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熱烈慶賀:上海生科所亮氨酸結(jié)構(gòu)域(LSD)氨基?;途幮9δ?/h3>

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             亮氨酸特異結(jié)構(gòu)域(LSD)是一個緊密有序的結(jié)構(gòu),它參與了多數(shù)亮氨酰-tRNA合成酶(LeuRSs)中保守KMSKS催化環(huán)的定位。然而支原體LeuRSs中四肽GKDG取代了LSD結(jié)構(gòu)域。近日,中科院生物化學(xué)與細胞生物學(xué)研究所王恩多研究組原核生物中亮氨酰-tRNA合成酶(LeuRS)的亮氨酸專一結(jié)構(gòu)域(LSD)參與調(diào)節(jié)酶的編校功能以及對tRNA的識別。相關(guān)研究成果于2013年3月21日發(fā)表在Nucleic Acids Research期刊上。

此外王恩多研究組曾指出了人胞質(zhì)ProX編校誤氨基酰-tRNAPro的機理,并于2013年2月15日發(fā)表生物化學(xué)雜志。

在長期的進化中,氨基酰-tRNA合成酶(aaRS)通過不斷招募新的結(jié)構(gòu)域來保證催化反應(yīng)的效率和專一性。 LSD是LeuRS區(qū)別于其它I類aaRS*的結(jié)構(gòu)域,它鄰近酶的催化活性中心(KMSKS 環(huán))。相比LeuRS中廣泛存在的氨基?;Y(jié)構(gòu)域,編校結(jié)構(gòu)域和tRNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,很多物種如支原體(Mycoplasma),枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)來源的LeuRS中缺失了LSD。序列比對發(fā)現(xiàn)來自運動型支原體 (Mycoplasma ) 的LeuRS(MmLeuRS)僅用GKDG組成的四肽來代替LSD。先前該研究組已報道過MmLeuRS還缺失了LeuRS通常具有的稱為CP1的編校結(jié)構(gòu)域。

博士研究生閆衛(wèi),譚敏博士等利用天然具有LSD的EcLeuRS和缺少LSD的MmLeuRS為研究對象,通過將LSD與GKDG四肽在兩種酶之間的互相替換,發(fā)現(xiàn):盡管LSD對EcLeuRS的氨基酰化功能至關(guān)重要, 但是來自MmLeuRS的GKDG四肽可以功能性地代償EcLeuRS的LSD。反之將EcLeuRS的LSD和CP1同時整合到MmLeuRS中,同樣獲得了高催化活力的嵌合酶,這在一定程度上模擬了LeuRS的進化過程。進一步的研究表明: LeuRS整合LSD后加強了轉(zhuǎn)移后編校功能,其不依賴tRNA的轉(zhuǎn)移前編校功能則被抑制。 LSD還參與對tRNALeu的識別, 其K598殘基可以識別tRNALeu 的可變莖環(huán)的大小和第20位的特定核苷酸。該研究一方面揭示了原核生物中LeuRS的LSD的新功能及作用機制,另一方面增進了人們對LeuRS進化及其分子內(nèi)大結(jié)構(gòu)域間相互作用的認識。同時,該結(jié)果為aaRS和tRNA同進化假說提供了新的實驗證據(jù)。

該項工作得到了國家科技部、國家基金委、中國科學(xué)院和上海市科學(xué)技術(shù)委員會的資助。

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