把污水加蒸餾水分別稀釋10，100，1000倍，然后加入培養(yǎng)基中培養(yǎng)，如果培養(yǎng)出來菌落重合，菌非常多，無法分離，就加大稀釋倍數(shù)，直至獲得清晰可分離的菌落，有時甚至是非常小的菌落，要用倒置顯微鏡操作。而培養(yǎng)基則根據(jù)要分離的菌的營養(yǎng)類型進行配置，若要獲得多種微生物就要配置多種培養(yǎng)基進行如上操作。對于土壤加水溶解，對溶解液進行如上操作，不溶的部分就不用管了

樣品：加80ML蒸餾水，攪拌溶解，取上清液1ML于試管一中，并加9毫升水，叢試管一中取1ML加到試管2里，加9毫升水，叢試管2中取1ML加到試管3里，加9毫升水，分別稀釋了10 100 1000倍。

培養(yǎng)基：根據(jù)加瓊脂量控制培養(yǎng)基狀態(tài)，液體，半固體，固體培養(yǎng)基，根據(jù)細菌真菌霉菌配不同的培養(yǎng)基，調(diào)PH值。

接種：厭氧菌先接種再加培養(yǎng)基，好氧菌先加培養(yǎng)基再接種，倒置培養(yǎng)皿于SPX-150恒溫培養(yǎng)箱（上海和呈儀器制造廠生產(chǎn)）中。一種培養(yǎng)基加一種樣品。

結(jié)果：培養(yǎng)后出現(xiàn)不同的菌落，用接種針挑取再接種到新培養(yǎng)基里

重復操作直至出現(xiàn)單一的菌落，然后制片觀察，保留菌種。