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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)( PCR)技術(shù)循環(huán)檢測(cè)方法

閱讀:63          發(fā)布時(shí)間:2025-7-15

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction, PCR)是一種用于擴(kuò)增特定DNA片段的分子生物學(xué)技術(shù)。其核心原理是模擬生物體內(nèi)的DNA復(fù)制過(guò)程,通過(guò)特定的引物、DNA聚合酶和dNTPs(脫氧核糖核苷酸)來(lái)實(shí)現(xiàn)目標(biāo)DNA序列的指數(shù)級(jí)擴(kuò)增。

PCR技術(shù)的實(shí)現(xiàn)依賴(lài)于三個(gè)關(guān)鍵步驟的循環(huán)進(jìn)行:

一、變性(Denaturation):在高溫(通常90-96℃)下,雙鏈DNA模板中的氫鍵斷裂,導(dǎo)致雙鏈分開(kāi)為兩條單鏈。這是擴(kuò)增過(guò)程中的第一步,也是將模板DNA變成單鏈狀態(tài)的過(guò)程。

二、退火(Annealing):溫度降低(通常50-65℃)后,引物與單鏈DNA模板上互補(bǔ)的序列結(jié)合。引物是短的DNA序列,設(shè)計(jì)用于與目標(biāo)DNA片段的兩端特定區(qū)域互補(bǔ),從而引導(dǎo)后續(xù)的合成過(guò)程

三、延伸(Extension):在中溫(通常72℃左右)下,Taq DNA聚合酶(一種耐熱DNA聚合酶)作用于引物-模板復(fù)合物,沿著模板DNA合成新的互補(bǔ)鏈。這個(gè)過(guò)程中,dNTPs被聚合到引物的3'端,形成新的DNA鏈,直至達(dá)到模板的末端。

這三個(gè)步驟組成一個(gè)循環(huán),每完成一個(gè)循環(huán),目標(biāo)DNA片段的數(shù)量理論上增加一倍。通過(guò)25-35個(gè)循環(huán),可以將目標(biāo)DNA序列擴(kuò)增至數(shù)百萬(wàn)倍,從而達(dá)到可以檢測(cè)的水平。

 

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PCR技術(shù)的檢測(cè)方法主要依賴(lài)于擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè),傳統(tǒng)的PCR通常通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳來(lái)檢測(cè)產(chǎn)物。隨著技術(shù)的發(fā)展,出現(xiàn)了實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)和數(shù)字PCR(Digital PCR, dPCR)等更為先進(jìn)的檢測(cè)方法。

一、傳統(tǒng)PCR檢測(cè):

瓊脂糖凝膠電泳:擴(kuò)增后的DNA片段通過(guò)電泳分離,根據(jù)其大小在凝膠上形成條帶,通過(guò)觀(guān)察條帶的出現(xiàn)與否來(lái)判斷擴(kuò)增是否成功。

二、實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR):

熒光染料法:使用SYBR Green I等染料,其能嵌入雙鏈DNA中并在熒光下發(fā)光,隨著PCR循環(huán)的進(jìn)行,熒光信號(hào)逐漸增強(qiáng),通過(guò)檢測(cè)熒光強(qiáng)度來(lái)定量目標(biāo)DNA。

探針?lè)ǎ?/span>采用TaqMan探針等熒光標(biāo)記探針,探針與目標(biāo)序列結(jié)合后被DNA聚合酶酶切,報(bào)告基團(tuán)與淬滅基團(tuán)分離,釋放熒光信號(hào),通過(guò)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)熒光信號(hào)的變化來(lái)定量目標(biāo)DNA。

三、數(shù)字PCR(dPCR):

油包水液滴式數(shù)字PCR(ddPCR):將樣本分成數(shù)萬(wàn)個(gè)獨(dú)立的微滴(液滴),每個(gè)微滴中包含少量的DNA模板。通過(guò)PCR擴(kuò)增后,檢測(cè)每個(gè)微滴中的熒光信號(hào),陽(yáng)性信號(hào)表示微滴中含有目標(biāo)DNA,陰性信號(hào)則表示沒(méi)有。通過(guò)泊松分布計(jì)算,最終獲得目標(biāo)DNA的絕對(duì)定量結(jié)果。

數(shù)字PCR技術(shù)由于其不依賴(lài)標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)、操作簡(jiǎn)單、靈敏度高(±10% copies/μL)和適合低豐度目標(biāo)檢測(cè)等優(yōu)勢(shì),已成為一種非常有潛力的核酸定量技術(shù)。與傳統(tǒng)qPCR相比,它在低拷貝數(shù)目標(biāo)檢測(cè)、拷貝數(shù)變異分析、稀有突變檢測(cè)等領(lǐng)域展現(xiàn)出有的優(yōu)勢(shì)。

 

 


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