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利用近端高光譜成像快速篩選光合參數(shù)

時(shí)間:2022-3-1 閱讀:568
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 利用近端高光譜成像快速篩選光合參數(shù)

 

全球氣候變化引起的預(yù)計(jì)人口增長(zhǎng)以及土地和農(nóng)業(yè)資源可利用性的壓力使未來幾十年全球糧食供應(yīng)的需求增加。提高光合作用能力已成為實(shí)現(xiàn)作物增產(chǎn)的目標(biāo)。目前,測(cè)量光合作用的方法是耗時(shí)的且具破壞性的,這會(huì)減慢鑒定具高光合能力的農(nóng)作物種質(zhì)的研究和育種工作。作者在1分鐘內(nèi)收集樣地(~2 2 m)向陽葉片像素的高光譜反射率以量化光合作用參數(shù)和色素含量。在兩個(gè)生長(zhǎng)季節(jié)(2017年和2018年)利用田間生長(zhǎng)的經(jīng)基因改變了光合途徑的煙草,建立了8個(gè)光合參數(shù)和色素性狀的預(yù)測(cè)模型。利用偏最小二乘法(PLSR)分析可見近紅外(400-900 nm)光譜相機(jī)測(cè)得的植物反射像素,預(yù)測(cè)了Rubisco最大羧化速率(Vc,max,R2=0.79)和最大電子傳遞速率(J1800,R2=0.59),最大光飽和光合作用(Pmax,R2=0.54),葉綠素含量(R2=0.87),葉綠素a/b(R2=0.63),碳含量(R2=0.47)和氮含量(R2=0.49)。當(dāng)使用兩臺(tái)400-1800 nm相機(jī)時(shí),模型的預(yù)測(cè)并沒有改善,這表明僅使用一臺(tái)VNIR相機(jī)就能實(shí)現(xiàn)強(qiáng)大,廣泛適用且更具“成本效益”的效果。該分析過程和方法可用于所有作物中,從而提供高通量田間表型篩選,并在田間試驗(yàn)中提高光合性能。


高光譜圖像收集

建立基于地面的表型平臺(tái)(圖1),包括兩個(gè)推掃式高光譜相機(jī)。第一臺(tái)高光譜相機(jī)(PIKA II;Resonon)用于采集400 nm到900 nm的光譜輻射(共240個(gè)光譜帶)。第二臺(tái)高光譜相機(jī)(PIKA NIR;Resonon)用于采集900 nm到1800 nm的光譜輻射(共164個(gè)光譜帶)。

1 基于地面的表型平臺(tái),包括兩個(gè)高光譜相機(jī)和一個(gè)RGB相機(jī)(A),并在冠層頂部安裝了可移動(dòng)的白板(B)。


葉片光譜測(cè)量

利用ASD Fieldspec4光譜儀在400 nm至2500 nm范圍內(nèi)原位測(cè)量葉片光譜反射率。在可見光和近紅外波段(350-1000 nm),光譜分辨率為3 nm,在短波紅外(1000-2500 nm)波段,為8 nm。


利用近端高光譜成像快速篩選光合參數(shù)

2 高光譜圖像分析流程示例。圖像以原始數(shù)據(jù)模式采集,表示為RGB圖像(A)。利用K均值聚類算法(B)進(jìn)行圖像分類,以提取所有陽光照射的葉片的像素,并將數(shù)字原始數(shù)據(jù)(D)轉(zhuǎn)換為反射率(C)。計(jì)算所有陽光照射的葉片反射率像素的平均值和SDE)。

 

結(jié)果

3 性能測(cè)試1,Vc,maxA),J1800B),葉綠素含量和Chl a:bC,CN含量(D),以及性能測(cè)試2,Pmax?CO2E的平均光譜反射率。

4 地塊水平性能測(cè)試1中的Vc,maxA),J1800B),葉綠素含量(C),Chla:bD),C含量(E),N含量(F)以及性能測(cè)試2中的PmaxG)和?CO2H實(shí)際觀測(cè)的與PLSR回歸預(yù)測(cè)的光合參數(shù)的比較(使用單臺(tái)VNIR高光譜相機(jī)(459-900 nm))。

5 地塊水平性能測(cè)試1中的Vc,maxA),J1800B),葉綠素含量(C),Chla:bD),C含量(E),N含量(F)以及性能測(cè)試2中的PmaxG)和?CO2H實(shí)際觀測(cè)的與PLSR回歸預(yù)測(cè)的光合參數(shù)的比較(使用VNIR高光譜相機(jī)(459-900nm)和NIR/SWIR900-1700 nm)相機(jī))。

利用近端高光譜成像快速篩選光合參數(shù)

8 不同光譜范圍PLAR模型的變量投影重要性(VIP)分?jǐn)?shù),葉片水平:Vc,maxA),J1800B),葉綠素含量(C),Chl a:bD),C含量(E),N含量(F,PmaxG)和?CO2H。地塊水平的相同性狀(I-P)。由于地塊水平?CO2參數(shù)預(yù)測(cè)的缺乏,因此未顯示其模型VIP分?jǐn)?shù)。

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