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警惕!細(xì)胞系的交叉污染可能是毀掉你實(shí)驗(yàn)的元兇

來(lái)源:安諾倫(北京)生物科技有限公司   2021年11月18日 09:27  

您是否有過(guò)這樣的經(jīng)歷……

新買到的細(xì)胞或者實(shí)驗(yàn)室傳了幾代的細(xì)胞,又或者是儲(chǔ)存于超低溫冰箱幾年不用的細(xì)胞, 需要用到時(shí)腦海里一直有著這樣的問(wèn)題困擾著你,被污染了么? 鑒定正確么?用它做研究會(huì)影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果么?

據(jù)統(tǒng)計(jì)約30%細(xì)胞系被交叉污染或錯(cuò)誤辨識(shí),只因使用了交叉污染或錯(cuò)誤辨識(shí)的細(xì)胞而導(dǎo)致研究結(jié)論錯(cuò)誤、結(jié)果不可重復(fù)、臨床細(xì)胞治療災(zāi)難性后果……,這將浪費(fèi)大量時(shí)間、精力和金錢。

世人皆知,細(xì)胞身嬌體貴難養(yǎng)活,養(yǎng)好細(xì)胞實(shí)屬不易。而這其中最煩的是污染、最怕的是掉包。因?yàn)楸M管研究僧們有方法把一切污染的源頭扼殺在搖籃之內(nèi),卻沒(méi)有火眼金睛辨別已經(jīng)換了馬甲的錯(cuò)誤細(xì)胞。因而細(xì)胞一旦被李代桃僵,再資深的科研者都會(huì)陰溝里翻船,所以細(xì)胞鑒定顯得尤為重要。

為什么要進(jìn)行細(xì)胞系鑒定?

進(jìn)行細(xì)胞系STR鑒定是很重要的。很多生物醫(yī)藥的研究都采用培養(yǎng)細(xì)胞來(lái)進(jìn)行,這些細(xì)胞可能是受贈(zèng)于其它研究人員,也可能是從細(xì)胞庫(kù)(如美國(guó)?ATCC,American?Type?Culture?Collection)得來(lái)。據(jù)估計(jì),15-20%的實(shí)驗(yàn)室,實(shí)驗(yàn)中所使用的細(xì)胞已經(jīng)不是原來(lái)的細(xì)胞系,或者與其它細(xì)胞系發(fā)生了交叉污染。顯然,細(xì)胞系遭到污染、特征鑒別錯(cuò)誤,將會(huì)極大的威脅著基于這些細(xì)胞而發(fā)表的論文質(zhì)量和研究發(fā)現(xiàn)的正確性。

什么細(xì)胞最容易污染別的細(xì)胞?

Hela 細(xì)胞。五十多年來(lái),Hela細(xì)胞系被廣泛用于醫(yī)學(xué)和生物學(xué)領(lǐng)域的研究,對(duì)當(dāng)代生命科學(xué)的發(fā)展屢建奇功,是名副其實(shí)的生物學(xué)研究的親歷踐行者。同時(shí)很多被廣泛研究的細(xì)胞系都被Hela細(xì)胞淹沒(méi),因?yàn)樗L(zhǎng)得快,當(dāng)你發(fā)現(xiàn)自己的一個(gè)培養(yǎng)瓶里的細(xì)胞突然長(zhǎng)得很好,而以后都用它傳代做實(shí)驗(yàn)的話,十之八九是搞錯(cuò)了。

什么情況下需要細(xì)胞系鑒定?

1)當(dāng)建立或獲得一個(gè)新的細(xì)胞系時(shí);

2)一個(gè)涉及到細(xì)胞試驗(yàn)項(xiàng)目開(kāi)始/結(jié)束時(shí);

3)在細(xì)胞凍存之前,或細(xì)胞已連續(xù)培養(yǎng) 2~3 個(gè)月時(shí);

4)發(fā)表文章或申請(qǐng)課題經(jīng)費(fèi)前;

5)細(xì)胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結(jié)果與預(yù)期差別較大時(shí);

6)當(dāng)實(shí)驗(yàn)室使用超過(guò)一種細(xì)胞系時(shí),所有細(xì)胞系最好先鑒定以排除交叉污染的可能;

如何根據(jù)STR數(shù)據(jù)判斷細(xì)胞系身份?

收到細(xì)胞系鑒定結(jié)果以及 STR 信息,可以與參考數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)。如果細(xì)胞樣本的每個(gè) STR 位點(diǎn)和參考細(xì)胞 STR 位點(diǎn)都能重合匹配,即說(shuō)明該細(xì)胞系正確,反之則說(shuō)明你的細(xì)胞系可能被錯(cuò)誤標(biāo)記,交叉污染或發(fā)生遺傳不穩(wěn)定。一般說(shuō)來(lái),匹配度≥80%即可認(rèn)為該細(xì)胞系正確,匹配度<80%則說(shuō)明該細(xì)胞系的來(lái)源需要被懷疑。

如果細(xì)胞系被鑒定出發(fā)生交叉污染或錯(cuò)誤標(biāo)記,則需要拿更早代數(shù)的細(xì)胞進(jìn)行鑒定,從而找到問(wèn)題的起源或者直接從可靠的機(jī)構(gòu)購(gòu)買一株新的細(xì)胞系。

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