活標本需要特殊的考慮，由于他們往往敏感熒光團，并不能防止受到抑制試劑此外漂白。此外，光學顯微鏡必要的低濃度的熒光標記通常會產生一個微弱的信號對比度差。另一個值得關注的是*暴露在激烈的低波長的光照往往限制了細胞和組織活力，顯微鏡因此實驗的長度。一個好的解決方案可聘請高量子效率相機俗利用廣角鏡而不是光電倍增管，體視顯微鏡金相顯微鏡雪崩二極管探測器用于共聚焦和多光子的方法。在這種情況下反卷積技術可以提供zui滿足的成像解決方案。另一個因素是可以限制的檢測是一個受捐助者的化學計量學之間的范圍之外。這一因素可能是一個嚴重的限制，生物顯微鏡在技術的蛋白質蛋白質相互作用，在其中北京金相顯微鏡一個合作伙伴可能是多余的濃度丈量。

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