計算機輔助藥物設(shè)計-藥物虛擬篩選-昊然科研新方向

昊然生物科研新方向：計算機輔助藥物設(shè)計，包括藥物發(fā)現(xiàn)、藥物靶點預(yù)測、藥物靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)、先導(dǎo)化合物篩選、藥物設(shè)計服務(wù)、靶標(biāo)預(yù)測服務(wù)、藥物虛擬篩選、藥物/小分子定制合成、化合物結(jié)構(gòu)優(yōu)化、活性/藥物篩選、虛擬新藥篩選服務(wù)。昊然生物小編分享藥物虛擬篩選一起來看：

虛擬篩選(virtual screening，vs)是指基于藥物設(shè)計理論，借助計算機的技術(shù)和專業(yè)應(yīng)用軟件，從大量化合物中挑選出一些有苗頭的化合物，進行實驗活性評價的一種方法，其目的是從幾十個乃至百萬個分子中篩選出新的先導(dǎo)化合物。

從原理上來講，虛擬篩選可以分為兩類，即基于受體( Receptor-based virtual screening )的虛擬篩選和基于配體(ligand-based virtual screening)的虛擬篩選。

基于配體的虛擬篩選：

藥效團模型( pharmacophore modeling )、定量構(gòu)效關(guān)系(quantitative structure activity relationship ,QSAR)、結(jié)構(gòu)相似性方法（ structual similarity, SSIM)。

基于受體的虛擬篩選也稱為基于結(jié)構(gòu)的虛擬篩選，利用分子對接技術(shù)，基于受體的三維結(jié)構(gòu)，在結(jié)合位點處自動的匹配化合物數(shù)據(jù)庫中的小分子，然后對可能的結(jié)合模式運用基于分子力場的打分函數(shù)進行結(jié)合能計算，終得到化合物能量排名。

在新藥發(fā)現(xiàn)過程中,虛擬篩選的應(yīng)用可以富集活性化合物,降低篩選成本,提高藥物篩選的可行性,因此已成為新藥發(fā)現(xiàn)的重要方法。虛擬篩選與生物活性篩選的結(jié)合,可以優(yōu)勢互補,有效地促進新藥的發(fā)現(xiàn)。

計算機輔助藥物設(shè)計相關(guān)內(nèi)容：

藥物發(fā)現(xiàn)

藥物靶點預(yù)測

藥物靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)

先導(dǎo)化合物篩選

藥物設(shè)計服務(wù)

靶標(biāo)預(yù)測服務(wù)

藥物虛擬篩選

藥物/小分子定制合成

化合物結(jié)構(gòu)優(yōu)化

活性/藥物篩選

虛擬新藥篩選服務(wù)

昊然生物僅用于科研，RL2023.4