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昆山伯利克精密儀器有限公司

基因合成儀原理

時(shí)間:2022-8-9 閱讀:1555
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  1、sanger法:雙脫氧測(cè)序的原理,DNA合成時(shí)加上一個(gè)ddNTP從而終止這條鏈的延伸,毛細(xì)管電泳讀取分析序列。一般教材講的都是這種方法,經(jīng)典,讀長(zhǎng)800bp,但是通量小成本高。
 
  2、高通量測(cè)序方法:454也稱焦磷酸測(cè)序,一個(gè)run下來(lái)約400M的數(shù)據(jù)量。將emulsionPCR產(chǎn)物連磁珠上,放入Pico Titer Plate,測(cè)序反應(yīng)是通過(guò)釋放PPi經(jīng)過(guò)ATP硫酸化酶和熒光素酶作用發(fā)光,CCD捕捉拍照,反應(yīng)是連續(xù)的,所以遇到連續(xù)的堿基如polyA時(shí),454易產(chǎn)生誤差。
 
  3、Solexa:邊合成邊測(cè)序,將DNA單鏈固定在芯片上,合成DNA簇,是一種可逆阻斷的合成反應(yīng),每個(gè)循環(huán)只加上一個(gè)堿基、系統(tǒng)拍照一次。通過(guò)讀取拍照信號(hào)分析序列,一個(gè)run約200個(gè)G數(shù)據(jù)量以上。目前能量最高,不足是讀長(zhǎng)短,現(xiàn)在有PE150,可以測(cè)通300bp。
 
  4、Ion torrent:特點(diǎn)是小巧。試劑通過(guò)集成的流體通路進(jìn)入芯片中,密布于芯片上的反應(yīng)孔立即成為上百萬(wàn)個(gè)微反應(yīng)體系。這種流體體系、微體系機(jī)械設(shè)計(jì)和半導(dǎo)體的技術(shù)組合,使研究人員能夠在2小時(shí)內(nèi)獲取從10Mb到1Gb以上的高精確度序列。*新一種,還沒(méi)廣泛應(yīng)用。

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