電轉(zhuǎn)效率低?你可能忽略了這些
最近,總有小伙伴們前來詢問在做完電轉(zhuǎn)實驗后,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)染效率太低了該怎么辦,于是小優(yōu)通過搜集多方資料、詢問技術(shù)專家,為大家找來了一些解決方案,下面我們就來一起看看吧~
一、什么是電轉(zhuǎn)?
俗話說得好,知己知彼,方能百戰(zhàn)百勝,所以首先我們需要清楚電轉(zhuǎn)的原理。電轉(zhuǎn),也稱電穿孔法,是通過脈沖電流在細胞膜上打孔,將外源分子(DNA、RNA 、mRNA等)導(dǎo)入真核細胞內(nèi),來改變細胞的特性,從而達到改造細胞的目的,是實現(xiàn)細胞基因功能和蛋白質(zhì)表達研究的重要工具。與其他細胞轉(zhuǎn)染技術(shù)相比,電轉(zhuǎn)具有操作簡便、適用多種細胞、重復(fù)性好和轉(zhuǎn)染效率高等優(yōu)點。
二、影響電轉(zhuǎn)效率的因素有哪些呢?
影響電轉(zhuǎn)效率的因素有很多,總結(jié)下來有三方面:電轉(zhuǎn)過程、細胞狀態(tài)以及轉(zhuǎn)染底物狀態(tài)。只有了解影響電轉(zhuǎn)效率的因素有哪些,我們才能夠“對癥下藥"。
1.電轉(zhuǎn)過程
1)電轉(zhuǎn)的完整操作步驟包括電轉(zhuǎn)前操作,電轉(zhuǎn)執(zhí)行和電轉(zhuǎn)后培養(yǎng)。在進行電轉(zhuǎn)前操作時,電轉(zhuǎn)試劑、細胞與轉(zhuǎn)染底物要進行混勻,如果混勻時過于激烈,會破壞轉(zhuǎn)染復(fù)合物的形成,從而導(dǎo)致轉(zhuǎn)染效率降低;
2)在進行電轉(zhuǎn)前操作時,電擊緩沖液的選擇也很重要,由于細胞對緩沖液的離子組成和滲透壓非常敏感,因此組分與細胞質(zhì)類似的緩沖液有利于細胞電擊后的存活;
3)電轉(zhuǎn)執(zhí)行時,需要控制電場強度和脈沖時間。適當提高電場強度或延長脈沖時間,能使底物更容易進入細胞,但細胞的死亡率也會增加。一般電場強度設(shè)置遵循低電場長時程的原則。如果選擇內(nèi)置優(yōu)化程序的電轉(zhuǎn)系統(tǒng),如Lonza的Nucleofector系統(tǒng),則可以節(jié)省摸索電場強度和脈沖時間的步驟。
4)轉(zhuǎn)染培養(yǎng)基中含有抗生素會影響細胞轉(zhuǎn)染效率,這是因為轉(zhuǎn)染試劑對細胞有損傷,這時培養(yǎng)基中的抗生素會進一步損傷細胞,因此我們建議使用不含抗生素的培養(yǎng)基或PBS;
5)電轉(zhuǎn)后培養(yǎng)要注意,如果使用傳統(tǒng)轉(zhuǎn)染試劑,轉(zhuǎn)染后4-6h后必須進行換液,否則會由于轉(zhuǎn)染試劑毒性而引起細胞死亡,最終影響轉(zhuǎn)染效率。
2.細胞狀態(tài)
1)細胞污染對細胞狀態(tài)的影響很大,受到細菌、真菌或支原體污染的細胞都會導(dǎo)致轉(zhuǎn)染效率降低、細胞死亡率增加,尤其是支原體污染悄無聲息,因此一定要做好定期的支原體檢測,確保細胞狀態(tài);
2)細胞培養(yǎng)到不同密度都能用于電轉(zhuǎn),但好的轉(zhuǎn)化效率是在細胞的對數(shù)生長期(15代以內(nèi),傳代后2d)。當細胞處于對數(shù)生長期時,有絲分裂較旺盛,表面結(jié)構(gòu)密度比穩(wěn)定期的細胞差,電轉(zhuǎn)后,細胞膜的恢復(fù)能力強,而且處于有絲分裂期的細胞更容易接受外源DNA。
3.轉(zhuǎn)染底物狀態(tài)
1)不同的轉(zhuǎn)染底物對轉(zhuǎn)染效率都會產(chǎn)生不同的影響,例如質(zhì)粒DNA在大小、用量以及構(gòu)象這三方面都影響著電轉(zhuǎn)效率,IRES導(dǎo)致轉(zhuǎn)染效率低,轉(zhuǎn)染mRNA需要調(diào)整洗滌次數(shù)等等;
2)轉(zhuǎn)染試劑與底物的配比,也會影響轉(zhuǎn)染效率,因此需要根據(jù)說明書或參考文獻來進行配比優(yōu)化實驗,選用最佳配比濃度;
3)底物的內(nèi)毒素,也會影響轉(zhuǎn)染效率,內(nèi)毒素含量過高,會導(dǎo)致轉(zhuǎn)染過程中細胞狀態(tài)變差,從而增加細胞死亡率,降低轉(zhuǎn)染效率,因此要對內(nèi)毒素進行控制。
三、如何提高電轉(zhuǎn)效率?
我們都知道,電轉(zhuǎn)的操作是需要借助儀器來完成的,因此除了要考慮上面的這些因素外,更重要的是選擇一個高效的電轉(zhuǎn)儀。Nucleofector™技術(shù)是Lonza公司的zhuan利創(chuàng)新技術(shù),利用電擊在細胞膜上開個小孔,綜合各種特定細胞轉(zhuǎn)染程序與轉(zhuǎn)染液的作用,核酸底物不僅可以進入細胞質(zhì),還可直接通過核膜進入細胞核。相較于傳統(tǒng)電轉(zhuǎn)技術(shù),Nucleofector™技術(shù)的細胞轉(zhuǎn)染率可達99%,且實現(xiàn)轉(zhuǎn)染不依賴于細胞的分裂。
01 Nucleofector™技術(shù)核心:核電轉(zhuǎn)
利用特定的轉(zhuǎn)染試劑和細胞保護劑,通過細微差別的電脈沖,使得轉(zhuǎn)染物質(zhì)不僅可以直接進入細胞質(zhì),而且可以直接通過核膜進入到細胞核。
注:圖片來自Lonza
02 Nucleofector™技術(shù)組成
1)Nucleofector™設(shè)備:內(nèi)置針對每種細胞優(yōu)化好的轉(zhuǎn)染參數(shù)。
2)配套試劑盒:試劑盒是包含有轉(zhuǎn)染試劑,細胞保護劑,專用電極杯,吸管、pmaxGFP™陽性質(zhì)粒。
3)數(shù)據(jù)庫與操作手冊:幾百種細胞的詳細的優(yōu)化方案,不僅有轉(zhuǎn)染步驟,也包含了核轉(zhuǎn)染前后細胞的處理,如細胞來源、傳代、生長條件、培養(yǎng)基以及轉(zhuǎn)染后培養(yǎng)等細節(jié)技巧。
03 提高電轉(zhuǎn)效率的方法
1.細胞收集時:
1)在消化貼壁細胞時,一定要注意終止胰酶反應(yīng),防止過度消化;最好使用專業(yè)的胰酶中和劑;
2)在進行細胞離心時,使用低轉(zhuǎn)速長時間離心,提升細胞的存活率;
3)選擇合適狀態(tài)的細胞,一般原代細胞可以傳1-2次后使用;盡量挑選迭代次數(shù)少的細胞,如果是凍存細胞,建議復(fù)蘇1-2h后使用;
4)選擇對數(shù)增長期的細胞;
5)做好支原體清除。
2.試劑添加:
1)電轉(zhuǎn)試劑的添加只需室溫操作即可;
2)細胞在試劑中停留不超20min,混合好盡快開始實驗;
3)轉(zhuǎn)染的底物占比不能大于總體積的10%,比如轉(zhuǎn)染體系100ul,底物最多添加10ul;
4)在消化的細胞進行配置時,一定要離心并wan全去除殘留培養(yǎng)基;
5)在加入到電極杯中時,要避免產(chǎn)生氣泡,從而影響電脈沖;
6)對底物進行內(nèi)毒素控制;
7)轉(zhuǎn)染試劑與底物濃度配比控制;
8)如果是mRNA轉(zhuǎn)染,可多洗滌2次。
3.程序設(shè)置:
1)使用Lonza電轉(zhuǎn)儀,程序已經(jīng)設(shè)定好,可以根據(jù)不同的細胞名稱,選擇對應(yīng)的優(yōu)程序; 根據(jù)實際情況,可以對程序進行微調(diào),確保轉(zhuǎn)染效率和細胞存活率。
2)使用需要自行設(shè)置的儀器,一般電場強度設(shè)置遵循低電場、長時程的原則。
4.細胞重懸:
1)轉(zhuǎn)染結(jié)束之后,可以先停留10min再加培養(yǎng)基重懸;
2)使用無鈣培養(yǎng)基重懸,5-10min后轉(zhuǎn)移細胞到培養(yǎng)皿上;
3)后續(xù)的實驗一般在轉(zhuǎn)染后24h再進行;
4)電轉(zhuǎn)后的細胞,鋪板數(shù)量翻一倍。
5.轉(zhuǎn)染后細胞的培養(yǎng):選擇表達高峰期細胞做實驗,推薦文獻可在Lonza查詢。
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