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臨床前化合物庫(kù)你知道是用來(lái)做什么的嗎?

來(lái)源:上海陶術(shù)生物科技有限公司   2022年05月27日 14:41  
  臨床前化合物庫(kù)廣泛存在于生活之中,如化學(xué)、生物等學(xué)科和國(guó)防等領(lǐng)域都大量使用圖形數(shù)據(jù),因此,對(duì)基于圖的頻繁子圖挖掘算法的研究非常必要?;趫D的數(shù)據(jù)挖掘算法提出時(shí)間并不長(zhǎng),但是由于圖論作為數(shù)學(xué)的一個(gè)研究領(lǐng)域已經(jīng)有很長(zhǎng)的歷史,所以頻繁子圖挖掘發(fā)展很快,并被廣泛應(yīng)用到許多領(lǐng)域之中,如通過(guò)頻繁子圖挖掘算法找出構(gòu)成有毒物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu),以及通過(guò)對(duì)網(wǎng)站瀏覽日志的挖掘,分析出頻繁的瀏覽模式等。
 
  目前,化合物結(jié)構(gòu)在計(jì)算機(jī)中表達(dá)方式主要有兩種類(lèi)型:一類(lèi)是線(xiàn)性表達(dá)式系統(tǒng),此系統(tǒng)是應(yīng)用簡(jiǎn)單編碼規(guī)則對(duì)化合物的結(jié)構(gòu)式進(jìn)行編碼,形成線(xiàn)性表達(dá)式。該系統(tǒng)較為簡(jiǎn)潔、單一,但是用其表達(dá)二維結(jié)構(gòu)有一定困難。另一類(lèi)是拓?fù)浔磉_(dá)法,將化合物結(jié)構(gòu)式看成圖,將原子看成邊,用關(guān)聯(lián)矩陣來(lái)表示其結(jié)構(gòu)式。通過(guò)Morgan 排序等方式可以使它具有單一性。該算法利用深度優(yōu)先搜索策略構(gòu)建詞典序的canonical label,大大減少了冗余候選子圖的產(chǎn)生,并避免了大量重復(fù)掃描數(shù)據(jù)庫(kù)。gSpan算法設(shè)計(jì)結(jié)構(gòu)具有連續(xù)性以及無(wú)候選人產(chǎn)生,降低了其空間復(fù)雜度和時(shí)間復(fù)雜度。實(shí)驗(yàn)可證明gSpan算法性能比前人算法更*,例如在執(zhí)行速度上可以達(dá)到FSG算法的15~100倍。
 
  臨床前化合物庫(kù)根據(jù)對(duì)SFS算法進(jìn)行了研究分析,并提出一種利用SFS進(jìn)行曲面外形曲面的重建的方法,在此基礎(chǔ)上,利用VC和OpenGL開(kāi)發(fā)了一個(gè)重建平臺(tái),可以實(shí)現(xiàn)一般曲面的重建。該系統(tǒng)基本可以快速地重建出物體的外形,或者先重建出各個(gè)部件,然后導(dǎo)入3DMax等其它成熟的三維造型軟件中進(jìn)行編輯修改,組裝成整機(jī)。但該系統(tǒng)也存在一些不足,所以提出以下幾點(diǎn)展望:1)系統(tǒng)中采用的重建算法有待進(jìn)一步改進(jìn),以實(shí)現(xiàn)任意光照下的灰度圖像的三維重建。2)提高重建精度,特別是重建誤差太大,需要進(jìn)一步研究。

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