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細(xì)胞轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)技術(shù)——功能實(shí)驗(yàn)的第一步

來源:深圳市安培生物科技有限公司   2021年10月21日 18:21  

轉(zhuǎn)染(transfection)是真核細(xì)胞主動(dòng)或被動(dòng)導(dǎo)入外源核酸片段(DNA或RNA)而獲得新的表型的過程。轉(zhuǎn)染后的細(xì)胞會(huì)產(chǎn)生重組蛋白,或者特異性的增強(qiáng)/抑制細(xì)胞中的基因表達(dá)。轉(zhuǎn)染后的檢測(cè)主要包括基因水平和蛋白水平的檢測(cè)。一定時(shí)間后收集轉(zhuǎn)染處理后的細(xì)胞,采用超聲或酶解的方法破碎細(xì)胞,離心得到上清。針對(duì)基因水平,使用普通 PCR 或 RT-PCR 進(jìn)行驗(yàn)證,蛋白水平,使用 western blot 檢測(cè),簡單,快速,準(zhǔn)確。

細(xì)胞轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)技術(shù)——功能實(shí)驗(yàn)的第一步

轉(zhuǎn)染的類型

根據(jù)導(dǎo)入的核酸存在于宿主細(xì)胞的時(shí)間長短,可以分為瞬轉(zhuǎn)和穩(wěn)轉(zhuǎn)。根據(jù)轉(zhuǎn)染方式可以分為化學(xué)方法,生物方法,物理方法。

瞬時(shí)轉(zhuǎn)染是指將構(gòu)建好的質(zhì)?;蛘遱iRNA通過某種方式導(dǎo)入到哺乳動(dòng)物細(xì)胞內(nèi)(常用的工具細(xì)胞 HEK293 細(xì)胞),該外源核酸片段不整合到細(xì)胞自身的基因組上。隨著細(xì)胞的生長分裂,外源基因會(huì)逐漸丟失,在細(xì)胞內(nèi)能夠存在 3-4 天,無法隨著細(xì)胞的分裂進(jìn)入到子代細(xì)胞中。在這一段時(shí)間內(nèi),外源基因在細(xì)胞內(nèi)發(fā)生轉(zhuǎn)錄翻譯,得到少量的蛋白。根據(jù)使用的載體不同,收集目的基因/蛋白進(jìn)行檢測(cè)的時(shí)間不同,通常在轉(zhuǎn)染后48h,目的蛋白的表達(dá)水平最高。瞬時(shí)轉(zhuǎn)染的特點(diǎn)是短時(shí)間內(nèi)進(jìn)行蛋白的小量制備,滿足后續(xù)的實(shí)驗(yàn)要求。

穩(wěn)定轉(zhuǎn)染是外源DNA整合到細(xì)胞基因組中,成為細(xì)胞基因組的一部分從而得以復(fù)制,隨著細(xì)胞分裂,子代細(xì)胞也同樣表達(dá)外源基因,這就是穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細(xì)胞的標(biāo)志。穩(wěn)定轉(zhuǎn)染是建立在瞬時(shí)轉(zhuǎn)染的基礎(chǔ)上的,先對(duì)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)染,再對(duì)得到的細(xì)胞池進(jìn)行篩選,篩選標(biāo)記是抗生素,熒光報(bào)告基團(tuán)等,通常需要2-3周的篩選時(shí)間,由此形成穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的細(xì)胞系。穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的特點(diǎn)是能夠得到蛋白的大量、長期生產(chǎn),滿足后續(xù)的一系列體內(nèi)體外的表型實(shí)驗(yàn)。

轉(zhuǎn)染方式

考慮到轉(zhuǎn)染效率是影響細(xì)胞實(shí)驗(yàn)的重要因素,因此選擇合適的轉(zhuǎn)染試劑和轉(zhuǎn)染方式很關(guān)鍵。下面我們介紹一下常見的轉(zhuǎn)染方式。

細(xì)胞轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)技術(shù)——功能實(shí)驗(yàn)的第一步

細(xì)胞由帶負(fù)電荷的磷脂雙分子層構(gòu)成,對(duì)于也帶負(fù)電荷的核酸片段(DNA和RNA)來說是不可透過的屏障,因此研究人員開發(fā)了很多方法能使核酸穿透細(xì)胞膜進(jìn)入胞內(nèi),大致分為三類:

轉(zhuǎn)染方法

原理

優(yōu)點(diǎn)

缺點(diǎn)

化學(xué)轉(zhuǎn)染方法

陽離子脂質(zhì)體

脂質(zhì)體是一種人工的脂雙層膜。陽離子脂質(zhì)體通常由陽離子和兩性離子脂質(zhì)組成。在DNA與脂質(zhì)體形成lipoplex的過程中,陽離子脂質(zhì)體起到復(fù)合和凝集DNA的作用,同時(shí)也有助于復(fù)合物與細(xì)胞膜的結(jié)合

操作簡單快速;

轉(zhuǎn)染效率高且重復(fù)性好;

可用于轉(zhuǎn)染DNA、RNA和蛋白;

可用于瞬時(shí)轉(zhuǎn)染和穩(wěn)定轉(zhuǎn)染

會(huì)受到血清的抑制,降低轉(zhuǎn)染效率;

脂質(zhì)體中的核心組分對(duì)細(xì)胞毒性較大

磷酸鈣共沉淀

核酸以磷酸鈣-DNA 共沉淀物的形式出現(xiàn)時(shí),可使DNA 附在細(xì)胞表面,利于細(xì)胞吞入攝取,或通過細(xì)胞膜脂相收縮時(shí)裂開的空隙進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)

便宜,使用廣泛

轉(zhuǎn)染效率差,不穩(wěn)定;

細(xì)胞毒性大;

葡聚糖

它是一種陽離子聚合物,可以與帶負(fù)電荷的DNA和蛋白質(zhì)結(jié)合,進(jìn)而被細(xì)胞吞噬

多用于貼壁細(xì)胞

一些細(xì)胞類型對(duì)葡聚糖特別敏感,可能會(huì)發(fā)生形態(tài)變化或者抑制細(xì)胞生長

其他陽離子聚合物

帶正電的聚合物與核酸帶負(fù)電的磷酸基團(tuán)形成帶正電的復(fù)合物后與細(xì)胞表面帶負(fù)電的蛋白多糖相互作用,并通過內(nèi)吞作用進(jìn)入細(xì)胞。陽離子聚合物和陽離子脂質(zhì)體最大的區(qū)別在于陽離子聚合物不含疏水部分而*溶于水,可以方便地進(jìn)行化學(xué)修飾,且不會(huì)像脂質(zhì)體一樣破壞細(xì)胞結(jié)構(gòu),所以相對(duì)毒性較低。目前使用*泛的陽離子聚合物轉(zhuǎn)染試劑是PEI(聚乙烯亞胺)

成本低;

免疫原性低;

轉(zhuǎn)染效率高且穩(wěn)定;

適用于懸浮細(xì)胞或貼壁細(xì)胞

 

 

細(xì)胞毒性較大;

常用于瞬時(shí)轉(zhuǎn)染;

不能生物降解

物理轉(zhuǎn)染方法

電穿孔

利用高脈沖電壓破壞細(xì)胞膜電位,使得DNA 通過膜上形成的小孔導(dǎo)入穩(wěn)定/瞬時(shí)性轉(zhuǎn)染

適用所有細(xì)胞類型;

適用瞬時(shí)轉(zhuǎn)染和穩(wěn)定轉(zhuǎn)染;

不需要載體

需要一定的電轉(zhuǎn)設(shè)備;

需要優(yōu)化電轉(zhuǎn)脈沖和電壓參數(shù);

細(xì)胞致死率高;

DNA和細(xì)胞用量大

顯微注射

利用管尖極細(xì)(0.1至0.5μm)的玻璃微量注射針,將外源基因片段直接注射到原核期胚或培養(yǎng)的細(xì)胞中

適用所有細(xì)胞類型;

可進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)染;

不需要載體;

不限制轉(zhuǎn)入的基因大小和數(shù)量;

多用于轉(zhuǎn)基因

設(shè)備昂貴;

技術(shù)要求高;

細(xì)胞致死率高

生物轉(zhuǎn)染方法

病毒轉(zhuǎn)染

病毒該載體可以將外源基因有效地整合到宿主染色體上,從而達(dá)到持久性表達(dá)

轉(zhuǎn)染效率高;

適用于難轉(zhuǎn)染的細(xì)胞系;

可用于體內(nèi)轉(zhuǎn)染

周期長,程序復(fù)雜;

費(fèi)用相對(duì)高;

存在生物安全問題

細(xì)胞由帶負(fù)電荷的磷脂雙分子層構(gòu)成,對(duì)于也帶負(fù)電荷的核酸片段(DNA和RNA)來說是不可透過的屏障,因此研究人員開發(fā)了很多方法能使核酸穿透細(xì)胞膜進(jìn)入胞內(nèi),大致分為三類:

轉(zhuǎn)染的影響因素:

轉(zhuǎn)染過程中許多因素會(huì)影響轉(zhuǎn)染效率:如細(xì)胞類型;細(xì)胞密度;質(zhì)粒大小、質(zhì)粒純度;血清;轉(zhuǎn)染試劑等。轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)中,以下幾個(gè)因素進(jìn)行調(diào)整和優(yōu)化:

1. 轉(zhuǎn)染前的細(xì)胞狀態(tài)和密度

轉(zhuǎn)染時(shí)細(xì)胞密度以 50-80%最佳,細(xì)胞密度過高會(huì)嚴(yán)重影響細(xì)胞狀態(tài)和轉(zhuǎn)染效率(周期進(jìn)程阻滯,凋亡增加等)。同時(shí)支原體污染會(huì)嚴(yán)重降低細(xì)胞的轉(zhuǎn)染效率,因此轉(zhuǎn)染前可用環(huán)丙沙星處理細(xì)胞以除去支原體。

2. 轉(zhuǎn)染時(shí)的質(zhì)粒純度

如果提取的質(zhì)粒不純,如帶少量鹽離子,蛋白、代謝物污染等都會(huì)顯著影響轉(zhuǎn)染復(fù)合物的有效形成;而含有內(nèi)毒素的質(zhì)粒對(duì)細(xì)胞存在很大的毒性作用(一般用去內(nèi)毒素的提取試劑盒)??股匾话銓?duì)真核細(xì)胞無毒,但轉(zhuǎn)染過程中細(xì)胞通透性增加,會(huì)使抗生素進(jìn)入細(xì)胞,從而降低細(xì)胞活性,導(dǎo)致轉(zhuǎn)染效率降低。

3. 轉(zhuǎn)染后的篩選時(shí)間

轉(zhuǎn)染后篩選不能太早或太晚,因?yàn)檗D(zhuǎn)染了外源基因的細(xì)胞代謝負(fù)荷大,增殖較慢,太晚會(huì)被沒有外源基因轉(zhuǎn)入的細(xì)胞所淹沒,最終導(dǎo)致篩選不出陽性克隆。一般要在轉(zhuǎn)染后48h之后開始加抗生素篩選。

4. DNA 與轉(zhuǎn)染試劑的比例

許多轉(zhuǎn)染方法需要優(yōu)化 DNA 與轉(zhuǎn)染試劑的比例。不同細(xì)胞系轉(zhuǎn)染效率通常不同,不同轉(zhuǎn)染試劑轉(zhuǎn)染效率差別很大,通常需要根據(jù)轉(zhuǎn)染試劑說明書進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn),選擇合適濃度的外源DNA或RNA,調(diào)整外源核酸片段和轉(zhuǎn)染試劑的比例。


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