菌種培養(yǎng)是一些小型絲狀真菌的統(tǒng)稱，并不是分類學(xué)名詞，在分類學(xué)上分別屬于藻狀菌綱、子囊菌綱與半知菌類。霉菌菌體均是由分支或不分支的菌絲構(gòu)成的，許多菌絲交織在一起稱為菌絲體。霉菌的菌絲依據(jù)其形態(tài)構(gòu)造可分為無隔菌絲和有隔菌絲；依據(jù)其功能可分為營養(yǎng)菌絲、氣生菌絲和繁殖菌絲；霉菌的繁殖主要靠形成各種各樣無性或有性孢子來完成。菌絲體的形態(tài)特征及抱子的形成方式與形態(tài)特征是霉菌分類與鑒定的重要依據(jù)。
觀察霉菌時，若用水做介質(zhì)制備其鏡檢標(biāo)本片，菌絲常因滲透作用而膨脹、變形，且孢子在水中容易分散，難以保持其自然著生狀態(tài)。此外，由于水分蒸發(fā)快，也不適于進(jìn)行長時間觀察。采用乳酸苯酚混合液制備霉菌鏡檢標(biāo)本，可使菌絲透明、柔軟、不變形、不易折斷、不易干燥、能保持較長時間。
觀察菌種培養(yǎng)的方法很多，常用的有直接取菌壓片觀察法、載片培養(yǎng)觀察法玻璃紙透析培養(yǎng)觀察法及瓊脂槽培養(yǎng)觀察法等。直接取菌壓片觀察法具有簡便、快速、不需特殊培養(yǎng)的優(yōu)點(diǎn)，但挑取菌絲時，由于菌絲受外力作用而不能保持原有著生狀態(tài)。對于產(chǎn)生小而易碎孢子頭的霉菌（如青霉、曲霉、木霉等），制備較完整而又清楚的載片標(biāo)本有一定困難，采用載片培養(yǎng)觀察法可克服這一難點(diǎn)。載片培養(yǎng)又稱小室培養(yǎng)，是把微生物接種在載玻片中央的小塊培養(yǎng)基上，然后蓋上一蓋玻片，讓微生物在兩玻片之間的狹窄空間中進(jìn)行生長發(fā)育，于是可得到一個微生物朝著接近水平面生長的自然生長狀態(tài)的標(biāo)本，便于在顯微鏡下觀察。為得到清晰、完整、保持自然生長狀態(tài)的霉菌形態(tài)標(biāo)本，還可以采用玻璃紙透析培養(yǎng)法，此法是利用玻璃紙的半透膜特性及透光性。將玻璃紙覆蓋在瓊脂培養(yǎng)基表面，培養(yǎng)基中的營養(yǎng)成分可通過滲透作用透過玻璃紙，所以微生物在玻璃紙上能夠生長。剪取小片玻璃紙貼在載玻片上用顯微鏡觀察。可以取得與載片培養(yǎng)觀察法同樣的效果。瓊脂槽培養(yǎng)觀察法是在已凝固的瓊脂平板上挖兩條小槽，把霉菌的抱子或菌絲接種在槽內(nèi)，然后將無菌蓋玻片插于槽內(nèi)或蓋在槽上，將此平板置于合適的溫度下，菌種培養(yǎng)培養(yǎng)過程中隨時觀察或培養(yǎng)后直接置于顯微鏡下觀察，也可小心地將蓋玻片取下放在顯微鏡下觀察。