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細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù)

來源:自然基因科技有限公司   2008年01月17日 16:41  

細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù)

細(xì)胞遺傳學(xué)一詞可追溯到一百多年前科學(xué)家在細(xì)胞核里發(fā)現(xiàn)染色體的時候。 染色體在希臘語里的意思是帶色的。染色體顯帶技術(shù)的發(fā)展使科學(xué)家們能夠識別不同的染色體,從而在染色體水平上來了解許多疾病的遺傳變異。但是,細(xì)胞遺傳學(xué)研究也有它的不足之處。首先,受限于顯帶技術(shù)的分辨率(超過3MbDNA才能被識別),檢出象染色體微缺失綜合癥之類的微小染色體變異可能性很小;第二,傳統(tǒng)細(xì)胞遺傳技術(shù)只能分析中期分裂相細(xì)胞。而且,許多腫瘤特別是實體,染色體重組非常復(fù)雜,無法通過顯帶分析方法得到全部染色體核型。

熒光原位雜交技術(shù)(FISH)是二十世紀(jì)八十年代后期發(fā)展起來的,那時科學(xué)家們想用非放射性方法進(jìn)行基因定位(Pinkel D.et al.,1986)。FISH技術(shù)的發(fā)展很快在細(xì)胞遺傳學(xué)和分子遺傳學(xué)之間建立了一座橋梁。這是分子細(xì)胞遺傳學(xué)開始的標(biāo)志。這種方法被廣泛用于檢測染色體重組和標(biāo)記染色體(Pinkel D.et al.,1988),以及檢測許多基因疾病的染色體的微缺失(Kuwano A et al.,1991)和用于非整倍體疾病的產(chǎn)前診斷(Eastmond DA and Pinkel D,1989)。同時,為了滿足更多的需求,通過流式細(xì)胞技術(shù),染色體微切割和人類基因組進(jìn)程計劃(HGP)等不同的技術(shù),產(chǎn)生了越來越多的FISH探針并被商品化。運(yùn)用這些探針,科學(xué)家們能夠識別染色體穩(wěn)定易位的斷裂點和繪制出與某些特異性疾病相關(guān)的關(guān)鍵缺失區(qū)域??寺∵@些區(qū)域就可以識別與基因相關(guān)的疾病,從而制造出用于診斷的特異性探針。

1998年以來,許多以FISH為基礎(chǔ)的技術(shù)發(fā)展起來,解決了許多傳統(tǒng)細(xì)胞遺傳學(xué)中存在的問題,并開辟了分子細(xì)胞遺傳學(xué)的新時代。

直到1996年,M-FISH技術(shù)才得以建立,也就是運(yùn)用幾種不同熒光染色將22對常染色體和2條性染色體著色染成24種不同的顏色組合(Schrock E,et al.,1996;Speicher MR,et al.,1996)。這項研究的原理是:將幾種熒光染料混合后所產(chǎn)生的顏色要多于所使用混合染料的數(shù)目。理論上,如果使用n種熒光染料,那么就可檢
測2n-1個目標(biāo)。因此,只用5種熒光染料就可標(biāo)記22對常染色體和2條性染色體。M-FISH就是使用這種方法來標(biāo)記探針,每條染色體被不同的熒光染料組合標(biāo)記。而且,這兩種技術(shù)也使用特殊的軟件來識別虛擬顏色代表的不同的熒光組合。M-FISH中,通過5個窄帶濾波器對5種不同的熒光圖像分別捕獲,然后對這5個圖像整合并用特定的軟件分析;

比較基因組雜交技術(shù),可以在一次實驗中分析整個基因組的DNA序列拷貝的數(shù)目變化(Kallioniemi A,etal.,1992)。將等量的被檢測組織和正常對照組織全基因組DNA分別用綠色或紅色熒光標(biāo)記,混合變性后與標(biāo)記探針和正常的分裂中期染色體雜交,雜交后對照各自的參考染色體分別計算和分析檢測組織和正常對照組織的熒光比率。此項技術(shù)可以有效地檢測染色體不平衡,例如缺失、重復(fù)。CGH也有缺點,首先,該技術(shù)只能檢測非平衡的染色體重組,對平衡染色體重組卻無能為力;大部分CGH軟件有自動核型分析軟件包系統(tǒng),但是需要一定程度的手動干預(yù)。另一個局限是分辨率低,一般只有大于10Mb的非平衡改變才能被檢測。對于高水平的擴(kuò)增,2Mb就可以被檢測。
盡管CGH可以用來分析組織樣本的細(xì)胞遺傳學(xué)變異,但由于分辨率低的關(guān)系,對于單個基因異常提供的信息有限。在這種情況下,間期FISH為檢測特定基因位點上的變異提供了選擇方法。因為染色質(zhì)在細(xì)胞核內(nèi)纏繞而難以變性。細(xì)胞分裂間期FISH的難度大于中期FISH。因此,間期FISH探針需信號強(qiáng)烈集且無背景信號產(chǎn)生,以避免判斷錯誤。黏性質(zhì)粒,PACBAC可用于間期FISH,YAC則因為它的靶區(qū)域太大會產(chǎn)生成團(tuán)信號而不適合使用。間期FISH廣泛應(yīng)用于臨床診斷中,尤其是對染色體核型分析失敗和遺傳學(xué)分析貌似正常的病例尤為有意義。

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