近兩年發(fā)表的一篇 Nature Immunology 的文章,證實了使用低溫保存樣本用于單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析腎臟樣本的可行性 。采用低溫存儲策略可以最大限度地減少批次效應(yīng),防止一些細微的基因表達特征被掩蓋。雖然這種策略可能導(dǎo)致中性粒細胞的損失,并且可能會改變其他細胞亞群的相對頻率,但并沒有觀察到由于組織保存液而對基因表達產(chǎn)生了主要影響。
研究人員使用流式細胞術(shù)比較了新鮮和保存液處理的小鼠腎臟細胞的存活率,并通過 scRNA-seq 分析,驗證了保存液低溫保存組織樣本策略在長達 3 天的保存過程中,能夠有效保持腎臟的細胞群體異質(zhì)性、轉(zhuǎn)錄組完整性和免疫細胞轉(zhuǎn)錄組穩(wěn)定性。該研究表明,在 4℃條件下,組織保存液能夠完好保存原始樣本,適用于進行較長距離運輸。
結(jié)論:
組織保存液 + 低溫保存的操作方法,非常類似于臨床中對于標(biāo)本的常規(guī)處理,因此使客戶參與單細胞樣本準(zhǔn)備變得切實可行,這對于 scRNA-seq 樣本運輸、樣本質(zhì)量保證而言至關(guān)重要。相信組織保存液 + 低溫保存的方法的推行,一定會對您的單細胞的研究有所助益。
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