當(dāng)提到從各種樣品中提取DNA或RNA，zui快速*的樣品處理辦法就要數(shù)研磨珠高速擊打破碎。無(wú)論研磨均質(zhì)微生物、老鼠組織、植物種子或葉子，還是各種土壤，使用研磨珠都能有效打破細(xì)胞壁和細(xì)胞膜，釋放出DNA、RNA，供下游提取純化。

目前市場(chǎng)上有大量各種類(lèi)型研磨珠供選擇，使用者往往無(wú)從下手。本文總結(jié)歸納了在MoBio實(shí)驗(yàn)室使用的各種研磨珠的特性，以及適合處理的樣品類(lèi)型，供參考。

在之前的文章，根據(jù)RNA提取的特點(diǎn)詳細(xì)地討論了該使用的研磨均質(zhì)條件。今天將全面討論DNA、RNA提取過(guò)程中研磨珠的選擇。

渦旋儀：

通常在渦旋儀上使用研磨珠套管的情況zui多。渦旋儀非常適合用于樣品DNA提取的研磨均質(zhì)。因?yàn)樗鼊?dòng)作相對(duì)緩和，能zui大程度上保持DNA的完整性。

0.15mm石榴石（Garnet）：用于提取微生物純培養(yǎng)的DNA，也適合于菌液的離心沉淀、水過(guò)濾物、尿沉淀，或敗血癥血培養(yǎng)。沙粒樣的石榴石顆粒表面粗糙不平，非常有利于細(xì)胞壁的裂解。但其硬度相對(duì)比較低，在渦旋儀研磨擊打條件下，對(duì)DNA損傷較小。

使用石榴石的試劑盒：我們?cè)?/span>UltraClean® Microbial DNA Kit、PowerFood DNA Kit (0.5 ml tube) 和Bacteremia DNA Kit(2.0 ml tube)上使用此類(lèi)型研磨珠

0.7mm Garnet石榴石（Garnet）：此種研磨珠由各種大小不一、表面粗糙不平、外形各異的鋒利小石塊組成。鋒利而堅(jiān)硬，能有效破碎半固體狀及堅(jiān)硬樣品。

使用0.7mm石榴石的試劑盒：使用渦旋儀破碎

2ml管動(dòng)物組織樣品：UltraClean Tissue and Cells DNA Isolation Kit ；

2ml管土樣樣品：UltraClean Soil、PowerSoil DNA Isolation Kits 及 PowerFecal DNA Isolation Kit,

15ml管：RNA PowerSoil Isolation Kit、 UltraClean Water DNA Isolation Kit

50ml管：PowerMax Soil DNA Isolation Kit.

0.15mm/0.7mm石榴石：Powerwater DNA Isolation Kits 及 RapidWater DNA Isolation Kits的5ml研磨珠套管就使用了這兩款研磨珠混搭。更換成5ml厚壁管意味著不用折疊47mm水樣濾膜就能輕松塞進(jìn)研磨管中。這里提供了更多水樣濾膜的選擇技巧。研磨珠的混搭可以zui大程度地釋放濾膜表面及內(nèi)陷的微生物到研磨管。

0.25mm碳化硅：此款研磨珠均為鋒利的小薄片。薄片碳化硅能高效破壞微生物細(xì)胞，并剪切基因組DNA。通常用來(lái)制備RNA。

使用0.25碳化硅研磨珠的試劑盒：我們使用此研磨珠在UltraClean Microbial RNA Isolation Kit 0.5ml 管中提取微生物RNA；還在Biostic Stabilized Blood RNA Isolation Kit上用于過(guò)柱吸附RNA前對(duì)基因組DNA進(jìn)行破碎。此舉大大減輕了RNA制備的后期處理工作。

渦旋儀或高速研磨機(jī)：

玻璃研磨珠都能用在渦旋儀和高速研磨機(jī)上。而相對(duì)來(lái)說(shuō)，其跟適合于后者。因?yàn)椴Ａе樵诟咚傺心ミ^(guò)程中不會(huì)發(fā)生崩解。

0.1mm 玻璃珠：細(xì)小的玻璃珠直徑只有0.1mm。圓球外形非常堅(jiān)硬，在強(qiáng)大外力作用下依然保持完整。是處理某些類(lèi)型土壤（如：粘土、沉淀物和沙土）的選擇。提取真菌、孢子DNA也能得心應(yīng)手。適合渦旋儀和PowerLyzer使用。

使用0.1mm玻璃珠的試劑盒：我們?cè)?/span>PowerLyzer UltraClean Microbial DNA Isolation Kit 0.5 ml管和 PowerLyzer PowerSoil DNA Isolation Kit 2ml管中使用此研磨珠。更多關(guān)于有效提取粘土DNA的數(shù)據(jù)。

0.5mm 玻璃珠：下一個(gè)要介紹的是0.5mm玻璃研磨珠。其球狀外形及高硬度同樣適合用于高速研磨機(jī)。不過(guò)我們尚未應(yīng)用到試劑盒上。在提取菌類(lèi)DNA及需要輕質(zhì)大個(gè)研磨珠場(chǎng)合上比較適用。我們提供了2ml裝的研磨珠套管。

高速研磨機(jī)上使用的研磨珠套管：

下面的擊中研磨珠直徑較大，適合用于破碎堅(jiān)硬樣品或者RNA的提取。因此，一般的渦旋儀不能滿足所需作用力。

2.38mm 金屬研磨珠套管: 我們實(shí)驗(yàn)室通常用來(lái)提取植物DNA。金屬研磨珠質(zhì)地非常堅(jiān)硬，在一般渦旋儀上可以用來(lái)提取柔軟的植物組織。而對(duì)于大部分植物樣品，在高速研磨機(jī)上使用能釋放出更多DNA。金屬研磨珠很好地應(yīng)用于植物DNA提取的另一個(gè)原因是，植物DNA提取的裂解緩沖液中不含有腐蝕金屬球的離液鹽，不會(huì)導(dǎo)致其銹色。此研磨珠在我們的厚壁管中高外力情況下使用不會(huì)發(fā)生破裂。

使用2.38mm金屬研磨珠套管的試劑盒：PowerPlant DNA Isolation Kit。

1.4mm 陶瓷研磨珠套管：細(xì)小的陶瓷研磨珠提取幼小樣品RNA，有時(shí)比2.8mm研磨珠來(lái)得更有效率。經(jīng)過(guò)試驗(yàn)證明，對(duì)于所有類(lèi)型植物和動(dòng)物組織，2.8mm陶瓷研磨珠是用的。所以我們沒(méi)有把1.4mm陶瓷研磨珠應(yīng)用在試劑盒上。但也不排除客戶有特殊應(yīng)用。市場(chǎng)上商品化名稱(chēng)有時(shí)會(huì)把陶瓷研磨珠稱(chēng)為鋯石。而鋯石就是一種陶瓷材料。

2.8mm陶瓷研磨珠套管：我們把此研磨珠應(yīng)用于幾乎所有PowerLyzer系列的試劑盒上。2.8mm陶瓷研磨珠非常適合于提取各種動(dòng)植物組織RNA。而且在提取RNA必須使用的高離鹽裂解液中不會(huì)生銹或變色。研磨珠已經(jīng)預(yù)裝在厚壁管中。

使用2.8mm陶瓷研磨珠的試劑盒：

PowerLyzer UltraClean Tissue & Cells RNA Kit 和 PowerLyzer UltraClean Plant RNA Kit。

所有的研磨珠套管都可以單獨(dú)購(gòu)買(mǎi)，以便于開(kāi)發(fā)你自己的操作流程和嘗試新的混搭。為了節(jié)省你的經(jīng)費(fèi)，大部分研磨珠都有散裝銷(xiāo)售。厚壁管也可以單獨(dú)購(gòu)買(mǎi)。