小分子藥物相對于大分子藥物在體積、研發(fā)成本上都有著更大的優(yōu)勢。先導化合物的發(fā)現(xiàn)與優(yōu)化在新藥整體研發(fā)過程中至關重要,高質量的活性先導化合物能夠大大縮短藥物探索的時間,提高成藥可能性。隨著技術要求的不斷提升,在傳統(tǒng)新藥篩選技術的基礎上(已知活性化合物(Known)和高通量篩選(HTS)等),一些新的藥物篩選平臺應運而生,例如DELT(DNA編碼化合物庫)、PROTAC(蛋白降解靶向聯(lián)合體)、FBDD(基于片段的藥物發(fā)現(xiàn)平臺)、SBDD(基于結構的藥物發(fā)現(xiàn)平臺)、CADD(計算機輔助藥物設計和虛擬篩選平臺)等。
臨床期小分子藥物庫到現(xiàn)在還在逐年增長,但是分子的類型和多樣性的增速卻在逐年降低,促進小分子藥物研發(fā)突破的主要還是新的靶點和疾病指征的發(fā)現(xiàn)。目前大多數(shù)的公司其實是在用新的“篩子”不停地篩舊的化合物庫,期望那些之前沒有被篩出來或者已經(jīng)被篩出來的分子能在新的靶點上起效。當然藥物化學家們也很早期就意識到了這個問題的存在,之后又陸續(xù)開發(fā)了組合化學(Combinatorial Chemistry)、DNA編碼化合物庫(DNA Encoding Library,DEL)技術來擴充化合物庫。這兩種技術在一定階段上緩解了化合物庫匱乏的危機,但是它們都依賴于現(xiàn)有的經(jīng)典有機合成反應,同時對反應條件還有嚴格的要求,受限的化學反應類型在一定程度上決定了的分子種類規(guī)模上限,進而影響了化合物庫中化合物結構的多樣性。
臨床期小分子藥物庫可用于藥物功能重定位、細胞誘導、藥理研究、靶點確認等,屬于每個藥物篩選平臺建立之初的基本配套產(chǎn)品。舉例來說,TargetMol的一套近兩T種的上市藥物庫就包含了市場上可以收集的各類疾病對應的化學藥物,其生物活性多樣性和化學結構多樣性都非常高,是一套性價比非常好的入門庫,如:FDA上市藥物庫,臨床藥物庫,抗帥瘤庫,生物活性經(jīng)典庫和生物活性新穎庫等。
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