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技術文章

狐貍源性成分探針法熒光定量PCR試劑盒?通用原則

閱讀:1000          發(fā)布時間:2022-3-17

狐貍源性成分探針法熒光定量PCR試劑盒通用原則:


1, 先選擇好探針,然后設計引物使其盡可能的靠近于探針。


2, 擴增子的長度應不超過400bp,理想的*能在100-150bp內(nèi),擴增片斷約短,有效的擴增反應就越容易獲得。較短的擴增片斷也容易保證分析的一致性


3, 保持GC含量在20%和80%之間,GC富含區(qū)容易產(chǎn)生非特異反應,從而會導致擴增效率的降低,及在SG分析中非特異信號。


4, 為了保證效率和重復性,應避免重復的核苷酸序列,尤其是G(不能有4個連續(xù)的G)


5, 將引物和探針互相進行配對檢測,以避免二聚體和發(fā)卡結(jié)構(gòu)的形成。


b),探針設計指導


1,在設計引物之前設計探針


2,探針的Tm值應在68-70℃之間,如果是目測探針,則要仔細審查GC富含區(qū)。


3,探針的5’端要避免有鳥氨酸,5’G會有淬滅作用,即使被切割下來這種淬滅作用也還會存在


4,選擇C多于G的鏈作探針,G的含量多于C會降低反應效率,這時就應選擇配對的另一條鏈作為探針。


6, 探針應盡可能的短,不要超過30個bp。


7, 檢測探針的DNA折疊和二級結(jié)構(gòu)。

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