蛋白從頭測序和突變分析檢測技術服務詳情介紹

蛋白分子在試劑盒研發(fā)、診斷試劑開發(fā)和藥物研發(fā)中扮演了關鍵的角色。蛋白分子本身的一級結(jié)構(gòu)是發(fā)揮其生物學功能的核心，因此，對蛋白質(zhì)完整序列準確快速的分析有助于未知蛋白質(zhì)的功能研究，并且對包括在內(nèi)的蛋白類藥物研發(fā)生產(chǎn)具有十分重要的意義。傳統(tǒng)的蛋白序列分析技術，無論是基于MALDI-TOF質(zhì)譜儀還是基于nanoLC-MS/MS平臺，在蛋白鑒定過程中都需要借助包含被鑒定蛋白在內(nèi)的序列數(shù)據(jù)庫，再將質(zhì)譜測定的分子量數(shù)據(jù)與數(shù)據(jù)庫理論序列碎裂之后得到的分子量數(shù)據(jù)進行比對，以實現(xiàn)對蛋白質(zhì)的測序和鑒定。 在實際的蛋白序列分析過程中有許多蛋白質(zhì)的信息是不包含在現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫中的，比如一個未被報道過的全新蛋白，或者從一個全新物種中純化出來的蛋白。還有很多情況下，我們能夠得到部分的理論數(shù)據(jù)，但是缺失的那一部分才是關鍵，比如市場上經(jīng)過商業(yè)改造的酶，酶的序列改造信息對于打算進行逆向工程的競爭對手來說是技術壁壘，因為序列變化是多種多樣的（點突變、缺失、插入、替換、修飾、融合等），這樣就存在著成千上萬種可能性，而且通常又沒有任何方向線索可尋；不僅是試劑盒中的某個酶，許多蛋白藥物同樣需要通過突變進行優(yōu)化以增加產(chǎn)量或者穩(wěn)定性；還有很多情況下蛋白序列產(chǎn)生了某些突變，即便是在一個藥物中發(fā)生了很少的序列突變也可能會造成生物活性的改變和產(chǎn)生人體免疫反應，進而造成巨大商業(yè)損失。由上述對未知蛋白質(zhì)序列和突變分析的需求出發(fā)，百泰派克公司基于高分辨率質(zhì)譜儀Obitrap Fusion Lumos，結(jié)合豐富的生物信息學分析經(jīng)驗，建立了全新一代蛋白從頭測序和突變分析（De Novo Sequencing）平臺，實現(xiàn)對蛋白一級結(jié)構(gòu)快速準確的分析。單克隆抗體

蛋白從頭測序和突變分析流程

平臺優(yōu)勢：

1. 蛋白全序列覆蓋（100% Sequence Coverage） 在蛋白質(zhì)序列測定過程中我們會選擇5種不同的蛋白酶進行酶切，利用不同酶切肽段之間的互補性實現(xiàn)蛋白分子100%全序列的拼接。

2. 優(yōu)良的數(shù)據(jù)處理算法 我們基于發(fā)表在Nature Biotechnology和zhuānyè的蛋白組學雜志JPR上的文獻，結(jié)合現(xiàn)有的zhuānyè進行數(shù)據(jù)庫非依賴性的蛋白序列分析的軟件PEAKS Mass Spectrometry Software，開發(fā)了自己的質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)計算方法，采用寬進窄出的原則，在不遺漏任何有效數(shù)據(jù)信息的同時實現(xiàn)了蛋白序列的準確鑒定。

3. 高精度和準確性

我們在測序過程中會使用高分辨率和高靈敏度的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀；與老一代的質(zhì)譜儀（例如Obitrap Elite、Q Exactive等）相比，Lumos在提高了一級二級質(zhì)譜掃描速度的同時保證肽段分子量的準確性；一級質(zhì)譜掃描速度的提高，有助于同一個肽段可以更多次的被鑒定到，提高了結(jié)果的可信性；二級質(zhì)譜掃描速度的提高可以更好的進行片段碎裂（如下圖所示），從而保證結(jié)果的準確性，并可以通過二級碎裂片段的特征峰實現(xiàn)liàngānsuān和異liàngānsuān的準確判定。

4.嚴謹?shù)男蛄蓄A測和嚴格的序列驗證 我們對測序的結(jié)果會首優(yōu)良行序列的預測，同時，我們還會以測定的序列建立新的數(shù)據(jù)庫，采用Sequence Confirmation的模式對采集到的質(zhì)譜數(shù)據(jù)再次進行分析，只有wánquán匹配的結(jié)果我們才會提供給客戶。

應用領域

• 在學術研究中根據(jù)研究論文發(fā)表需要，jīngzhǔn測定未知蛋白或者肽段的序列信息；

• jīngzhǔn測定經(jīng)過商業(yè)化改造的蛋白質(zhì)和酶的序列。許多商業(yè)價值高的蛋白質(zhì)（絕大多數(shù)是酶）的氨基酸序列經(jīng)過特定改造，使蛋白質(zhì)產(chǎn)品比天然蛋白質(zhì)具有更好的特性。由于這些序列改變的蛋白質(zhì)的確切基因序列或氨基酸序列往往是非公開的，而這些蛋白質(zhì)產(chǎn)品卻是容易得到，所以準確測定這類蛋白質(zhì)產(chǎn)品的序列有很大的商業(yè)價值；

• jīngzhǔn測定穩(wěn)定細胞系表達蛋白的序列。在細胞系的構(gòu)建和儲藏中容易發(fā)生突變（也稱為序列差異，sequence variant (SV)，并且有時在一個產(chǎn)品中含量很少的SV也可能會造成生物活性的改變和產(chǎn)生人體免疫反應，進而造成巨大潛在風險。所以，在大規(guī)模生產(chǎn)之前檢測出這種天然的突變及其重要。我們開發(fā)的方法可以檢測低至1個氨基酸的序列差異，而且檢測范圍可以覆蓋整個蛋白/抗體序列。

中/英文項目報告

在技術報告中，百泰派克會為您提供詳細的中英文雙語版技術報告，報告包括： 1. 實驗步驟（中英文） 2. 相關的質(zhì)譜參數(shù)（中英文） 3. 質(zhì)譜圖片 4. 原始數(shù)據(jù) 5. 肽段序列信息 6. 蛋白質(zhì)序列與突變信息

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對蛋白質(zhì)序列進行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務，包括對蛋白質(zhì)的氨基酸組成分析，N端測序，C端測序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白質(zhì)N端序列分析服務。對于未知理論序列的蛋白質(zhì)，提供基于從頭測序法的蛋白質(zhì)從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白質(zhì)組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量蛋白質(zhì)組學、靶向蛋白質(zhì)組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白質(zhì)組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質(zhì)組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種蛋白質(zhì)標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結(jié)果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術優(yōu)良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結(jié)合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從蛋白質(zhì)、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋蛋白質(zhì)組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務!

蛋白從頭測序和突變分析檢測技術服務詳情介紹