GMP潔凈區(qū)對微生物的要求比高，與普通場所消毒不同，潔凈區(qū)需使用“滅菌劑"來嚴格控制沉降菌和浮游菌。
滅菌劑是一種用于消毒要求較高能殺滅包括細菌芽孢、真菌孢子在內(nèi)的各種微生物的化學(xué)高效消毒劑。在制藥工業(yè)和科學(xué)實驗室使用的滅菌劑也常成為“殺孢子劑"，即能快速殺滅高抗性微生物體—芽孢和霉菌孢子的藥劑。
目前國際上常用的滅菌劑有兩種類型，一種是復(fù)合型過氧乙酸（過氧乙酸和過氧化氫復(fù)合，另外一種是復(fù)合型過氧化氫 （過氧化氫和銀離子）典型代表為德國Oxytech，屬于基本無腐蝕的生態(tài)型滅菌劑）。

兩者都對霉菌和霉菌孢子有極為理想的殺滅效果，兩者的區(qū)別是主要是過氧化氫銀離子是無色無味無毒的，基本無腐蝕，但價格成本高一些；復(fù)合過氧乙酸的成本稍低一些，但過氧乙酸本身具有較大的毒性和刺激性，對金屬等材料的腐蝕性很大。