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TRIzol伴侶使用手冊(cè)

來(lái)源:上??道噬锟萍加邢薰?nbsp;  2017年10月16日 17:19  

TRIzol伴侶

TRIzol-Mate

產(chǎn)品及特點(diǎn)

TRIzol是美國(guó)Invitrogen公司的、用于總RNA提?。ㄖ饕莿?dòng)物總 RNA提取)的產(chǎn)品,具有廣大的客戶群。但其缺點(diǎn)之一是一直沒(méi)有柱式 升級(jí)產(chǎn),使用既費(fèi)點(diǎn)不能用于 富含為解問(wèn)出本產(chǎn),點(diǎn)是:跟TRIzol結(jié)合使用,把經(jīng)典操作變成了柱式操作,簡(jiǎn)化了實(shí)驗(yàn)流程,用戶可 以節(jié)約 30 分鐘的時(shí)間。其他特點(diǎn)如下:

  • RNA質(zhì)量更好,因?yàn)椴僮骱?jiǎn)短減少了 RNA 在提取過(guò)程中的降解。
  • RNA純度更高,OD260/OD280 一般在 1.9 以上,比經(jīng)典 TRIzol 法得到的更純。
  • 專門(mén)的洗滌條件能有效去除基因組 DNA,進(jìn)一步減少其對(duì) RNA 的污染。
  • 適用于其他基于酸酚/ 異硫氰酸胍提取原理的RNA提取產(chǎn)品, 包括TRIzol、TRIzol LS、TRI Reagent 等。
  • 可以避免果稍)。

規(guī)格及成分

成份

編號(hào)

大紙盒包裝

柱式動(dòng)物RNAout溶液B

71201B

50 mL

硅膠膜離心吸附柱

60911

50套

通用洗柱液

60408

50 mL

RNA洗脫液

71207

10 mL

使用手冊(cè)

81027sc

1份

 

運(yùn)輸及保存

常溫運(yùn)存,有效期年。

自備試劑

TRIzol  TRIzol 同類產(chǎn)品、氯

使用方法

  •  TRIzol 的使用手冊(cè)進(jìn)行總 RNA 提取到加氯之前一步。
  • 如果需要加氯,則繼續(xù)按TRIzol的使用手冊(cè)操作,用氯處理裂解液離心后得到上清液。如果省略氯處理步驟,則需要將裂解物直接離心。
  • 將經(jīng)過(guò)氯處理得到的上清液或沒(méi)有經(jīng)過(guò)氯處理直接離心得到的裂解液轉(zhuǎn)個(gè)干凈 1.5 mL 。如果經(jīng)過(guò),則離心后,下層有機(jī)相和中間層將含有DNA和蛋白質(zhì),避免觸及,否則將產(chǎn)質(zhì) DNA 。險(xiǎn)見(jiàn)100 μL取。同時(shí)吸取上清時(shí)緩慢進(jìn)行,否則容易吸出交界面的不可見(jiàn)的絲狀DNA。
  • 加入等體積的柱式動(dòng)物RNAout溶液B,顛倒混勻 30 秒。
  • 根據(jù)混合物的多少,一次或分兩次轉(zhuǎn)移到離心吸附柱中。
  • 每次轉(zhuǎn)移后,需要13000-15000 g室溫離心半分鐘,棄收集管中的穿透液。
  • 加0.7 mL通用洗柱液到離心吸附柱中,室溫離心半分鐘,棄收集管中的穿透液。一次洗滌一般足夠去除雜質(zhì)。但如果樣品OD260/280比值不高,可以再用0.3 mL通用洗柱液重復(fù)此步一次。
  • 室溫離心半分鐘。此步對(duì)去除殘留通用洗柱液十分重要,否則殘留的通用洗柱液會(huì)影響RNA的質(zhì)量和使用。
  • 將離心吸附柱轉(zhuǎn)移到一自備的RNase-free收集管中,加入50-100 μL RNA洗脫液。
  • 室溫離心半分鐘,離心管中溶液即為RNA樣品,可以立即使用或存放于-80℃待用。
  • RNA完整性的電泳檢測(cè):如果需要做Northern雜交,強(qiáng)烈建議用戶使用甲醛變性膠進(jìn)行RNA電泳,因?yàn)榉亲冃阅z不能分離所有的RNA分子(BioTechniques,28:414,2000)。
  • RNA產(chǎn)量產(chǎn)率測(cè)定:將5-10 μL RNA溶于TE緩沖液中(pH 7.5-8.2 之間)檢測(cè)其在OD260的光吸收。通過(guò)光吸收可以得出RNA濃度(1 OD260的RNA=40 μg/mL),進(jìn)而計(jì)算出RNA的產(chǎn)量(濃度 X 體積)和產(chǎn)率(RNA產(chǎn)量/組織用量)。
  • RNA純度測(cè)定:無(wú)污染的總RNA的OD260/OD280一般在1.8-2.1 之間(具體數(shù)值與其堿基組成和溶液成分等多種因素有關(guān)),高于此范圍則分別表示樣品可能有蛋白質(zhì)污染,但一般不影響RT-PCR等反應(yīng)。

疑難解答

Q:上樣孔里的紅色熒光物一定是DNA污染嗎?

A:不是。用TAE或TBE電泳液和非變性膠電泳RNA時(shí)容易產(chǎn)生此現(xiàn)象,天澤基因初步研究發(fā)現(xiàn)大部分紅色熒光物是變性不充分的單鏈RNA通過(guò)堿基互補(bǔ)或通過(guò)硼酸絡(luò)合(如果使用TBE作電泳液的話)形成的復(fù)合物,加RNase處理后,這些紅色熒光物(RNA)一般會(huì)消失。為避免此現(xiàn)象,建議使用甲醛變性膠電泳和RNA上樣液(如天澤基因的 RNAon)。

Q:如何確認(rèn)和去處除污染的基因組DNA?

A:如果懷疑有DNA污染,可以用RNase處理RNA樣品,然后再電泳。如果上樣孔里的紅色熒光物不消失,則表示是基因組DNA污染。進(jìn)一步確認(rèn)可以使用PCR擴(kuò)增法。去除污染的DNA可以使用天澤基因的非酶的 DNA去除劑DNA Erasol或RNase-free DNase,由于RNase-free DNase一般都有殘留的RNase污染,所以必須嚴(yán)格按照廠家提供的手冊(cè)進(jìn)行操作。

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