從凍存的細(xì)胞提取RNA
1). 將凍存管從液氮或冰箱中取出;
2). 不待細(xì)胞溶解,將Trizol500ul-1ml直接放入凍存管中,此時(shí)Trizol會(huì)凍成冰狀;
3). 將凍存管緩慢融化,并用加樣器吹打混勻;
4). 將細(xì)胞裂解液移至Eppendorf管中,16000′g離心1min,吸出管底絮狀沉淀;
注釋:該步驟并非必要,多數(shù)Protocol省略該步驟,但加入該步中能明顯提高RNA的質(zhì)量;注意不能離心時(shí)間過長,否則沉淀難以吸出,將200ul黃槍頭尖部切去0.5cm操作;
5). 加入1/5體積的氯仿(約200ul),上下顛倒2~3min;
6). 4℃ 16000′g離心15min,輕輕吸出上清至新的Eppendorf管(約700ul ),不要擾動(dòng)中間層或用手指使Eppendorf管變溫;
注釋:一般情況下提取的RNA已經(jīng)足夠,而且在逆轉(zhuǎn)錄過程中RNA的質(zhì)量要遠(yuǎn)較RNA的數(shù)量更重要,一般僅取上清的上1/2左右足矣,這樣可最大限度避免對(duì)于中間蛋白相的擾動(dòng);
7). 加入等體積異丙醇(約800ul),充分混勻,冰上靜置15min;
8). 4℃ 16000′g離心15min,輕輕倒掉上清,僅留管底沉淀;
9). 加入1ml預(yù)冷的無水乙醇,4℃ 16000′g離心2min,輕輕倒掉上清,僅留管底沉淀;
10). 倒置Eppendorf管于干凈濾紙上,至可見乙醇wan全揮發(fā);
11). 用100ul 新鮮制備的DEPC處理過的MilliQ 水溶解RNA,如果溶解不好,-20℃反復(fù)凍融1~2次,4℃ 16000′g離心3min,將上清吸至新的Eppendorf管中;
12). 加入等體積12 M LiCl,-20℃靜置15min;
13). 4℃ 16000′g離心15min,輕輕倒掉上清,僅留管底沉淀;
注釋:該步驟的目的在于去除小分子降解RNA和鹽分;但可以省略;只有大分子RNA在高濃度LiCl中沉淀,DNA不會(huì)沉淀;
14). 加入1ml預(yù)冷的無水乙醇,4℃ 16000′g離心2min,輕輕倒掉上清,僅留管底沉淀;
注釋:該步的目的在于去除LiCl,LiCl溶于乙醇,而RNA不溶于乙醇,利用溶解度分離;
15). 倒置Eppendorf管于干凈濾紙上,至可見乙醇wan全揮發(fā)RNA邊緣呈半透明;
16). 用40ul新鮮制備的DEPC處理過的MilliQ 水溶解RNA;
17). 取出5ul 用于紫外分光光度計(jì)測(cè)定和瓊脂糖凝膠電泳,其余凍存-70℃。
注釋:如果OD260/OD280<1.8,則加入等體積Trizol,按上述步驟重新提純。
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