蛋白質(zhì)的折疊速率
蛋白質(zhì)的折疊是指一個(gè)蛋白質(zhì)從它的變性狀態(tài)轉(zhuǎn)變到它的特定生物學(xué)天然構(gòu)象的過(guò)程。現(xiàn)在人們已經(jīng)普遍接受了共翻譯折疊的理論,認(rèn)為mRNA在核糖體上翻譯的過(guò)程,蛋白質(zhì)折疊就開(kāi)始了,這一過(guò)程遵循自由能減少規(guī)律,即蛋白質(zhì)在一定時(shí)間內(nèi)沿著某一或某些特定的路徑(過(guò)渡態(tài)系統(tǒng))達(dá)到其自由能?。O小)的天然構(gòu)象。各種光譜技術(shù),質(zhì)譜和核磁共振等試驗(yàn)方法都可用來(lái)研究蛋白質(zhì)的折疊,為研究蛋白質(zhì)折疊速率預(yù)測(cè)累積了許多試驗(yàn)數(shù)據(jù)。為了理解蛋白質(zhì)的折疊機(jī)理,其重要任務(wù)之一便是確定蛋白質(zhì)折疊速率的決定因素。許多對(duì)小的二態(tài)蛋白質(zhì)的理論研究表明,蛋白質(zhì)的大小 形態(tài)以及結(jié)構(gòu)特征等都對(duì)其折疊速率產(chǎn)生影響,但在揭示它們的相互關(guān)系過(guò)程中受到種種限制。經(jīng)過(guò)多年的努力,到現(xiàn)在已經(jīng)產(chǎn)生了許多較好的方法,能夠比較地預(yù)測(cè)出一些小型蛋白質(zhì)的折疊速率。有的蛋白質(zhì)折疊需要幾毫秒,而有的蛋白質(zhì)折疊需要幾個(gè)小時(shí),所以不同蛋白質(zhì)的折疊速率(蛋白質(zhì)折疊所用時(shí)間的倒數(shù))差別很大,為了便于不同蛋白質(zhì)折疊速率的比較,人們常用In來(lái)表示蛋白質(zhì)的折疊速率。蛋白質(zhì)折疊速率的預(yù)測(cè)方法大致分為基于蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)方法,基于蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)方法和基于蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)方法。
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