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技術(shù)文章

體內(nèi)體外表達(dá)

點(diǎn)擊次數(shù):1161 發(fā)布時(shí)間:2015-3-25

作為分子生物學(xué)領(lǐng)域老牌廠家,Promega同樣有很有特色的原核表達(dá)系統(tǒng),不過縱觀Promega近年的表現(xiàn),似乎不滿足于此,而是將目光投向了跨物種間的穿梭表達(dá),以及越來越熱的體外表達(dá)系統(tǒng)了。

蛋白純化,永遠(yuǎn)是蛋白表達(dá)后zui令人關(guān)注的問題。Promega的 PinPoint? Xa 表達(dá)系統(tǒng)則是巧妙利用了生物素作為親和純化的中介――將目的基因克隆到表達(dá)載體上的一段“神秘"多肽的DNA序列后面,這段‘神秘’多肽表達(dá)后在細(xì)胞體內(nèi)會(huì)自然被生物素修飾,所以大腸桿菌表達(dá)出的融合蛋白就是已經(jīng)被生物素標(biāo)記了的融合蛋白――生物素化的融合蛋白可以在直接上親和素純化柱,進(jìn)行高度專一的親和純化,zui后用生物素就可以在非變性條件下洗脫產(chǎn)物――zui后還需要Xa因子蛋白酶切將目標(biāo)蛋白釋放出來。這個(gè)系統(tǒng)利用“神秘"多肽自動(dòng)在體內(nèi)“生物素化",不單方便產(chǎn)物檢測(cè)、親和純化,而且得到的產(chǎn)物很多是可溶的,加上后繼的親和純化條件溫和,有助于得到活性的蛋白質(zhì)。鏈霉親和素堿性磷酸酶可直接通過“簡(jiǎn)化Western"的方法檢測(cè)帶生物素標(biāo)簽的融合蛋白質(zhì)。

這個(gè)系列含有三個(gè)載體,無論你想從哪里插入都有合適的表達(dá)框架。同時(shí)還含有一個(gè)專門作為對(duì)照的control載體。它含有氯素酶轉(zhuǎn)乙?;福–AT)基因,作為監(jiān)控蛋白表達(dá)、純化和加工條件的手段。載體都是利用tac啟動(dòng)子,它由lac啟動(dòng)子的-10區(qū)和trp啟動(dòng)子-35區(qū)融合而成,匯合了lac和trp兩者優(yōu)點(diǎn),是一個(gè)很強(qiáng)的啟動(dòng)子,同樣受LacI阻遏蛋白調(diào)控。產(chǎn)量據(jù)說通??梢赃_(dá)到1―5mg/L。用SoftLink?抗生物素蛋白親和純化樹脂是技術(shù),可將蛋白質(zhì)以非變性形式洗脫出來?;蛘咭部梢岳肨etraLink? 四聯(lián)抗生物素蛋白樹脂對(duì)蛋白進(jìn)行純化。PinPoint 載體的特點(diǎn)是含有編碼內(nèi)源蛋白酶因子Xa(發(fā)音為ten a)的蛋白水解位點(diǎn),使得純化標(biāo)簽可從天然蛋白上分離。載體還帶有方便得多克隆區(qū)域,便于構(gòu)建融合蛋白。整個(gè)表達(dá)系統(tǒng)不過4000人民幣,已經(jīng)包含載體菌株檢測(cè)試劑純化柱和洗脫試劑等等,一如Promega產(chǎn)品的實(shí)惠價(jià)格。

多系統(tǒng)表達(dá),東邊不亮西邊亮

Flexi? 載體系統(tǒng)是一種用于定向克隆蛋白編碼序列的、簡(jiǎn)單而功能強(qiáng)大的方法。它是以兩種稀有的限制性內(nèi)切酶:Sgf I 和 Pme I為基礎(chǔ)。這兩種酶在我們?cè)囼?yàn)常用到的物種:人、大鼠、小鼠、線蟲等中出現(xiàn)頻率都非常小,一般情況都在5%一下。該系統(tǒng)提供快速、有效和保真度高的方法,在多種Flexi? 載體之間轉(zhuǎn)移蛋白編碼區(qū),而無需重新測(cè)序。這一由酶和相關(guān)載體組成的系統(tǒng),使得客戶可以很方便地將設(shè)計(jì)的開放讀碼框架(ORFs)進(jìn)行克隆,并可以根據(jù)不同的應(yīng)用目的而使其在不同種類的載體之間轉(zhuǎn)移。多系統(tǒng)表達(dá)載體除了Promega的這種之外,還有Invitrogen的Gateway技術(shù)和Qiagen的pQE-TriSytem載體。Invitrogen的Gateway技術(shù)有其桿裝病毒和酵母表達(dá)系統(tǒng)的成功顯得底氣十足,但是它有個(gè)麻煩的地方,就是要先做入門載體,之后每次再進(jìn)行位點(diǎn)專一重組轉(zhuǎn)入表達(dá)載體。Qiagen是一個(gè)載體通殺,給它加上大腸桿菌、桿裝病毒和哺乳動(dòng)物的啟動(dòng)子,這么看來Qiagen好像是zui方便的,但是原核和真核的RNA聚合酶識(shí)別序列畢竟是不同的,對(duì)其表達(dá)的效率存在一定質(zhì)疑。

Promega的多系統(tǒng)表達(dá)有個(gè)突出的地方是它不單有普通原核表達(dá)、融合原核表達(dá)、哺乳動(dòng)物表達(dá),它還有體外表達(dá)。從哺乳動(dòng)物細(xì)胞中提取的或通過克隆化DNA在體外轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的mRNA,在無細(xì)胞提取液中能被翻譯而合成蛋白質(zhì),這些蛋白質(zhì)可用于免疫沉淀實(shí)驗(yàn)或進(jìn)行生物活性測(cè)定。一般用來進(jìn)行體外表達(dá)的有兔網(wǎng)織紅細(xì)胞裂解液和麥胚提取物兩種,這里有專門利用麥胚提取物的載體。

Promega不需要構(gòu)建入門載體,你在眾多載體中先選擇一個(gè)zui有希望的就可以先進(jìn)行表達(dá)了。載體的構(gòu)建過程是經(jīng)典的酶切、連接過程,利用Promega提供的酶混合溶液(SgfⅠ和PmeⅠ)在37℃溫育半個(gè)小時(shí),65℃使失活20分鐘。將PCR產(chǎn)物純化后與酶切后的載體室溫連接1小時(shí),可以發(fā)現(xiàn)Promega的酶切和連接相對(duì)傳統(tǒng)的方法需時(shí)較短。由于載體本身在SgfⅠ與PmeⅠ酶切位點(diǎn)之間是一個(gè)致死基因,這樣使得到陽性克隆的幾率大大加大了。但是隨之而來的問題是,這種載體的儲(chǔ)存問題。普通的載體我們可以儲(chǔ)存在大腸桿菌中,不斷復(fù)制,不斷繁殖,一次購買以后可以省下很多錢。但是載體上有致死基因就只能每次都向廠家購買了。

好,現(xiàn)在你把重組質(zhì)粒構(gòu)建成功,轉(zhuǎn)入含有DE3片段的大腸桿菌中,利用IPTG進(jìn)行誘導(dǎo),發(fā)現(xiàn)無法表達(dá),或者表達(dá)后想利用其它載體也進(jìn)行表達(dá)以進(jìn)行比較。那么你可以將外源片段轉(zhuǎn)移到其它載體上,F(xiàn)lexi?系統(tǒng)擁有以下幾個(gè)載體:


         

Flexi? 載體名稱

應(yīng)用

表達(dá)啟動(dòng)子

抗性

融合多肽

大腸桿菌

哺乳動(dòng)物細(xì)胞

體外轉(zhuǎn)錄 / 翻譯

N 末端

pF1A T7 Flexi? Vector

表達(dá)

T7


T7

氨芐青霉素


pF1K T7 Flexi? Vector

表達(dá)

T7


T7

卡那霉素


pFN2A (GST) Flexi? Vector

表達(dá)與純化

T7


T7

氨芐青霉素

GST

pFN2K (GST) Flexi? Vector

表達(dá)與純化

T7


T7

卡那霉素

GST

pF3A WG (BYDV) Flexi? Vector

體外麥芽表達(dá)



T7, SP6

氨芐青霉素


pF3K WG (BYDV) Flexi? Vector

體外麥芽表達(dá)



T7, SP6

卡那霉素


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