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如何從RNA抽提到電泳鑒定
點(diǎn)擊次數(shù):1327 發(fā)布時(shí)間:2016-4-14
RNA抽提
一,準(zhǔn)備工作
1, 實(shí)驗(yàn)器具與材料:
(1) 移液槍?zhuān)?/span>1ml、200ul、10ul
(2) 吸頭:1ml、200ul、20ul
(3) 吸頭臺(tái):放置1ml吸頭的一個(gè),放置200ul和20ul的吸頭一個(gè)
(4) EP管1.5ml、100ul
(5) 玻璃研磨器
(6) 容量瓶:1000ml
(7) 鹽水瓶:100ml
(8) 15ml塑料管一個(gè)(配75%乙醇用)
2, 實(shí)驗(yàn)器具的處理與準(zhǔn)備
(1) 塑料制品:(包括吸頭、EP管等)
將塑料制品逐個(gè)浸泡于1‰DEPC水中(必要時(shí)小槍頭需要用吸管打入DEPC水)37℃,然后送至高壓3次,后在80℃烘烤箱中烘干(或置于37℃中8小時(shí)左右烘干),試驗(yàn)前將槍頭放入吸頭臺(tái)。
(2) 玻璃制品:(主要是玻璃研磨器)
先泡酸,沖洗干凈后,在1‰DEPC水中泡8小時(shí)左右,37℃烘干,用蒙錫紙包裹送至干烤3次。
(3) 金屬制品:(鑷子等)
先洗干凈,再送干烤3次。(不需要泡DEPC水)
3, 試劑配制和準(zhǔn)備:
(1) DEPC水:泡實(shí)驗(yàn)器具的DEPC水的配制:1000ml雙蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml容量瓶中靜置4小時(shí)后備用。配75%乙醇的DEPC水的配制:100ml鹽水瓶?jī)?nèi)裝40ml雙蒸水,加40ulDEPC,37℃,送至高壓。
(2) 75%乙醇(要在抽提時(shí)現(xiàn)配):用無(wú)水乙醇和DEPC水配制(DEPC水:無(wú)水乙醇=1:3),然后放于-20℃?zhèn)溆谩?/span>
(3) 異丙醇:放入棕色瓶
(4) 氯仿:放入棕色瓶
(5) Trizol:100ml/瓶 存放于4℃
二,抽提時(shí)注意事項(xiàng):
全程佩戴一次性手套和口罩,手套要勤換,避免戴上的一次性的手套接觸可疑污染物。
三,抽提步驟
1.勻漿化作用
取約100mg鼠腦組織放于玻璃研磨器內(nèi),先加0.2ml的Trizol溶液,研磨組織后,倒入1.5mlEP管中,再在研磨器內(nèi)加入0.8ml的Trizol溶液洗,后全部再倒入EP管中。顛倒混勻10下,室溫靜置5分鐘。
2.分離階段
每1mlTrizol中加0.2ml氯仿。蓋緊樣品管蓋,用手用力搖晃試管15秒,使其充分混勻,室溫靜置5分鐘。后12000rmp離心15分鐘。
3.RNA的沉淀
將上層水相轉(zhuǎn)入新的1.5mlEP管中(約400-500ul),加入0.5ml異丙醇,混勻后放于-20℃中1小時(shí),后12000rmp離心10分鐘。
4.RNA的洗脫
小心倒掉上清,留取沉淀。加1ml現(xiàn)配的75%的乙醇(預(yù)冷)振蕩洗滌RNA沉淀一次,后7500rmp離心5分鐘。
5.RNA的再溶解
小心倒掉上清,取沉淀置超凈工作臺(tái)開(kāi)風(fēng)機(jī)吹干(約30分鐘,此時(shí)RNA沉淀變透明)。注意不能讓RNA沉淀*干燥(會(huì)極大地降低它地可溶性)。再在管中加20ul的DEPC水溶解,在55-60℃下孵育10分鐘助溶。
6,RNA的保存
提取的RNA保存于-70℃超低溫冰箱中,或立即用于逆轉(zhuǎn)錄。
TRIzol法抽提總RNA細(xì)胞
組織100mg 1×107
↓
加1mlTRIzol
↓細(xì)胞用1ml加樣器吹至液體澄清且無(wú)細(xì)胞團(tuán)塊
勻漿(要*,后轉(zhuǎn)至EP管)
(組織勻漿量>100mg時(shí)分裝1ml/每EP管)
↓
顛倒混勻10下,室溫5分鐘
↓
加氯仿1/5體積(0.2ml)(必須按總體積的1/5)
↓
顛倒混勻15S,室溫5分鐘
↓
4℃,離心12000rmp,15分鐘
↓
轉(zhuǎn)上層水相(約400-500μl)于另一新1.5mlEP管中
↓
加等體積異丙醇(約400 -500μl),混勻后-20℃中1小時(shí)
↓
4℃,離心12000rmp,10分鐘
↓
棄上清
↓
加冰預(yù)冷的75%乙醇(用高壓后的DEPC水配)1ml
↓
4℃離心7500rmp,5分鐘
↓
棄上清,超凈工作臺(tái)開(kāi)風(fēng)機(jī)干燥約30分鐘(不能*干燥)
↓
溶于DEPC水中至20μl(10μl-20μl)
(可在55-60℃水中,<10分鐘助溶)
↓
立即保存于-70℃超低溫冰箱中,或立即用于逆轉(zhuǎn)錄