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全自動菌落計數(shù)儀因其使用的自動化程度高、分析結果可核對、樣品信息可留存等，已逐漸被越來越多的科研院所、衛(wèi)生疾控部分所喜愛。
如何選型，才能獲得性能較好的菌落計數(shù)儀，并取得高性價比呢?這得從該類儀器的原理來解釋?，F(xiàn)今面市的所有全自動菌落計數(shù)儀均是采用成像分析法實現(xiàn)自動計數(shù)的，即由成像硬件+分析軟件所組成，這二塊內容的任何一塊上出現(xiàn)失分，都會嚴重影響計數(shù)分析結果的穩(wěn)定性。
一、成像硬件的選型
成像硬件用于獲得清晰有效的菌落圖像，以便分析計數(shù)?，F(xiàn)今的成像硬件有拍照成像的、掃描成像的。由攝像頭拍照成像的優(yōu)點是:成像速度快，能確保在0.5秒內獲得菌落圖像。由單反相機、卡片機拍照成像的優(yōu)點是:能自動對焦、且像素分辨率一般更高，但其成像需要3~4秒的時間。
然而，拍照成像的致命弱點是:成像環(huán)境中的光線強度，無論是暗視野，還是背光，想要做到圖像中心與邊緣保持*一致，相對來說比較困難。從而引起平皿上亮度的不一致。
針對環(huán)境光干擾成像方面，通過對儀器照明系統(tǒng)進行精密的設計，上下光源采用了寬光帶的LED柔光系統(tǒng)，并結合"懸浮式暗視野"成像系統(tǒng)，不僅能夠消除玻璃培養(yǎng)皿的折射光斑，而且通過改變光比，使得菌落表面的皺折、凹陷、邊緣的鋸齒更富立體感。
掃描成像與在燈箱中營造均勻面光源不同，是將線光源通過移動變成面光源的，光線強度相對比較均勻，其均勻度通常比拍照燈箱的面光源要高一個數(shù)量級，從成像硬件的上解決了菌落目標的亮度不勻問題，但掃描只是平面的效果，不能展現(xiàn)培養(yǎng)基表層和深層的細微菌落，且不能展現(xiàn)菌落顏色等多方面的情況，對于觀察分析而言構成了一定難度。
二、分析軟件的選型
分析軟件是全自動菌落計數(shù)儀 的另一塊核心成分。因為菌落生物的存在多樣性，在培養(yǎng)基上的表現(xiàn)或顯像不可能大體一致，針對這類變化，在分析軟件選型上要考慮:對于各類成像干擾的自動排出能力。
比如:是否能自動矯正背景，等等。另外，對于嚴重粘連在一起的團裝、鏈狀分布菌落，將其自動分割開來的水平，也是評價分析軟件的考量指標。尤其是:對于同類菌落的"一鍵"化的智能分類計數(shù)能力，以及對于菌落計數(shù)分類的自動識別學習能力，更是評價分析軟件的關鍵考量指標。
現(xiàn)在比較好的分析軟件，具有圖像處理、圖像編輯、統(tǒng)計功能、測量功能、數(shù)據(jù)庫管理、以及對抗生素效價分析、藥敏分析功能、多培養(yǎng)皿統(tǒng)計、螺旋平皿統(tǒng)計等一系列功能。
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