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全自動均質(zhì)器一般采用304或316不銹鋼系統(tǒng)（大部分采用304），可以有效分離防護(hù)體樣品表面和其中所含微生物的均勻樣品。樣品包裝在一次性無菌均質(zhì)袋中不與儀器接觸，具有均質(zhì)溫和、無污染、無損傷、無溫升、無需清洗器皿等特點(diǎn)，滿足快速、準(zhǔn)確、重復(fù)性好的要求。也適用于腫瘤組織的勻漿，可以獲得大量的單細(xì)胞。如有必要，可通過延長勻漿時間輕輕破碎組織細(xì)胞。
全自動均質(zhì)器的工作原理是將原樣（大的需要切成10×10mm左右的塊），放入裝有一定液體或溶劑的均質(zhì)袋中，通過無菌均質(zhì)機(jī)的錘擊板反復(fù)錘擊樣品均質(zhì)袋，產(chǎn)生壓力，引起振蕩，加速混合，使溶液中微生物成分分布均勻。存放原始樣品材料和溶劑的均質(zhì)袋由特殊材料制成并經(jīng)過無菌處理（已打開的均質(zhì)袋用戶應(yīng)再次處理以確保無菌），并通過均質(zhì)器門的上緣、橫桿夾緊密封，避免在錘擊板錘擊過程中溶液溢出。均質(zhì)機(jī)的拍板不斷地敲擊均質(zhì)袋，產(chǎn)生的壓力可以將袋內(nèi)的樣品壓碎并混合。均質(zhì)速度可編程設(shè)置，每段可設(shè)置為3~12次/秒。每段均質(zhì)時間可設(shè)置為1秒至100分鐘或連續(xù)運(yùn)行，用戶可根據(jù)樣品和溶劑條件進(jìn)行合理選擇。
全自動均質(zhì)器的主要操作步驟如下：
1、準(zhǔn)備好預(yù)處理好的樣品，放入無菌均質(zhì)袋中；
2、打開均質(zhì)機(jī)的門，關(guān)閉無菌均質(zhì)袋的開口夾住時間（自動）；
3、設(shè)置拍打速度、拍打時間等程序；
4、開始自動工作；均質(zhì)完成后，打開料倉門取出處理好的樣品。至此，工作完成。
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