

  2025年8月5日,國(guó)際權(quán)威期刊《Nature Metabolism》在線(xiàn)發(fā)表了復(fù)旦大學(xué)附屬兒科醫(yī)院與荷蘭萊頓大學(xué)醫(yī)學(xué)中心合作的一項(xiàng)研究成果。該研究開(kāi)發(fā)了一種基于質(zhì)譜成像(MSI)的空間定量代謝組學(xué)檢測(cè)方法,突破了傳統(tǒng)技術(shù)在定量能力與跨樣本比較方面的局限,并首次發(fā)現(xiàn)腦卒中發(fā)生后,同側(cè)大腦皮層中組織學(xué)未見(jiàn)損傷的遠(yuǎn)離區(qū)域會(huì)出現(xiàn)長(zhǎng)期且顯著的代謝重編程。
 

 

 
  空間代謝組學(xué)作為空間生物學(xué)的重要分支,能夠在原生微環(huán)境中定位代謝物的空間分布,揭示組織與細(xì)胞間的代謝異質(zhì)性。然而,由于基質(zhì)效應(yīng)、離子源內(nèi)裂解、加合物形成等技術(shù)偽影,以及常見(jiàn)的批次效應(yīng),傳統(tǒng)質(zhì)譜成像難以實(shí)現(xiàn)跨區(qū)域、跨樣本的可靠定量,尤其是對(duì)水溶性代謝物的分析面臨較大挑戰(zhàn)。
 
  針對(duì)這一難題,研究團(tuán)隊(duì)創(chuàng)新性地提出使用¹³C標(biāo)記酵母提取物作為內(nèi)標(biāo),對(duì)組織切片中的代謝物數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)一校正與歸一化。相較于傳統(tǒng)方法,該策略能更敏感地識(shí)別具有生物學(xué)意義的代謝變化,實(shí)現(xiàn)了對(duì)200多種代謝物的相對(duì)定量及部分代謝物的絕對(duì)定量,并在小鼠腦和腎臟組織中驗(yàn)證了其廣泛適用性。
 
  在研究應(yīng)用中,團(tuán)隊(duì)以小鼠腦卒中模型為對(duì)象,系統(tǒng)描繪了卒中后梗死核心區(qū)及周邊區(qū)域的代謝動(dòng)態(tài)變化。值得注意的是,研究首次發(fā)現(xiàn),在組織學(xué)未受損的同側(cè)感覺(jué)運(yùn)動(dòng)皮層中,也存在顯著的代謝重塑:卒中后第7天,具有神經(jīng)保護(hù)作用的賴(lài)氨酸水平上升,而興奮性氨基酸谷氨酸水平下降,提示該區(qū)域在亞急性期發(fā)生了適應(yīng)性代謝調(diào)整;至第28天,雖然賴(lài)氨酸與谷氨酸水平基本恢復(fù),但與細(xì)胞脆弱性相關(guān)的尿苷二磷酸N-乙酰葡糖胺(UDP-GlcNAc)和亞油酸仍持續(xù)處于低水平,表明該區(qū)域可能存在長(zhǎng)期代謝易損性。研究強(qiáng)調(diào),未使用內(nèi)標(biāo)的傳統(tǒng)歸一化方法無(wú)法檢測(cè)到這些差異。
 
  該技術(shù)顯著提升了空間代謝組學(xué)的定量可靠性,為代謝機(jī)制研究和臨床診斷應(yīng)用提供了新基礎(chǔ)。研究團(tuán)隊(duì)同時(shí)指出,代謝物注釋 uncertainty 仍是當(dāng)前領(lǐng)域的主要挑戰(zhàn)之一,未來(lái)將結(jié)合激光捕獲顯微切割等正交技術(shù),進(jìn)一步提升注釋準(zhǔn)確性與生物學(xué)解釋深度。
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