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辣椒（Capsicum annuum）是一種重要的經(jīng)濟(jì)作物，它在滿(mǎn)足人們口腹之欲的同時(shí)，還是世界上廣為使用的藥物。辣椒富含維生素和營(yíng)養(yǎng)，可以用來(lái)生產(chǎn)許多藥物、天然染色劑和化妝品。
為了更好的理解辣椒屬的進(jìn)化、馴化和特化，四川農(nóng)業(yè)大學(xué)玉米研究所、遵義農(nóng)科院辣椒研究所、華南農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院、華大基因等機(jī)構(gòu)的研究人員對(duì)栽培辣椒及其野生祖先進(jìn)行了基因組測(cè)序。文章于三月三日發(fā)表在美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊PNAS雜志上。
研究人員獲得了3.48Gb的基因組草圖，并對(duì)其中79%的基因進(jìn)行了染色體定位，獲得了高密度的遺傳圖譜。研究顯示，反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座元件的快速擴(kuò)增，使辣椒基因組與其它茄科植物的基因組相比發(fā)生了擴(kuò)張。在辣椒基因組中，約81%都是重復(fù)性序列。
研究人員比較了栽培辣椒Zunla-1 (C. annuum L.)及其野生祖先 Chiltepin (C. annuum var. glabriusculum)的基因組，發(fā)現(xiàn)了人工選擇的分子足跡，找到了一系列候選馴化基因。研究指出，串聯(lián)重復(fù)基因的劑量補(bǔ)償效應(yīng)可能為辣椒賦予了辣味上的多樣性。
這項(xiàng)研究不僅為辣椒基因組和茄科基因組的進(jìn)化研究提供了關(guān)鍵信息，還有助于人們開(kāi)展更有效的辣椒育種項(xiàng)目。(此前，另一個(gè)研究團(tuán)隊(duì)也發(fā)布了辣椒的基因組測(cè)序成果，詳見(jiàn)：Science新聞，辣椒基因組測(cè)序完成)