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倒置熒光顯微鏡光路中需加上一個雙色束分離器，它與光鈾呈45°角，激發(fā)光被反射到物鏡中，并聚集在樣品上，樣品所產(chǎn)生的熒光以及由物鏡透鏡表面、蓋玻片表面反射的激發(fā)光同時進(jìn)入物鏡，反回到雙色束分離器，使激發(fā)光和熒光分開，殘余激發(fā)光再被阻斷濾片吸收。如換用不同的激發(fā)濾片/雙色束分離器/阻斷濾片的組合插塊，可滿足不同熒光反應(yīng)產(chǎn)物的需要。此種熒光顯微鏡的優(yōu)點(diǎn)是視野照明均勻，成像清晰，放大倍數(shù)愈大熒光愈強(qiáng)。
倒置顯微鏡具有在培養(yǎng)瓶或培養(yǎng)皿內(nèi)進(jìn)行顯微觀察的特點(diǎn)；可以觀察不經(jīng)染色的透明活體；落射熒光顯微適用于熒光顯微術(shù)。該儀器特別適用于對活體細(xì)胞和組織、流質(zhì)、沉淀物等進(jìn)行顯微研究，是生物學(xué)，細(xì)胞學(xué)，腫瘤學(xué)，遺傳學(xué)，免疫學(xué)等研究工作的理想儀器?？晒┛蒲小⒏咝?、醫(yī)療、防疫和農(nóng)牧等部門使用。倒置熒光顯微鏡是由倒置顯微鏡和落射熒光顯微鏡組成。儀器配有長工作距離平場消色差物鏡、大視野目鏡、雙目觀察，倒置顯微鏡還配有特長或超長工作距離聚光鏡，同時配有相襯裝置及長工作距離平場相襯物鏡。
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