Flag標(biāo)簽系統(tǒng)是利用DNA重組技術(shù)將一個短的親水性八肽(DYKDDDDK)融合到目標(biāo)蛋白中，從而形成融合蛋白。Flag標(biāo)簽可位于蛋白質(zhì)的C端或N端，該系統(tǒng)已廣泛應(yīng)用于各種細(xì)胞類型，包括細(xì)菌、酵母和哺乳動物細(xì)胞等。而利用相應(yīng)的Flag標(biāo)簽抗體可對融合蛋白進(jìn)行檢測和純化，并且能夠大大提高目的蛋白的純化效率。

Flag抗體的作用

• 用于融合蛋白的檢測和純化：在抗融合標(biāo)簽的單克隆抗體的參與下，可直接通過酶聯(lián)免疫吸附實驗( ELISA)、免疫印跡（WB）等方法檢測表達(dá)產(chǎn)物的蛋白質(zhì)水平；抗融合標(biāo)簽抗體可進(jìn)行相應(yīng)融合蛋白的純化。在抗體和目的蛋白的特異性結(jié)合條件下，蛋白的親和純化效率會顯著提高。

• 用于尋找相互作用的蛋白質(zhì)：抗標(biāo)簽的抗體在熒光標(biāo)記后可以用于尋找與融合蛋白相互作用的蛋白質(zhì)(包括目的蛋白的配體或受體)；可利用標(biāo)簽抗體沉淀與目的蛋白相互作用的蛋白質(zhì)，并通過進(jìn)一步的分離、純化與鑒定，即可的到與目的蛋白相互作用的蛋白質(zhì)的信息。

• 用于探索蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能：抗標(biāo)簽抗體可以用來研究蛋白質(zhì)分子的功能，特別是用來研究膜受體的功能，因此，在實驗中可以利用抗標(biāo)簽蛋白抗體的交聯(lián)活化受體，代替天然配體來研究受體的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)或功能；將標(biāo)簽插入信號轉(zhuǎn)導(dǎo)分子的特定結(jié)構(gòu)域還可以用來研究分子的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑。