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DNA建庫磁珠——你選對(duì)了嗎?

來源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司   2020年04月10日 17:15  
DNA建庫磁珠——你選對(duì)了嗎?


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背景介紹




磁珠是高通量測序過程產(chǎn)品,通過磁顆?;钚曰鶊F(tuán)在一定條件下可與核酸結(jié)合和解離的原理,將樣本中目的片段分離??蓪?shí)現(xiàn)對(duì)核酸樣本的高通量自動(dòng)化操作,廣泛應(yīng)用于基因測序以及分子診斷領(lǐng)域。

商業(yè)化磁珠產(chǎn)品體系一般包含:磁珠、聚乙二醇(PEG)、鹽離子等?;赟PRI(Solid Phase Reversible Immobilization )技術(shù), DNA在一定濃度的PEG存在條件下,NaCl或MgCl2促進(jìn)條件下,DNA分子構(gòu)象會(huì)發(fā)生急劇變化,會(huì)暴露出磷酸骨架上大量的帶負(fù)電荷的磷酸基團(tuán),與表面帶負(fù)電荷的羧基磁珠結(jié)合。帶負(fù)電磷酸基團(tuán)借由解離的鹽離子(如Na+)與羧基形成離子橋,使DNA被特異性吸附到羧基磁珠表面。利用磁珠的磁性,可通過外加磁場進(jìn)行收集洗脫,不同長度的DNA片段可以被選擇性的沉淀出來。


 

1. 磁珠結(jié)構(gòu)示意圖與磁珠吸附DNA原理示意圖





產(chǎn)品描述




Hieff NGS® DNA Selection Beads基于SPRI (Solid Phase Reverse Immobilization)原理,配合精心優(yōu)化過的緩沖體系,可用于二代測序文庫構(gòu)建過程中的DNA片段分選、純化。本產(chǎn)品可適用于各品牌的DNA、RNA建庫試劑盒,和目前廣泛使用的AMPure XP Beads使用方式相同,片段回收效率和文庫大小分布均與AMPure XP Beads高度吻合。

 




產(chǎn)品特點(diǎn)





? *:采用進(jìn)口原材料,品質(zhì)高度穩(wěn)定。

?無縫替換:產(chǎn)品原理,產(chǎn)品操作與實(shí)驗(yàn)結(jié)果與AMPure XP保持高度一致。

?兼容性高:兼容目前市面上所有的DNA/RNA建庫試劑盒。

?批次穩(wěn)定:嚴(yán)格的批次性能與穩(wěn)定性質(zhì)控,單次能產(chǎn)20L。

 




操作流程





 

2. DNA分選操作示意圖





性能展示




? 回收效率與XP高度一致

相同小牛胸腺基因組DNA,分別使用Yeasen磁珠與進(jìn)口XP磁珠,在不同分選比列條件下, 片段大小與回收產(chǎn)量高度一致。

品牌

磁珠比例

測試值1

測試值2

平均值

回收效率對(duì)比

XP

1.8x

14.4

14.8

14.6

0.99

Yeasen

14.8

14 .8

14.8

XP

0.8x

13.2

13.1

13.15

1.04

Yeasen

12.5

12.7

12.6

XP

0.6x

10.7

9.18

9.94

0.91

Yeasen

11.0

10.8

10.9

XP

0.5x

9.26

9.88

9.57

1.27

Yeasen

6.58

8.46

7.52

 

? 分選效果與XP一致

利用模式樣本,用XP磁珠和Yeasen磁珠做平行實(shí)驗(yàn),Yeasen磁珠分選效果與Beckman磁珠對(duì)比,二者回收效率,分選片段大小基本一致。

 

3. 磁珠分選效果與AMPure XP磁珠對(duì)比

 

? 批次間穩(wěn)定性好

Yeasen三個(gè)批次磁珠的回收效率高度一致,批間穩(wěn)定性佳。

樣本

測試人

Input(ng)

純化(1.8×)

純化后(ng)

回收率%

平均回收率

B-YS

測試人1

169.5

159.75

94.25%

94.5%

C-YS

162

95.58%

D-YS

158.75

93.66%

B-YS

測試人2

169.5

155

91.45%

91.94%

C-YS

154.25

91%

D-YS

158.25

93.36%

 

? 性價(jià)比更高

相同規(guī)格產(chǎn)品,Yeasen磁珠價(jià)格遠(yuǎn)低于AMPure XP價(jià)格,性價(jià)比更高。

 

價(jià)格對(duì)比

珠4.jpg 

4. Yeasen磁珠與AMPure XP磁珠價(jià)格對(duì)比





訂購信息





類型

名稱

貨號(hào)

規(guī)格

替換XP 

Hieff?NGS®?DNA Selection?Beads

12601ES03

1 mL

12601ES08

5 mL

12601ES56

60 mL

12601ES75

450 mL

 

HB210802


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