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即用型熒光PCR試劑盒使用手冊

來源:上??道噬锟萍加邢薰?nbsp;  2017年10月16日 17:17  

即用型熒光PCR試劑盒

Instant Fluorescent PCR Kit

產(chǎn)品及特點

本產(chǎn)品是基于熒光染料檢測的即用型PCR試劑盒,可以對基因組DNA靶序列和RNA反轉(zhuǎn)錄后cDNA靶序列進行實時定量PCR分析(quantitative PCR、qPCR)。本產(chǎn)品含有經(jīng)過優(yōu)化的緩沖液組分、優(yōu)化的Taq DNA聚合酶、dNTPs、MgCl2、SYBR Green I和穩(wěn)定劑等成分。本產(chǎn)品中優(yōu)化的Taq DNA Polymerase高溫加熱前,抗Taq 單克隆抗體與Taq結(jié)合,抑制Taq聚合酶活性,從而抑制在低溫條件下出現(xiàn)的由引物和模板DNA之間的非特異性雜交或引物二聚體引起的非特異性擴增。而且抗體在PCR反應(yīng)的預變性步驟中*失活,不會阻礙之后Taq DNA聚合酶的活性,大大提高了 PCR 反應(yīng)的靈敏度及特異性。

  • 方便,用戶只需準備模板和引物既可以進行實時定量PCR實驗HRM(High Resolution DNA Melt Curve Analysis)分析而基于SYBR Green I和LC Green染料的qPCR mix則不能同時用于上述兩種實驗。
  • 使用抗Taq抗體封閉的優(yōu)化的Taq DNA聚合酶,可抑制低溫條件下的非特異性擴增。
  • 使用第三代飽和型熒光染料,信號強,不會抑制PCR反應(yīng)。
  • 快捷,即用型的預配液使加樣操作步驟大大簡化,避免了交叉污染,降低實驗誤差。
  • 各成分的濃度和比例都經(jīng)過精心優(yōu)化反應(yīng)的靈敏度高,特異性強。能檢測到濃度為50拷貝/mL的靶分子。

規(guī)格及成分

成 份

編 號

1 mL包裝

6 mL包裝

qPCR MagicMix,2×

90408

1 mL

6 mL

使用手冊

1份

 

運輸及保存

低溫運輸,-20℃保存, 保存期限為6個月。

自備試劑

DNA模板、引物、超純水

使用方法

  • 20 uL的qPCR反應(yīng)體系為例在一干凈的PCR管中,加入下列成分

反應(yīng)體系成分

20 uL體系

終濃度

qPCR MagicMix,2×

10 uL

自備引物一a

x uL

0.1-0.5 uM

自備引物二a

x uL

0.1-0.5 uM

自備模板a

x uL

 

自備ROXb

2 uL

(可以不加)

超純

20 uL

 

放入熒光PCR儀中進行擴增, 并在退火或延長步驟中記錄熒光信號。

注意:

  • 通常引物濃度以0.2 μM可得到較好結(jié)果,可以終濃度0.1-1.0 μM作為設(shè)定范圍的參考;通常DNA模板的量以10-100 ng基因組DNA或1-10 ng cDNA為參照,因不同物種的模板中含有的目的基因拷貝數(shù)不同,可對模板進行梯度稀釋,以確定*的模板使用量。
  • ROX 校正染料:如果使用ABI公司的7500,7700和7900三種型號的熒光PCR儀器,則需用自備的ROX進行Ct值校正。對ABI 7700和7900,ROX的*濃度為1×(即在每20 uL 反應(yīng)體系中加2 uL 10×ROX)。對ABI 7500, ROX的*濃度為0.05-0.1×(每20 uL 反應(yīng)體系加0.1-0.2 uL 10×ROX;也可將10×ROX稀釋到1×,然后每個反應(yīng)體系加入1-2 uL 1×ROX)。ROX會在溶解曲線中產(chǎn)生噪音,因此,如果出現(xiàn)了雜峰,將軟件中“Passive Reference Dye”中的“ROX”選項取消打勾,然后重新分析數(shù)據(jù)。

對于iCycler IQ,MJ Opticon,MJ Chromo4,MX3000,MX4000, RotorGene3000,RotorGene 6000  LightCycler 480等型號的熒光PCR儀器,ROX不是必須的,但加入的話也不會影響整個PCR分析。

  • 循環(huán)步驟:根據(jù)擴增子的性質(zhì)和儀器性能,從以下三個過程中任選一個進行擴增。

A:兩步快速循環(huán)法:適用于引物Tm值設(shè)計為60℃的反應(yīng)

循環(huán)步驟

溫度

時間

循環(huán)數(shù)

酶活化

95℃

10 min

1

變性

退火&延伸

95℃

60℃

15 s

1 min

35-40

注意:本產(chǎn)品所采用的熱啟動酶須在預變性95℃、10 min條件下實現(xiàn)酶的活化。退火溫度請以60-64℃作為設(shè)定范圍的參考,發(fā)生非特異性反應(yīng)時,可提高退火溫度。

B:三步快速循環(huán)法:適用于延伸步驟溫度高于退火步驟的PCR(長引物PCR)

循環(huán)步驟

溫度

時間

循環(huán)數(shù)

酶活化

95℃

10 min

1

變性

退火

延伸

95℃

56-64℃d

72℃e

10 s*

30 s

32 s

35-40

注意:

  • 退火溫度:建議采用兩步法PCR,退火溫度60℃進行反應(yīng)。若提高反應(yīng)特異性,可提高退火溫度,以60-64℃作為設(shè)定范圍的參考。若因使用Tm值較低的引物等原 因,得不到良好的實驗結(jié)果時,可嘗試進行三步法PCR擴增,三步法的退火溫度請以56℃-64℃的范圍作為設(shè)定參考。延伸溫度:延伸溫度設(shè)為72℃通??梢蕴岣邤U增效率。但是,對于AT含量大于70%的擴增子來說,延伸溫度設(shè)為60℃為宜。

C:通用循環(huán)法:這種循環(huán)方法適用于幾乎所有的熒光PCR儀,也適用于用快速循環(huán)法不能擴增的模版。

循環(huán)步驟

溫度

時間

循環(huán)數(shù)

酶活化

95℃

10 min

1

變性

退火&延伸

95℃

60℃

15 s

60 s

35-40

 

  • 數(shù)據(jù)采集

具體操作按所用儀器推薦的流程進行。本產(chǎn)品中所含的熒光染料在沒結(jié)合DNA時,zui大吸收光譜在471nm,結(jié)合DNA時的zui大吸收光譜在500nm,zui大發(fā)射光譜在530nm。

 

其他注意事項:

  • 如果使用iCycler,可以不加入FAM。
  • 如果使用Roche LightCycler的玻璃毛細管進行PCR,需加入終濃度為0.5mg/mL的自備BSA。

關(guān)聯(lián)產(chǎn)品

即用型PCR2.0、PCR級綠如藍染料

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