標(biāo)準(zhǔn)菌株，來自國內(nèi)或國際菌種保藏中心保藏的，遺傳學(xué)特性得到確認(rèn)和保證并可追溯的菌株。亦稱模式菌株 。在給某細(xì)菌定名，分類作記載和發(fā)表時，為了使定名準(zhǔn)確和作為分類概念的準(zhǔn)則，以純粹活菌(可繁殖)狀態(tài)所保存的菌種。在標(biāo)準(zhǔn)菌種中，對于從作過原始記載的作者實際分離或應(yīng)用的菌株，通過營養(yǎng)繁殖獲得和保存的菌株，稱為正標(biāo)準(zhǔn)菌株。此外，當(dāng)原作者使用復(fù)數(shù)菌株，以后的研究者選擇其中之一作為*適當(dāng)?shù)木陼r，稱該菌種為選定標(biāo)準(zhǔn)菌株。當(dāng)原作者使用的菌株失掉，以后的研究者就新的菌株研究，記載后，確認(rèn)可以作為國際上正標(biāo)準(zhǔn)菌株的代替菌株時，稱該菌株為新模式菌株。

質(zhì)控菌株本質(zhì)上是標(biāo)準(zhǔn)菌株的商業(yè)衍生產(chǎn)品，其應(yīng)有可靠的溯源證明追溯至其使用的標(biāo)準(zhǔn)菌株來源，在微生物實驗室僅可作為工作菌株進(jìn)行使用，質(zhì)控菌株可以用來做陽性對照，用于質(zhì)量控制，不具備代表性。

標(biāo)準(zhǔn)/質(zhì)控菌株主要來源

美國菌種保藏中心

American Type Culture Collection Center,ATCC

中國普通微生物菌株保藏中心

China General Microbiological Culture Collection Center,CGMCC

工業(yè)微生物菌種保藏管理中心

China Center for Industrial Culture Collection ,CICC

中國醫(yī)學(xué)微生物菌種保藏中心

China Center for Medical Culture Collection ,CMCC