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常見(jiàn)消毒方式有包括巴氏消毒、臭氧消毒以及化學(xué)消毒。一般來(lái)說(shuō)，化學(xué)消毒在制藥用水不常用，驗(yàn)證比較麻煩。常用巴氏消毒，對(duì)活性炭、RO、EDI消毒，防止微生物滋生，系統(tǒng)設(shè)計(jì)好也可以采用常溫RO膜、EDI，如果停機(jī)時(shí)間超過(guò)10天，可采用化學(xué)藥劑清洗。
(1)巴氏消毒：是指將液體加熱到一定溫度并持續(xù)一段時(shí)間，以殺死可能導(dǎo)致疾病、變質(zhì)或不需要的發(fā)酵微生物的過(guò)程。
巴氏消毒有兩個(gè)主要功能：①用于純化水系統(tǒng)中的活性炭等預(yù)處理單元的周期性消毒，RO/EDI單元的周期性消毒，以及儲(chǔ)存與分配管網(wǎng)單元的周期性消毒；②用于注射用水系統(tǒng)正常運(yùn)行時(shí)的微生物抑制。
(2)紫外線殺菌: 紫外線是通過(guò)減慢系統(tǒng)中新的菌落生長(zhǎng)速度而影響生物膜的生成，但是這只對(duì)浮游微生物部分有效。紫外線主要有殺菌、降解TOC和破除臭氧等三個(gè)作用。
(3)臭氧殺菌：臭氧是一種廣譜殺菌劑，可殺滅細(xì)菌繁殖體和芽孢、病毒、真菌等，并可破壞肉毒桿菌毒素。臭氧殺菌機(jī)制為通過(guò)氧化作用破壞微生物膜的結(jié)構(gòu)而實(shí)現(xiàn)殺菌效果。臭氧殺菌系統(tǒng)除了操作簡(jiǎn)單、水溫?zé)o波動(dòng)、消毒時(shí)間短和降解生物膜等優(yōu)勢(shì)外，管道材質(zhì)選擇余地也非常大。臭氧殺菌系統(tǒng)能采用不銹鋼材質(zhì)或PVDF材質(zhì)進(jìn)行建造，采用PVDF材質(zhì)建造的純化水臭氧殺菌系統(tǒng)能有效降低投資成本。
(4)純蒸汽滅菌：指利用高溫高壓蒸汽進(jìn)行滅菌的方法。由于純蒸汽的穿透力強(qiáng)，蛋白質(zhì)、原生質(zhì)膠體在濕熱條件下容易變性凝固，酶系統(tǒng)容易被破壞，蒸汽進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)凝結(jié)成水，能放出潛在熱量而提高溫度，更增強(qiáng)了殺菌力。
(5)過(guò)熱水殺菌：指利用高溫高壓過(guò)熱水進(jìn)行滅菌的方法。與純蒸汽殺菌一樣，過(guò)熱水能使蛋白質(zhì)、原生質(zhì)膠體在濕熱條件下變性凝固，酶系統(tǒng)被破壞，可殺死一切微生物，包括細(xì)菌的芽孢，真菌的孢子或休眠體等耐高溫的個(gè)體。
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