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膜蛋白研究的整體解決方案

來源:上海雅吉生物科技有限公司   2018年08月30日 09:32  

提起膜蛋白,浮現(xiàn)在廣大從事蛋白研究的科研工作者腦海中的是兩點:1.膜蛋白功能的重要性。2.膜蛋白研究的困難性。

*,膜蛋白在細胞間接觸、表面識別、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、酶活性和運輸方面都扮演著重要的角色。由于它們功能多樣,也就成為理想的藥物靶點。然而,膜蛋白的生化和結(jié)構(gòu)研究一直都很緩慢。Protein Database的統(tǒng)計數(shù)據(jù)表明,在成功解析出三維結(jié)構(gòu)的蛋白中,膜蛋白只占1%,這與膜蛋白占總蛋白的1/3的總量的差別巨大。由此也可以看出膜蛋白研究確實困難重重。

 

圖 1. 利用QIAgenes優(yōu)化序列,昆蟲細胞體外進行膜蛋白表達。
利用 EasyXpress Insect Kit II,crude lysates (T), supernatant (S), and pellet fraction (P) by SDS-PAGE and western blotting using Penta·His antibodies. Note that microsomes with integrated membrane proteins are visualized in the pellet fraction (P) after centrifugation of the reaction.

由于膜蛋白的過表達可能對細胞有毒性,并且在純化時很難選擇合適的溶解試劑,再加上目前對膜蛋白晶體培養(yǎng)缺少有效方法和模型,所以要想順利地獲得膜蛋白的三維數(shù)據(jù)更是難上加難。幸虧技術(shù)總在進步,創(chuàng)新的產(chǎn)品也不斷涌現(xiàn)。QIAGEN在2009年推出了膜蛋白的整體解決方案:QIAgenes Expression Kit-解決膜蛋白表達難題;Ni-NTA membrane Kit-率純化重組膜蛋白;NeXtal Cubic Phase Kit-輕松獲得膜蛋白晶體不再是夢想。

QIAgenes Expression Kit預(yù)制蛋白表達載體,可以幫你克服蛋白(包括膜蛋白)表達的難題。該預(yù)制表達載體采用先進的GeneOptimizer軟件,對DNA序列進行以下方面的優(yōu)化:稀有密碼子,GC含量,ARG位點,可變剪切點,mRNA二級結(jié)構(gòu)等因素進行優(yōu)化,確保優(yōu)化后的序列能在E.coli的體內(nèi),體外,真核細胞的體內(nèi)或體外,以及哺乳動物細胞中進行表達。

成功表達了膜蛋白,接下來的挑戰(zhàn)就是怎么分離出表達的膜蛋白。與可溶性蛋白不同,膜蛋白具有單重或多重跨膜結(jié)構(gòu)容易發(fā)生聚集,導(dǎo)致膜蛋白很難溶解。目前常用的方法就是去污劑進行膜蛋白的溶解。去污劑同時具有疏水和親水區(qū)域,和膜蛋白可以形成膜蛋白-去污劑的復(fù)合物,從而可以進行進一步的純化。但是這里必須要指出的是,由于膜蛋白的種類不同,適合其溶解的去污劑類型也不一樣,這就需要在溶解膜蛋白是篩選一系列的去污劑以獲得佳的溶解效果。為了從事膜蛋白研究工作者的寶貴時間,QIAGEN推出了Ni-NTA Membrane Protein Kit,專門用于帶有His標(biāo)簽的重組膜蛋白的溶解和后續(xù)純化。

Ni-NTA Membrane Protein Kit有兩部分組成,一部分是膜蛋白的溶解試劑,該部分包括7種常用的去污劑,用于供客戶篩選適合自己的去污劑;另一部分是Ni-NTA純化試劑,用于在膜蛋白溶解用,利用His標(biāo)簽和Ni-NTA的親和特性進行進一步純化。該試劑盒大的優(yōu)勢在于幫助膜蛋白研究者在短的時間篩選得到優(yōu)的去污劑,并且進行Ni-NTA純化獲得純度高的膜蛋白。


圖 2. 利用QIAGEN Ni-NTA membrane Kit篩選適合NhaA 的去污劑類型。
實驗結(jié)果表明,OG和NG不適合該膜蛋白的溶解,可以選擇DM, LDA0, DDM Cy6, 和FOS 進行NhaA溶解. M: His-tagged marker proteins。


圖 3.  選擇DDM進行NhaA的溶解,然后利用Ni-NTA進行純化。
TP: total protein; SF: soluble fraction; FT: flow-through fraction; W: wash fraction; E: eluate; M: markers.

在成功的純化得到膜蛋白后,如果想獲得膜蛋白的三維結(jié)構(gòu),又要面臨一個難題。據(jù)Protein DataBase 的統(tǒng)計數(shù)據(jù)表明,在成功解析出結(jié)構(gòu)的蛋白中,膜蛋白只占了1%左右的比重。由此也可以看出,膜蛋白缺乏缺乏有效的結(jié)晶方法。目前常用脂立方相法建立膜蛋白的結(jié)晶實驗。但是該方法存在以下局限性:1.步驟超多,建立實驗過程非常復(fù)雜2.容易造成結(jié)晶孔間的交叉污染3.不適合高通量實驗4.浪費膜蛋白。為了使膜蛋白的結(jié)晶成功率提高,QIAGEN開發(fā)出了NeXtal® CubicPhase Kit。

 

NeXtal® CubicPhase Kit之所以能夠提高膜蛋白結(jié)晶的成功率,主要原因:1.采用NeXtal CubicPhase μplate,這種結(jié)晶板修飾了monoolein (MO,用于建立脂立方相),另外這種結(jié)晶板具有非常好的光學(xué)特性,在可見光下就可以觀測到膜蛋白晶體。2.采用專門的膜蛋白結(jié)晶溶液,QIAGEN專門開發(fā)出CubicPhase I&II Suite用于膜蛋白結(jié)晶。 NeXtal® CubicPhase Kit非常適合高通量膜蛋白結(jié)晶。


圖4. NeXtal CubicPhase μplate結(jié)晶板,結(jié)晶孔修飾DMO。
  

圖5.利用eXtal CubicPhase Cystallization System成功進行了bacterio-rhodopsin (BR) 結(jié)晶。

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