患者樣本中存在的一些生物分子能夠為疾病診斷提供關(guān)鍵的檢測指標,例如疾病代謝物和蛋白質(zhì)標記物?,F(xiàn)有的分離方法通常采用沉淀法,費時昂貴且要條件優(yōu)化。本文中,我們通過使用 NMR 和 Off-Gel 方法來進行評估,展示了如何通過超濾快速、精確、高效地分離血清中生物分子。
下載本篇《Vivaspin® Turbo 4 PES: 一種分離疾病代謝物和蛋白質(zhì)的經(jīng)濟方法》應用說明,了解超濾系統(tǒng)如何在經(jīng)濟效益,具有同樣的有效性質(zhì),簡單易操作的前提下完成該過程。
目前,人們普遍采用多重親和去除系統(tǒng)(Multiple Affinity Removal System, MARS)從人血清、血漿和其他生物液體中分離高豐度蛋白質(zhì)(白蛋白、IgG、抗胰蛋白酶、IgA、轉(zhuǎn)鐵蛋白和結(jié)合珠蛋白)。去除這些高豐度蛋白質(zhì)可以有效地擴大動態(tài)范圍,從而改善血清樣本的LC/MS和電泳結(jié)果。但是,使用該系統(tǒng)會給用戶帶來高昂的成本(4×w.r.t.超濾)。
我們通過超濾的方式,以蛋白質(zhì)的大小和結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ),在驅(qū)動力(通常由離心或壓力條件產(chǎn)生)下將樣品通過膜分離。
具體步驟如下
1、濃縮管制備
用 0.1NHCl沖洗Vivaspin® Turbo 4,重復沖洗 3 到 4 次。
2、樣品采集、超濾和分析
從患者身上抽取血樣并提取血清
使用 Vivaspin® Turbo 4,50kda MWCO PES(4000g,7min)高豐度血清蛋白
使用 Vivaspin® Turbo 4,3kDa MWCO PES 濃縮濾液(4000g,7min)
濃縮物的Off-Gel進行區(qū)帶分離分離(蛋白質(zhì)>3kDa)
超濾透過液的核磁共振(代謝產(chǎn)物<3kDa)
以上步驟即可實現(xiàn)蛋白質(zhì)從代謝物中分離,但是需要注意的是用去離子水進行預沖洗無法有效去除干擾物,因此在核磁共振圖譜中觀察到雜質(zhì)峰(圖1)。因此使用0.1NHCl溶液進行預沖洗(一個濃縮管的預沖洗量為12 ~ 14 mL,是Vivaspin® Turbo 4PES的 3 ~ 4 倍)。

圖1. 核磁共振圖譜
結(jié)論
通過Off-Gel分離對濃縮物進行分析(圖2),含有小代謝物的濾液則通過核磁共振進行分析(圖3)。因此超濾方式是簡單高效的,對一個樣本的分析成本估計會是MARS的四分之一。


(左)圖2. 對健康個體(頂部)和患病個體(底部)的 血清中蛋白質(zhì)進行的Off-Gel分離分析
(右)圖3. 對健康個體(頂部)和患病個體(底部)血清中代謝物進行的核磁共振分析
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