目前高通量測序可以有效評(píng)估胃部微生物群的含量，但在臨床上很難實(shí)現(xiàn)。研究人員希望可以尋找一個(gè)在血清層面試驗(yàn)的方法，來評(píng)估胃部微生物群的含量。

韓國漢陽大學(xué)醫(yī)學(xué)院近日在PLOS ONE雜志上發(fā)表文章，研究通過幽門螺桿菌抗體和胃蛋白酶原的檢測來預(yù)測胃部微生物群的含量。其中在胃部黏膜組織DNA提取中，使用法國Bertin的Precellys研磨器，良好的研磨效果助力接下來的測序及微生物群的分析。

研究人員評(píng)估了兩種相對(duì)含量與胃癌相關(guān)的細(xì)菌（亞硝酸細(xì)菌和IV型分泌系統(tǒng)蛋白基因產(chǎn)生菌T4SS）與血清標(biāo)記物（幽門螺桿菌抗體HP，胃蛋白酶原PG）的關(guān)系。

DNA提取方法：樣品：胃部研磨組織；Precellys24研磨儀；研磨條件為轉(zhuǎn)速6500rpm，研磨90s，研磨珠為0.1mm的鋯珠；提取的DNA樣品用無DNA酶水溶，之后用DNA純化試劑盒（QIAGEN）純化，-80℃保存。

經(jīng)過16S rRNA基因測序分析微生物含量的變化，結(jié)果如圖1、圖2所示：

圖一中A-D四張結(jié)果分別為不同濃度胃蛋白酶原PG與兩種細(xì)菌的關(guān)系圖，其中隨著PG濃度水平下降，細(xì)菌的含量上升；

圖2中A-D四個(gè)結(jié)果分別不同濃度胃蛋白酶原PG與兩種細(xì)菌的關(guān)系，其中分別有HP抗體陽性、HP抗體陰性以及未確定的三組細(xì)菌含量的比較；HP抗體陰性的兩種細(xì)菌含量明顯高于HP抗體陽性；同時(shí)隨著PG含量的下降，細(xì)菌含量上升。

法國Bertin公司研磨器Precellys因其高效的研磨效率，安全的研磨性能，可以有效助力胃部或腸道微生物的研究。此外，與Precellys搭配的Cryolys制冷系統(tǒng)可以快速降溫，保證在研磨的同時(shí)準(zhǔn)確控制研磨腔室溫度穩(wěn)定在0-10℃，為RNA和蛋白質(zhì)的提取保駕護(hù)航。