riboPOOL 核糖體RNA去除探針-人源/小鼠/大鼠riboPOOLs

riboPOOL 靈活高效的去除核糖體RNA

核糖體RNAs(rRNA)約占RNA-Seq數(shù)據(jù)讀取量的90%,去除后可大大節(jié)省RNA-seq的測(cè)序成本。riboPOOL可以高效和特異性地去除rRNAs,適合大多種模式和非模式物種或RNA序列。

riboPOOL 的主要優(yōu)勢(shì)

種類(lèi)豐富：豐富的成品型目錄可供選擇，目錄持續(xù)更新中；目錄以外物種或RNA可以定制

工作流程快：一步法，完整工作流程僅用時(shí)70min

起始量范圍廣泛：在100 ng到5μg的RNA起始量之間都有很好的去除效率

針對(duì)特殊應(yīng)用定向優(yōu)化：ibosome profiling樣本；環(huán)境轉(zhuǎn)錄組學(xué)（如土壤、污泥）

高效的去除：去除效率高，結(jié)果穩(wěn)定可重復(fù)

搭配靈活：兼容各種RNA純化和RNA建庫(kù)方法

探針?lè)ǎ簺](méi)有酶切偏好,可以均一的覆蓋轉(zhuǎn)錄本；無(wú)打斷樣本風(fēng)險(xiǎn)；適用于無(wú)polyA結(jié)構(gòu)的RNA（如snoRNA,LncRNA, 組蛋白）

兼容多種下游分析方法：如RNA-Seq、微陣列分析和實(shí)時(shí)定量PCR等

可混合使用：客戶(hù)可根據(jù)樣本的組成比例，混合使用2-4種riboPOOL，如病原體感染的人體組織（人源+原核通用型）、人血液樣本（人源+人血珠蛋白）、植物微生物群研究（植物通用型+原核通用型）

目錄 成品型 riboPOOLs

riboPOOL 工作流程

riboPOOL 有效起始量范圍(100ng-5ug)

riboPOOL 可混合使用（復(fù)合型）

測(cè)試樣本為（a）SW48 細(xì)胞 (人源), NIH3T3細(xì)胞 (小鼠)和DH10B株大腸桿菌RNA混合物。 實(shí)驗(yàn)比較（b）單獨(dú)使用人源、鼠源、原核通用型riboPOOL和（c）使用復(fù)合型riboPOOL（由1：1：1的人源、鼠 源、原核通用型riboPOOL混合構(gòu)成），兩者均可有效去除1μg RNA混合樣本中的rRNA. rRNA的去除效率用生物分析儀,或rtqPCR分析評(píng)估（用rRNA或GAPDH（管家基因）特異性的引物進(jìn)行實(shí)時(shí)定 量PCR ）。

人源/小鼠/大鼠riboPOOLs

可去除細(xì)胞質(zhì)rRNA (28S, 18S, 5.8S & 5S rRNA)&線(xiàn)粒體rRNA

高質(zhì)量RNA(RIN >7)，rRNA去除效率可達(dá)97%-98%

降解RNA/FFPE(RIN<7)，rRNA去除效率可達(dá)87%-98%

Ribo-Seq（30nt片段），優(yōu)化不易去除區(qū)域探針密度，rRNA去除效率約75%

*不同實(shí)驗(yàn)方案間有一定差異

riboPOOL的rRNA去除效率高約10%

兩種試劑的可重復(fù)性相當(dāng)

原核通用型（細(xì)菌/古生菌）

覆蓋廣泛的原核生物(細(xì)菌/古生菌)，適合微生物培養(yǎng)物、宏基因組、微生物組群分析

去除目標(biāo)涵蓋 5S, 16S and 23S rRNA

原核通用型 riboPOOL設(shè)計(jì)依據(jù)

基于76個(gè)代表性物種的rRNAs 序列設(shè) 計(jì)的微生物通用型 riboPOOL，適合圖 中所示的類(lèi)群(內(nèi)圈，粗體)和亞群(外圈) 所涵蓋的細(xì)菌和古細(xì)菌。

*如果您感興趣的物種不屬于這些類(lèi)群或亞群，請(qǐng)咨詢(xún)我們的定制型riboPOOLs產(chǎn)品。

**譯注:暫無(wú)中文譯名

原核通用型 riboPOOL已驗(yàn)證物種（RNA-Seq ）

測(cè)試結(jié)果來(lái)自不同的實(shí)驗(yàn)室，rRNA去除效率從~50-98%不等，在大多數(shù)物種中rRNA去除效率>70% 。去除效率可能因樣品類(lèi)型和實(shí)驗(yàn)條件的不同而不同。 高質(zhì)量的RNA樣本中效率高。推薦的起始RNA投放量為100 ng-5 μg。

植物通用型（被子植物）

可去除細(xì)胞質(zhì)(28S, 18S, 5.8S & 5S) 、質(zhì)體和線(xiàn)粒體 rRNA

廣泛覆蓋開(kāi)花植物

適合葉片、種子和根等各種組織部位

植物通用型 riboPOOL 可以覆蓋開(kāi)花植物的主要門(mén)類(lèi)

包括30 多個(gè)目（見(jiàn)下圖） 常見(jiàn)物種，如下：

水稻 · 麻瘋樹(shù) · 大豆·土豆 · 棉花 · 咖啡·胡蘿卜 · 洋薊 · 橄欖·擬南芥 · 玉米 · 翠菊·小麥 · 蘋(píng)果 · 橙子·蕎麥 · 及其他

*如果您感興趣的物種不屬于這些門(mén)類(lèi)， 請(qǐng)咨詢(xún)我們的定制型 riboPOOL產(chǎn)品

植物通用型 riboPOOL的β測(cè)試結(jié)果

開(kāi)花植物的去除效率大于91% 值得注意的是，在原始藻類(lèi)綠藻中rRNA去除效率為80%，表明植物通用型riboPOOL可以應(yīng)用于被 子植物以外的植物門(mén)類(lèi)。

riboPOOL 核糖體RNA去除探針-人源/小鼠/大鼠riboPOOLs 產(chǎn)品屬性

• 提供兩種產(chǎn)品形式，一種是探針型，另一種是完整試劑盒，兩種形式均提供試驗(yàn)方案。

• 產(chǎn)品以?xún)龈尚问绞覝剡\(yùn)輸。

• 復(fù)溶后，在-20℃或以下的溫度，可穩(wěn)定保存12個(gè)月。建議分裝儲(chǔ)存，避免多次凍融。

訂購(gòu)信息

請(qǐng)說(shuō)明訂購(gòu)的物種名稱(chēng)（見(jiàn)目錄 成品型），產(chǎn)品種類(lèi)（探針/試劑盒/定制型），產(chǎn)品規(guī)格