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組蛋白ChIP-seq(蛋白-DNA互作研究)


ChIP-seq(Chromatin Immunoprecipitation and high-throughput Sequencing,染色質(zhì)免疫沉淀測序)是將染色質(zhì)免疫共沉淀和高通量測序相結(jié)合,通過組蛋白的特異性抗體,將帶有特定修飾的組蛋白-DNA復合物沉淀下來,從而獲取該組蛋白結(jié)合的DNA。通過DNA高通量測序和分析,獲得該組蛋白在染色體上的分布情況,并鑒定與該組蛋白有相互作用的DNA片段信息


技術(shù)流程:

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我們可為您提供組蛋白ChIP-seq(蛋白-DNA互作研究)技術(shù)服務,歡迎咨詢!

需提供材料交付結(jié)果

細胞:細胞數(shù)量>2*106

新鮮/凍存組織:動物組織500mg,植物組織1g

實驗過程圖

高通量測序數(shù)據(jù)

生物信息學分析結(jié)果







更多技術(shù)服務:

DNA親和純化測序(DAP-seq)

在全基因組水平上鑒定轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點,預測轉(zhuǎn)錄因子潛在的靶基因。

DAP-seq 技術(shù)的出現(xiàn),使轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點的研究不再局限于生物物種,不再受抗體質(zhì)量的限制,進一步拓展并加深了生命科學領域研究的廣度和深度。

DAP-seq與RNA-seq聯(lián)合分析

分析轉(zhuǎn)錄因子的靶基因在RNA-seq數(shù)據(jù)中的表達變化,深入挖掘DAP-seq和RNA-seq測序數(shù)據(jù),增加轉(zhuǎn)錄組測序的分析深度。

凝膠阻滯或電泳遷移率實驗 (EMSA)

鑒定或驗證 DNA 結(jié)合蛋白和 DNA 序列的相互作用。

酵母單雜交技術(shù) (Yeast One-Hybrid)

確定已知 DNA 和蛋白質(zhì)之間是否存在相互作用。

篩選結(jié)合于目標順式作用元件或其他短 DNA 序列的新蛋白。

鑒定蛋白結(jié)合 DNA 的結(jié)構(gòu)域,精準定位與DNA 結(jié)合的蛋白序列。

DNA pull down

鑒定與DNA序列結(jié)合的蛋白質(zhì),該技術(shù)可用于篩選調(diào)控某基因啟動子區(qū)域的潛在轉(zhuǎn)錄因子。

Halo pull down

檢測已知蛋白質(zhì)之間的相互作用,鑒定與已知蛋白相互作用的未知蛋白。

重組蛋白表達

有大腸桿菌、酵母、昆蟲細胞、哺乳動物細胞4種蛋白表達系統(tǒng)可供選擇。


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