AB SCIEX TripleTOF 6600四極桿飛行時間質(zhì)譜儀：蛋白質(zhì)組學研究的革新平臺

AB SCIEX TripleTOF 6600是一款高性能的四極桿-飛行時間（Q-TOF）液質(zhì)聯(lián)用系統(tǒng)，代表了當前蛋白質(zhì)組學和代謝組學研究的技術。該系統(tǒng)結(jié)合了高分辨率、高質(zhì)量精度和快速掃描速度等優(yōu)勢，特別配備了創(chuàng)新的SWATH 2.0數(shù)據(jù)非依賴采集技術，為大規(guī)模生物標志物發(fā)現(xiàn)和系統(tǒng)生物學研究提供解決方案。

一、核心技術特點

TripleTOF 6600采用三重四極桿-飛行時間串聯(lián)設計，具有質(zhì)量分析能力。其四極桿質(zhì)量范圍為5-2250 amu，飛行時間質(zhì)量范圍擴展至5-40,000 amu，可覆蓋從小分子代謝物到大分子蛋白質(zhì)的廣泛分析需求。系統(tǒng)采用高頻高場飛行管設計，配備15KV加速電壓和40GHz檢測器頻率，在全掃描速度下分辨率可達≥50,000 FWHM（m/z 956），質(zhì)量精度<2.0 ppm（外標法），確保了數(shù)據(jù)的超高準確性和可靠性。

SWATH 2.0采集技術是該系統(tǒng)的核心創(chuàng)新，采用數(shù)據(jù)非依賴采集(DIA)模式，通過可變窗口（2-25Da）將質(zhì)譜全范圍劃分為多個連續(xù)區(qū)間進行全掃描和MS/MS采集。這種方法可實現(xiàn)單次分析定量數(shù)千種蛋白質(zhì)，數(shù)據(jù)完整性媲美傳統(tǒng)的MRM"黃金標準"，而分析能力提高了30倍，研究時間減少90%。瑞士聯(lián)邦理工學院Ruedi Aebersold博士評價道："SWATH技術在大規(guī)模定量分析流程中具有價值，可提供更為精確和完整的生物學信息"。

二、儀器性能優(yōu)勢

TripleTOF 6600在靈敏度和通量方面表現(xiàn)突出：

• 掃描速度：高達200Hz，支持100張MS譜/秒的采集速率，1秒內(nèi)可完成正負離子模式切換

• 動態(tài)范圍：跨越5個數(shù)量級，線性范圍>10?，可同時檢測高豐度和極低豐度化合物

• 靈敏度：ESI MS/MS正離子模式下，1pg柱上樣品的信噪比>40,000:1（m/z 609.2807）

• 離子源配置：支持Turbo V離子源和SelexION+差分離子淌度技術，顯著提升復雜基質(zhì)分析的準確性

系統(tǒng)優(yōu)化了穩(wěn)定性，QJet離子導向系統(tǒng)減少污染風險，連續(xù)運行72小時RSD<3%，滿足高通量需求。創(chuàng)新的全子離子采集定量功能可在軟件中設置質(zhì)量數(shù)范圍可變窗口，1秒內(nèi)將1-2250Da分離為100個區(qū)間并進行二級碎裂采集，通過特定算法歸類碎片離子，實現(xiàn)高分辨全景數(shù)據(jù)定量。

三、應用領域與工作流程

TripleTOF 6600廣泛應用于多個研究領域：

1. 蛋白質(zhì)組學：實現(xiàn)"一針分析"定量數(shù)千種蛋白質(zhì)，支持從發(fā)現(xiàn)到驗證的全流程研究

2. 代謝組學與脂質(zhì)組學：對細胞或組織水平的親水性代謝物進行全面分析，鑒定生物標志物和代謝通路

3. 生物制藥：單克隆抗體表征、宿主細胞蛋白檢測、生物制劑質(zhì)量監(jiān)控

4. 臨床研究：疾病標志物篩查、新生兒遺傳病檢測、激素水平分析

5. 環(huán)境與食品安全：痕量污染物檢測、非法添加劑篩查、毒素和過敏原分析

系統(tǒng)支持納升級超高效液相色譜聯(lián)用（如Eksigent nanoLC 400系列），耐壓高達10,000 psi，流速范圍0.001-5mL/min，適用于高靈敏度納升流速發(fā)現(xiàn)和微升級流速驗證的無縫切換。配合信息依賴采集(IDA)模式，通過高分辨TOF MS預掃描觸發(fā)MS/MS，優(yōu)化碰撞能量誘導碎裂，動態(tài)排除干擾離子，匹配快速分離需求。

四、數(shù)據(jù)管理與分析

TripleTOF 6600配備強大的BioPharmaView和PeakView數(shù)據(jù)分析軟件，支持：

• 分子特征提取：從海量數(shù)據(jù)中自動識別化合物峰

• 化學式計算：基于精確質(zhì)量和同位素比自動推導分子式

• 數(shù)據(jù)庫檢索：批處理檢索含1600種農(nóng)獸藥的標準數(shù)據(jù)庫

• PTM分析：精確定位脫酰胺、氧化、糖基化等翻譯后修飾位點

所有原始數(shù)據(jù)可儲存供后續(xù)深度挖掘，無需重復實驗即可進行新假設驗證。系統(tǒng)提供100%序列覆蓋度的分析能力，如對曲妥珠單抗的全面表征中，單次CESI-MS分析即可獲得重鏈和輕鏈完整氨基酸序列，并鑒定焦谷氨酸環(huán)化、蛋氨酸氧化等關鍵修飾。

隨著精準醫(yī)學和系統(tǒng)生物學的快速發(fā)展，TripleTOF 6600憑借其高通量、高準確性和數(shù)據(jù)完整性，已成為轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究和生物標志物發(fā)現(xiàn)的核心工具，持續(xù)推動著生命科學研究的邊界拓展和技術革新。