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高效的雙特異性抗體開發(fā)丨瑞孚迪的生物藥制備流程解決方案案例分享

2024-7-10  閱讀(206)

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抗體工程的最新進(jìn)展開啟了免疫治療的新篇章,導(dǎo)致了具有穩(wěn)定性、特異性和治療潛力的雙特異性抗體(bsAb) 的開發(fā)。由于工程化雙抗擁有兩個不同的抗原結(jié)合臂,致使雙抗的的生產(chǎn)變成了一個復(fù)雜且具有挑戰(zhàn)性的過程。具體挑戰(zhàn)包括:正確的鏈配對、同源二聚體污染、產(chǎn)量、正確的蛋白質(zhì)折疊和翻譯后修飾。以抗體設(shè)計為主導(dǎo)的解決方案和創(chuàng)新工藝技術(shù)的結(jié)合使得克服其中許多挑戰(zhàn)成為可能,雙抗生產(chǎn)的復(fù)雜過程需要強(qiáng)大且可靠的表達(dá)平臺,包括:

 

表達(dá)載體:

理想表達(dá)載體將目標(biāo)分子所有鏈以高比例進(jìn)行基因組整合和表達(dá)。盡管多表達(dá)盒載體可以提供便利,但將雙特異性抗體的每一半引入單獨(dú)的載體中,微調(diào)它們各自的表達(dá)水平亦可實(shí)現(xiàn)配對。

細(xì)胞系:

工程化雙特異性抗體的表達(dá)需要強(qiáng)大的宿主細(xì)胞系,廣泛使用的為中國倉鼠卵巢細(xì)胞CHO,因為它不僅需要有效的鏈配對,還需要正確的翻譯后修飾、折疊和分泌。

早期質(zhì)量篩選:

細(xì)胞池和克隆篩選過程中的早期質(zhì)量分析有助于評估鏈配對效率、折疊模式和潛在的聚集風(fēng)險。

工藝優(yōu)化:

即使使用優(yōu)化的細(xì)胞系和載體,同源二聚化仍然是雙特異性生產(chǎn)的潛在障礙。通過優(yōu)化細(xì)胞培養(yǎng)過程和純化策略,提高所需分子的產(chǎn)量。

 

瑞孚迪(Revvity)的CHOSOURCE™蛋白表達(dá)平臺可以幫助實(shí)現(xiàn)高效雙特異性抗體的生產(chǎn)(圖1)。這一全面的解決方案匯集了強(qiáng)大的CHOSOURCE平臺上谷氨酰胺合成酶敲除 (GS KO) 的CHO細(xì)胞和ADCC+宿主細(xì)胞系轉(zhuǎn)座子載體技術(shù),用于目標(biāo)分子完整高效的基因組整合,顯著優(yōu)化細(xì)胞系開發(fā) (CLD) 流程,提升雙抗的表達(dá)和配對。此外,瑞孚迪的微流控毛細(xì)管電泳分析系統(tǒng)LabChip®GXII Touch™實(shí)現(xiàn)了快速的蛋白關(guān)鍵質(zhì)量屬性分析(純度,糖型,電荷異構(gòu)性等),將質(zhì)量分析納入生物治療工作流程早期,從而顯著提高細(xì)胞株構(gòu)建 (CLD) 效率和質(zhì)量控制。

 

 

 

圖1:CHOSOURCE蛋白平臺和CHOSOURCE 轉(zhuǎn)座子技術(shù). 轉(zhuǎn)座子技術(shù)是一個由轉(zhuǎn)座子載體和轉(zhuǎn)座酶mRNA組成的雙組分系統(tǒng)。轉(zhuǎn)座子載體本身含2個表達(dá)盒。目標(biāo)基因(GOIs)克隆至載體后,轉(zhuǎn)座酶通過識別載體上的末端反向重復(fù)序列(TIR),將含有GOIs(包括GS選擇盒)的序列整合到宿主細(xì)胞基因組中,實(shí)現(xiàn)目標(biāo)基因的高效完整整合。

 

 

 

實(shí)驗設(shè)計

 

 

 

不對稱4鏈雙特異性抗體,由兩條輕鏈(LC1和LC2)和兩條重鏈(HC1和HC2)組成,采用knobs-into-holes結(jié)構(gòu)(圖2)。CHOSOURCE 轉(zhuǎn)座子技術(shù)由雙表達(dá)盒轉(zhuǎn)座子載體和轉(zhuǎn)座酶兩部分組成,因4鏈分子的表達(dá)需要2個載體,通過四條序列在2個載體上的不同配組得到8種載體和組合(圖3),兩載體間以1:1比例同轉(zhuǎn)座酶mRNA共轉(zhuǎn)染至GS KO CHO宿主細(xì)胞中。

 

 

 

圖2:使用CHOSOURCE 轉(zhuǎn)座子技術(shù)表達(dá)具有knobs-into-holes Fc區(qū)域的不對稱4-鏈雙特異性抗體[A]。正確的異二聚體抗體[A]會與一些不正確的鏈組合和自由鏈[B]共同表達(dá),雜質(zhì)種類復(fù)雜。

 

 

 

 

 

Vector1:MCS1-HC1,MCS2-LC1;Vector2:MCS1-HC2,MCS2-LC2

 

Vector1:MCS1-HC1,MCS2-LC1;Vector2:MCS1-LC2,MCS2-HC2

 

Vector1:MCS1-LC1,MCS2-HC1;Vector2:MCS1-HC2,MCS2-LC2

 

Vector1:MCS1-LC1,MCS2-HC1;Vector2:MCS1-LC2,MCS2-HC2

 

Vector1:MCS1-HC1,MCS2-LC2;Vector2:MCS1-HC2,MCS2-LC1

 

Vector1:MCS1-HC1,MCS2-LC2;Vector2:MCS1-LC1,MCS2-HC2

 

Vector1:MCS1-LC2,MCS2-HC1;Vector2:MCS1-HC2,MCS2-LC1

 

Vector1:MCS1-LC2,MCS2-HC1;Vector2:MCS1-LC1,MCS2-HC2

 

 

 

圖3:使用 CHOSOURCE 載體表達(dá)4鏈雙特異性抗體,兩個轉(zhuǎn)座子載體與轉(zhuǎn)座酶mRNA共轉(zhuǎn)染GS KO的CHO 細(xì)胞。圖示本測試中構(gòu)建的8個不同的載體,8種不同轉(zhuǎn)染組合下的各載體的配組情況。

 

 

 

實(shí)驗結(jié)果

 

 

 

 

細(xì)胞池篩選恢復(fù)和整合拷貝數(shù)分析

 

轉(zhuǎn)染后無需選擇劑甲硫氨酸亞砜亞胺(MSX),6個組合的細(xì)胞池在8~13天完成篩選恢復(fù),2個恢復(fù)慢的組合在16天達(dá)到培養(yǎng)階段(圖4)?;謴?fù)時間的差距表明每個載體內(nèi)的抗體鏈位置對細(xì)胞池的選擇恢復(fù)有影響,這可能是由于不同位置的抗體鏈的表達(dá)水平不同。

 

 

 

圖4:共轉(zhuǎn)染后細(xì)胞池的選擇恢復(fù)概況。圖(A)代表活細(xì)胞密度,圖(B)代表活力百分比。誤差線代表兩個獨(dú)立轉(zhuǎn)染細(xì)胞池的標(biāo)準(zhǔn)偏差。

 

評估每個細(xì)胞池中載體的整合情況(圖5),我們發(fā)現(xiàn)同一表達(dá)載體中的HC和LC及GS基因以1:1:1的比例整合到每個細(xì)胞池中。例如,在共轉(zhuǎn)染條件3中,載體1中LC1和HC1確定的拷貝數(shù)均為15,載體2中HC2和LC2確定的拷貝數(shù)為11,它們組合起來與觀察到的GS基因的26個拷貝相匹配。8個pool中GS 基因拷貝數(shù)基本等于兩個重鏈或輕鏈的所在載體拷貝數(shù)之和,同以往的實(shí)驗結(jié)果相一致,說明了轉(zhuǎn)座酶介導(dǎo)完整的轉(zhuǎn)座。

 

 

 

圖5:目標(biāo)基因拷貝數(shù)插入情況。篩選恢復(fù)后每個共轉(zhuǎn)染組合條件下細(xì)胞池中四條目標(biāo)抗體序列(LC1、HC1、LC2、HC2)和篩選基因GS的插入拷貝數(shù)檢測 (ddPCR方法,每個樣本三次重復(fù))。

 

由于兩載體以1:1的比例共轉(zhuǎn)染,預(yù)計每個庫中會整合相同數(shù)量的四個鏈拷貝。結(jié)果顯示:共轉(zhuǎn)染條件4、7和8下,所有四個鏈的數(shù)量幾乎相等;在其他條件下,并非以1:1的比例進(jìn)行。例如,在共轉(zhuǎn)染條件1中,含有“knobs”HC (HC2) 的載體比含有“holes”HC (HC1) 的載體整合更少的拷貝數(shù)(大約一半)。這可能是由于較高的“旋鈕”HC整合可能會導(dǎo)致“旋鈕-旋鈕”同二聚體的產(chǎn)生增加,這些二聚體會導(dǎo)致細(xì)胞死亡。

 

 

細(xì)胞池生產(chǎn)力和質(zhì)量評估

 

恢復(fù)后的8組測試細(xì)胞池經(jīng)14天的未優(yōu)化的fed-batch培養(yǎng),初步評估哪個組合配置產(chǎn)能有優(yōu)勢。雙抗的產(chǎn)量數(shù)據(jù)顯示:具有相似拷貝數(shù)的六個共轉(zhuǎn)染池的抗體產(chǎn)量在相同范圍內(nèi),并且高于1g/L,而其余兩個池拷貝數(shù)最少,產(chǎn)量也較低(圖6)。“LC1HC1_HC2LC2”(共轉(zhuǎn)染條件3)配置具有最高數(shù)量的整合拷貝,產(chǎn)生了最高的總體抗體滴度。

 

 

 

圖6:八個共轉(zhuǎn)染細(xì)胞池的雙抗生產(chǎn)力初步評估(14天fed-batch培養(yǎng))。

 

使用微流控毛細(xì)管電泳LabChip GXII Touch HT系統(tǒng),利用ProteinEXact試劑盒進(jìn)行八組載體配置下純化抗體的非還原和還原電泳分析,并與參考雙特異性抗體進(jìn)行比較(圖7,圖8)。微流控毛細(xì)管電泳技術(shù)可以可以根據(jù)蛋白質(zhì)的大小,高效分離非還原樣品的不同構(gòu)象,如異二聚體、同二聚體、糖基化和非糖基化變體以及游離鏈等,對于分析還原樣品,可以實(shí)現(xiàn)單個抗體鏈的鑒定和定量。

 

比較八個載體配置下蛋白電泳圖譜發(fā)現(xiàn)(圖7),雖然“LC1HC1_HC2LC2”(共轉(zhuǎn)染條件3)具有最高的抗體滴度,但表達(dá)的抗體譜與參考分子不同。共轉(zhuǎn)染生成該池的兩個載體內(nèi)兩條重鏈和輕鏈的前后位置導(dǎo)致LC2鏈表達(dá)減少,這可能妨礙了分子的正確組裝。結(jié)合還原蛋白電泳圖譜,“LC2HC1_LC1HC2”(共轉(zhuǎn)染條件8)顯示出更多優(yōu)勢,不僅峰型與對照分子相近,四個抗體鏈的存在比例與參考分子的比例也非常相似。

 

 

 

圖7:LabChip GXII Touch HT系統(tǒng)評估8個配組組合及參考雙抗的非還原和還原狀態(tài)下蛋白的μCE-SDS情況。非還原蛋白樣品的電泳圖譜如[A]所示。還原蛋白樣品的電泳圖譜見[B]圖,條形圖代表各條鏈的濃度百分比(%)。

 

細(xì)致分析“LC2HC1_LC1HC2”(共轉(zhuǎn)染條件8)產(chǎn)生的抗體異構(gòu)體與參比分子的異同(圖8),雖然其表達(dá)滴度比條件3稍低(1.2g/Lvs1.4g/L),但構(gòu)象正確率達(dá)到94%。產(chǎn)量和質(zhì)量評估對于確定細(xì)胞系開發(fā)流程中最佳細(xì)胞池同樣重要。

 

 

 

圖8:對于LC2HC1_LC1HC2(共轉(zhuǎn)染條件8)樣本抗體,微流控毛細(xì)管電泳中的各個峰相對于參考雙抗分子的細(xì)分分析。[A,B]非還原蛋白質(zhì)的各峰比較,[C,D]還原蛋白的各峰比較。

 

本研究只是測定了兩種載體以1:1的共轉(zhuǎn)染比例產(chǎn)生的正確抗體構(gòu)型的情況,由于雙特異性抗體的基因組整合和表達(dá)的動力學(xué)的復(fù)雜性,兩個載體還可以嘗試以不同的比例共轉(zhuǎn)染以產(chǎn)生更佳的正確的異二聚體配置。

 

結(jié)論

在這項工作中,我們使用CHOSOURCE 轉(zhuǎn)座子載體技術(shù)表達(dá)不對稱4鏈雙特異性抗體。獲得高表達(dá)且正確的異二聚體構(gòu)象是雙抗生產(chǎn)的目標(biāo)。CHOSOURCE 轉(zhuǎn)座子技術(shù)雙盒載體提供了調(diào)節(jié)雙特異性抗體不同鏈表達(dá)的靈活性。這不僅可以通過測試兩個載體不同比例的共轉(zhuǎn)染來實(shí)現(xiàn),還可以通過測試不同的鏈位置來實(shí)現(xiàn)。CHOSOURCE 轉(zhuǎn)座子技術(shù)搭載GS KO細(xì)胞系,能夠在轉(zhuǎn)染后約6周內(nèi)評估細(xì)胞池階段的蛋白質(zhì)質(zhì)量,鑒于轉(zhuǎn)座子帶來的完整高效整合,有助于高效實(shí)現(xiàn)CLD的開發(fā)。

 

雙特異性抗體分子設(shè)計的進(jìn)步,例如knobs-into-holes結(jié)構(gòu),顯著減少了錯配和同源二聚體污染。然而,“孔-孔”同二聚體和共純化的游離鏈仍然存在挑戰(zhàn),故在細(xì)胞系開發(fā)過程的早期納入質(zhì)量分析變得很關(guān)鍵。瑞孚迪的微流控毛細(xì)管電泳LabChip GXII Touch HT系統(tǒng)可用于進(jìn)一步提高生物制劑開發(fā)的速度。在本研究中,LabChip GXII Touch HT系統(tǒng)可以快速檢測細(xì)胞池表達(dá)的抗體表征。將非還原和還原的抗體圖譜與參考分子進(jìn)行直接比較,能夠在細(xì)胞系開發(fā)時及早識別最佳的細(xì)胞池。

 

總之,瑞孚迪的CHOSOURCE表達(dá)平臺和LabChip GXII Touch HT系統(tǒng)的強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)手,可以大程度的簡化和加速復(fù)雜分子的細(xì)胞系開發(fā)過程,促進(jìn)生物治療藥物的開發(fā)和進(jìn)步。

 

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