PicoPLEX WGA Kit 單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒技術(shù)原理
介紹
胚胎植入前遺傳學(xué)篩查(PGS)可利用微陣列方法或NGS來開展,目前IVF機(jī)構(gòu)zui常用的是微陣列比較基因組雜交(array CGH)。
植入前基因篩查和診斷(PGS,PGD)是指體外受精(IVF)過程中所做的胚胎或卵母細(xì)胞測試,以便選擇沒有染色體變異和家族遺傳病等位基因的胚胎,提高懷孕成功率,減少特定遺傳病的傳遞風(fēng)險(xiǎn)。微陣列分析是IVF機(jī)構(gòu)zui常用的PGS技術(shù),這類試劑盒有好幾種都嵌合了PicoPLEX技術(shù),被廣泛使用。包括Illumina’s 24Sure 微陣列, Perkin Elmer’s KaryoLite BoBs developed for PGS和 Oxford Gene Technology’s CytoSure™ 微陣列。不過實(shí)驗(yàn)室研究的趨向是使用低覆蓋度(low pass)的新一代測序(NGS)替代微陣列,PicoPLEX DNA-seq正好滿足這種需求。
應(yīng)用PicoPLEX的PGS技術(shù):吸取單個(gè)胚胎細(xì)胞——細(xì)胞裂解,DNA擴(kuò)增(Rubicon PicoPLEX WGA Kit單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒)——微陣列基因組雜交——染色體拷貝數(shù)變異分析
詳細(xì):
首先從受精卵吸取一個(gè)極體或者從受精后第三天的5到10個(gè)胚胎細(xì)胞吸取單細(xì)胞。裂解細(xì)胞后,釋放出來的DNA進(jìn)行擴(kuò)增,所得產(chǎn)物標(biāo)記后與含有目標(biāo)基因組的微陣列雜交。分析軟件會(huì)識(shí)別出拷貝數(shù)變異。PicoPLEX全基因組擴(kuò)增技術(shù)具有高穩(wěn)定性和可再現(xiàn)性,已經(jīng)成為PGS的標(biāo)準(zhǔn)擴(kuò)增技術(shù)。這一技術(shù)也適用任何單細(xì)胞樣品和皮克級(jí)純化DNA的基因特征分析。
PicoPLEX單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增技術(shù)
包括文庫構(gòu)建和文庫擴(kuò)增兩個(gè)步驟。文庫構(gòu)建(預(yù)擴(kuò)增)階段,設(shè)計(jì)的特殊引物能消除引物之間的雜交,從而提高引物和模板的配對(duì)效率。利用特殊隨機(jī)引物(Quasi-random primer)引發(fā)線性擴(kuò)增進(jìn)行全基因組擴(kuò)增。特別設(shè)計(jì)的隨機(jī)引物(參見US patent 8,206,913)能減少引物二聚體的形成,從而提高引物和模板的配對(duì)效率。
PicoPLEX相比于以往的PCR、MDA、MALBC為基礎(chǔ)的單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增技術(shù),操作簡單快速。
PicoPLEX單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增技術(shù)
分兩次擴(kuò)增。*次擴(kuò)增,特殊隨機(jī)引物與基因組DNA結(jié)合,形成莖環(huán)形結(jié)構(gòu)文庫,第二次擴(kuò)增,只有莖環(huán)形結(jié)構(gòu)的文庫被擴(kuò)增。
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RB3050 Rubicon PicoPLEX WGA Kit 單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒
PicoPLEX WGA Kit采用技術(shù),設(shè)計(jì)優(yōu)化用于從單細(xì)胞中擴(kuò)增全基因組DNA。起始樣本量低至單細(xì)胞或6pg基因組DNA。便捷的單管操作流程降低污染節(jié)省時(shí)間。結(jié)果穩(wěn)定性、重復(fù)性好。
PicoPLEX WGA Kit適用array CGH分析和PCR平臺(tái)。PicoPLEX技術(shù)被IVF供應(yīng)商如BlueGnome信賴并用于PGS,BlueGnome CGH也是中國福利會(huì)和平婦幼保健院所用的PGS平臺(tái)。
產(chǎn)品訂購信息
貨號(hào) | 產(chǎn)品名稱 | 包裝 |
RB3050/R30050 | PicoPLEX WGA Kit單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒,array CGH、PCR分析用 | 50次反應(yīng) |
RB3381/R300381 | PicoPLEX DNA-seq Kit,48種雙端illumina引物 | 48 |
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