實時熒光定量PCR擴增曲線包括基線期,指數(shù)擴增期,線性擴增期和擴增平臺期,標準的曲線應(yīng)該呈典型的S型。
不規(guī)則曲線可以根據(jù)曲線的具體情況來分析:
1)曲線呈斜線上升
原因:熱蓋失靈或熱蓋沒蓋緊,導(dǎo)致控溫不準、液體揮發(fā)。
解決辦法:更換儀器熱蓋或?qū)嵘w蓋緊。
圖1 曲線呈斜線上升
2)擴增曲線分成兩段(斷裂)
圖2擴增曲線分成兩段(斷裂)
原因:基線的終點大于Ct值,通常是因為模板DNA濃度偏高,CT值< 15,而基線仍然取3-15,其中包含部分擴增信號,導(dǎo)致曲線被壓下去。
解決方法:減小基線終點,至Ct值前4個循環(huán),重新分析數(shù)據(jù)。
3)直線擴增曲線
圖3 某些樣本出現(xiàn)直線擴增曲線
原因:探針部分降解
解決辦法:建議更換試劑進行測試。
4)曲線平臺期下掉
原因:蓋子沒蓋緊
解決辦法:PCR反應(yīng)管蓋子蓋上后,檢查蓋子是否蓋緊。
圖4 曲線平臺期下掉
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