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技術(shù)文章

北方雜合反應(yīng)

閱讀:394          發(fā)布時間:2011-1-18

北方雜合反應(yīng)的步驟主要包括:

    (1) 加入核酸探針,使與固定于尼龍膜上的特定RNA 進行雜合反應(yīng),及
    (2) 待雜合反應(yīng)結(jié)束后以含鹽緩沖液與SDS 洗掉非專一性結(jié)合于尼龍膜上的核酸探針。 進行反應(yīng)時應(yīng)注意下列幾個問題:
    (1) 實驗操作過程仍應(yīng)盡可能避免RNase 的污染;
    (2) 反應(yīng)前應(yīng)先進行雜合前置反應(yīng)(prehybridization),以便減少核酸探針與尼龍膜的間的非專一性結(jié)合反應(yīng);
    (3) 如果所使用的核酸探針是以random priming 或PCR 等方法所制備的雙股DNA 探針,使用前務(wù)必先加熱變性;
    (4) 選用適當(dāng)?shù)膰?yán)苛度 (stringency) 進行雜合反應(yīng)及后續(xù)的轉(zhuǎn)印膜漂洗工作,以便增強雜合反應(yīng)訊息,并減少噪聲,這主要可以從溫度與鹽濃度兩個方面加以考量。
 
    儀器用具:Crosslinker (Stratalinker 1800, Stratagene);塑料盒;平端鑷子;封口機;42℃恒溫槽;60℃恒溫槽
 
    藥品試劑:6×SSC (0.9 M NaCl, 90 mM sodium citrate)尼龍膜;Hybridization solution [formamide, 50% (v/v); 5×SSC; blocking reagent, 2% (w/v);N-lauroylsarcosine, 0.1% (w/v); SDS, 0.02% (w/v)]3MM 濾紙;2×SSC, 0.1% SDS;0.1×SSC, 0.1% SDS
 
    方法步驟:
    1) RNA 轉(zhuǎn)印步驟結(jié)束后,移除電泳膠上的吸水紙與3M 濾紙。
    2) 把尼龍膜連同電泳膠一齊移置于干凈衛(wèi)生紙上,并請小心維持電泳膠與尼龍膜的相對位置。
    3) 以防水筆在尼龍膜上標(biāo)出電泳膠樣本孔的位置,并以剪刀剪掉尼龍膜左上角,以便標(biāo)記電泳膠的左右方位。
    4) 小心地拉開尼龍膜,將的放置于6×SSC (20 mL) 浸泡5 min。
    5) 以平端鑷子夾起尼龍膜,待6×SSC 滴干的后,把尼龍膜平放于衛(wèi)生紙上,風(fēng)干至少30 min。與電泳膠接觸的那一面應(yīng)朝上。
    6) 以Stratalinker 1800 進行uv 連結(jié)反應(yīng)。
    7) 雜合前置反應(yīng):
    a) 將10 mL 雜合溶液注入一個塑料袋。
    b) 把已經(jīng)風(fēng)干的尼龍膜移置于塑料袋內(nèi),小心地把氣泡移除的后,以封口機密封好,再移至42℃恒溫槽進行雜合前置反應(yīng)1~2 h。
    8) 核酸探針變性反應(yīng):
    a) 以微量移液器小心地把PCR 產(chǎn)物移至新的微量離心管。
    b) 將裝著核酸探針的微量離心管放入沸水中加熱10 min。請記得以夾子固定微量離心管的蓋子,以免加熱時蓋子爆開。
    c) 把離心管移入冰浴里靜置3 min。
    d) 瞬間離心后,取出已被變性的核酸探針,加到5 mL 的雜合溶液。
    9) 雜合反應(yīng):
    a) 剪開塑料袋一角,倒出塑料袋內(nèi)雜合前置反應(yīng)所使用的溶液,并加入新配的含有核酸探針的雜合溶液 (8-d)。
    b) 小心移除氣泡,并以封口機密封塑料袋。
    c) 如前節(jié)所述將塑料袋移至42℃恒溫槽,雜合反應(yīng)將進行過夜。
    10) 以含鹽緩沖液與SDS漂洗轉(zhuǎn)印膜 (Northern blot):
    a) 拿出塑料袋,塑料方盒以清水沖洗干凈的后,裝入80 mL [2×SSC, 0.1%SDS]。 剪開塑料袋,把尼龍膜取出放進 [2×SSC, 0.1% SDS],于室溫漂洗2 次,每次5 min。
    b) 續(xù)以100 mL [0.1×SSC, 0.1% SDS] 于60℃洗2 次,每次15 min。溶液需先置于60℃恒溫水槽中預(yù)熱。

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