国产精品视频一区二区三区四,亚洲av美洲av综合av,99国内精品久久久久久久,欧美电影一区二区三区电影

產(chǎn)品推薦:氣相|液相|光譜|質(zhì)譜|電化學(xué)|元素分析|水分測(cè)定儀|樣品前處理|試驗(yàn)機(jī)|培養(yǎng)箱


化工儀器網(wǎng)>技術(shù)中心>專業(yè)論文>正文

歡迎聯(lián)系我

有什么可以幫您? 在線咨詢

機(jī)械牽張力下人牙周韌帶基質(zhì)細(xì)胞的差異基因表達(dá)及蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)

來源:上海泉眾機(jī)電科技有限公司   2023年07月31日 09:06  

在正畸牙齒移動(dòng)(OTM)過程中,牙周韌帶在機(jī)械負(fù)荷的牙齒和牙槽骨組織之間的生物力學(xué)和分子通訊中起著關(guān)鍵作用。盡管尚未wanquan;探索OTM背后的生物學(xué)機(jī)制,但大家都知道的是OTM是由牽張力和壓縮力以及剪切應(yīng)力的相互作用驅(qū)動(dòng)的,這些應(yīng)力使牙齒能夠通過分子過程的逐步級(jí)聯(lián)移動(dòng)。牙周韌帶是外部機(jī)械信號(hào)的主要接收器,負(fù)責(zé)將其處理成生物信號(hào)。已經(jīng)確定參與這一過程的一些通路,包括局部粘著斑激酶和一氧化氮依賴性β-catenin 信號(hào)、Rho-mDia1信號(hào)通路、cAMP反應(yīng)元件結(jié)合蛋白活化、Piezo1 介導(dǎo)的信號(hào)和yes 相關(guān)蛋白信號(hào)通路等。拉伸或壓縮機(jī)械力激活或抑制這些通路,因?yàn)镺TM介導(dǎo)的因素(如血流,氧氣和二氧化碳水平)在響應(yīng)相應(yīng)類型的機(jī)械力時(shí)表現(xiàn)出不同的行為。

正畸學(xué)中另一個(gè)重要的臨床問題是應(yīng)用類似的正畸力后OTM率的個(gè)體間差異,這可以至少部分地由遺傳因素解釋。到目前為止,有證據(jù)表明單分子成分,例如白細(xì)胞介素-1β 多態(tài)性或瞬時(shí)受體電位陽離子通道亞家族C成員6 激活可能參與OTM率,但OTM背后的調(diào)控機(jī)制中個(gè)體間差異的復(fù)雜實(shí)體尚未明確。

關(guān)于 OTM 期間引發(fā)的牽張和壓縮力機(jī)制的知識(shí)有限,因?yàn)樗饕獊碜詫W⒂趩蝹€(gè)分子參數(shù)的研究,而不是在分子網(wǎng)絡(luò)上。雖然對(duì)壓縮力下牙周韌帶細(xì)胞的基因表達(dá)譜有初步的了解,在與OTM期間初始階段相當(dāng)?shù)臈l件下,人牙周韌帶張力側(cè)的差異表達(dá)基因(DEG)的剖析仍然缺失。

近日,維也納醫(yī)科大學(xué)牙學(xué)院牙周研究中心、臨床研究中心的課題組在 European Journal of Cell Biology 上發(fā)表了題為 Differential gene expression and protein-protein interaction networks of human periodontal ligament stromal cells under mechanical tension 的文章,該團(tuán)隊(duì)利用RNA-seq技術(shù)鑒定了機(jī)械牽張力下人原代牙周韌帶基質(zhì)細(xì)胞(PDLSC)中的DEG,該張力可以模擬正畸牙齒移動(dòng)期間經(jīng)歷的張力的初始階段,而且還評(píng)估了不同供體的原代人PDLSC,以解決基因表達(dá)譜中潛在的個(gè)體間差異。





首先,利用體外張力加載系統(tǒng)施加靜態(tài)機(jī)械牽張力,開始前6小時(shí)最大張力強(qiáng)度為10%,然后逐漸降低到3%。機(jī)械張力作用于PDLSC共72 h。

為了驗(yàn)證所選的處理設(shè)置不會(huì)干擾細(xì)胞活力而影響基因表達(dá),進(jìn)行了活死染色。結(jié)果表明,牽張力處理72 h后細(xì)胞完整性穩(wěn)定,這可能與活細(xì)胞有關(guān)。此外,張力處理的PDLSC看起來比未處理的PDLSC體積更小,細(xì)胞形態(tài)更圓。


接下來,分析了機(jī)械張力下牙周韌帶基質(zhì)細(xì)胞的差異基因表達(dá)。

轉(zhuǎn)錄組分析顯示,與未處理的PDLSC相比,張力處理的PDLSC中有1336個(gè)基因差異表達(dá),其中,543個(gè)基因顯著上調(diào),793個(gè)基因顯著下調(diào)。經(jīng)過p值調(diào)整后,剩下124個(gè)DEG至少具有≥1.0的效應(yīng)值。研究發(fā)現(xiàn),124個(gè)DEG中有33個(gè)DEG參與了38個(gè)不同的生物過程(圖1),20個(gè)DEG參與了3個(gè)細(xì)胞成分(圖2),19個(gè)DEG參與了11個(gè)分子功能(圖3),10個(gè)DEG參與了12個(gè)KEGG通路,5個(gè)DEG參與了4個(gè)Reactome通路和18個(gè)DEG參與了15個(gè)WikiPathways 。

基于這些結(jié)果,在mRNA水平上進(jìn)一步分析了與OTM相關(guān)的“骨發(fā)育”和“成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子受體信號(hào)通路的調(diào)控”生物過程相關(guān)的候選基因,包括APLN、FGFR1、NOG、SULF4、SFRP1和STC2。所有這些選定的DEG在張力處理的PDLSC中的表達(dá)均低于未處理的對(duì)照。

由于轉(zhuǎn)錄組分析是在三種不同PDLSC供體的RNA提取物中進(jìn)行的,因此必須評(píng)估對(duì)基因表達(dá)模式的個(gè)體影響,以將其從已鑒定的可能與OTM功能相關(guān)的DEG中排除。研究發(fā)現(xiàn),總共有13個(gè)蛋白質(zhì)編碼DEG在所有三個(gè)供體之間是相互的。這13個(gè)已鑒定的蛋白質(zhì)編碼DEG中沒有一個(gè)是與OTM功能相關(guān)的所選DEG的一部分。

圖1   機(jī)械張力下牙周韌帶基質(zhì)細(xì)胞中差異表達(dá)基因相關(guān)生物過程的基因本體富集分析。在機(jī)械張力下人牙周韌帶基質(zhì)細(xì)胞中的上調(diào)(紅色)和下調(diào)(藍(lán)色)基因與幾個(gè)生物過程有關(guān)。


圖2   機(jī)械張力下牙周韌帶基質(zhì)細(xì)胞中差異表達(dá)基因相關(guān)細(xì)胞成分的基因本體富集分析。在機(jī)械張力下人牙周韌帶基質(zhì)細(xì)胞中的上調(diào)(紅色)和下調(diào)(藍(lán)色)基因與三種不同的細(xì)胞成分有關(guān)。


圖3   機(jī)械張力下牙周韌帶基質(zhì)細(xì)胞中差異表達(dá)基因相關(guān)分子功能的基因本體富集分析。在機(jī)械張力下人牙周韌帶基質(zhì)細(xì)胞中的上調(diào)(紅色)和下調(diào)(藍(lán)色)基因與各種分子功能有關(guān)。

然后,進(jìn)一步分析了機(jī)械張力下牙周韌帶基質(zhì)細(xì)胞中差異表達(dá)基因的 mRNA 水平變化。為了確認(rèn)轉(zhuǎn)錄組分析的結(jié)果,使用RT-qPCR在mRNA水平上進(jìn)一步評(píng)估了與OTM期間生物學(xué)相關(guān)過程相關(guān)的選定DEG。與未經(jīng)處理的PDLSC相比,張力處理的PDLSC顯示FGFR2、NOG和SULF1 mRNA水平顯著降低;APLN、SFRP4或STC1 mRNA水平上沒有顯著變化,但是它們的平均mRNA水平比對(duì)照組低。

最后,研究分析了蛋白質(zhì)之間相互作用的網(wǎng)絡(luò)?;谵D(zhuǎn)錄組分析的結(jié)果,通過創(chuàng)建蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)來評(píng)估與GO 術(shù)語“骨發(fā)育”或“成纖維細(xì)胞因子受體信號(hào)通路調(diào)控”相關(guān)的前124 個(gè)DEG蛋白質(zhì)產(chǎn)物的潛在相互作用。對(duì)PPI的分析表明,11 個(gè)DEG的蛋白質(zhì)產(chǎn)物是四個(gè)不同PPI網(wǎng)絡(luò)的一部分(圖4)。


圖4   機(jī)械張力下牙周韌帶基質(zhì)細(xì)胞中差異表達(dá)基因產(chǎn)物的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)。蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的節(jié)點(diǎn)對(duì)應(yīng)于機(jī)械張力下牙周韌帶基質(zhì)細(xì)胞中差異表達(dá)基因產(chǎn)物的蛋白質(zhì)產(chǎn)物,這些基因被發(fā)現(xiàn)與數(shù)據(jù)庫中發(fā)現(xiàn)的已知的相互作用(綠線)或通過實(shí)驗(yàn)確定的(粉紅線)、基因同現(xiàn)預(yù)測(cè)的(藍(lán)線)、共表達(dá)的(黑線)或蛋白質(zhì)同源性的(紫線)相互作用相關(guān)。

圖5   圖形概要

綜上所述,該研究提供了證據(jù),證明了六個(gè)候選基因APLN、FGFR2(成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子受體-2)、NOG、SULF1(硫酸酯酶1)、SFRP4(分泌型卷曲相關(guān)蛋白4)和STC1(斯鈣素-1)在人PDLSC中基于機(jī)械牽張力的效應(yīng)中發(fā)揮作用,這在OTM期間可能很重要。機(jī)械信號(hào)網(wǎng)絡(luò)的詳細(xì)相互作用應(yīng)在未來的研究中探索,以最終填補(bǔ)OTM分子機(jī)制的大圖景,這將有助于開發(fā)更有效的口腔正畸個(gè)性化治療策略。

參考文獻(xiàn):Janji? K, Nemec M, Maaser JL, Sagl B, Jonke E, Andrukhov O. Differential gene expression and protein-protein interaction networks of human periodontal ligament stromal cells under mechanical tension. Eur J Cell Biol. 2023 Apr 26;102(2):151319. doi: 10.1016/j.ejcb.2023.151319. Epub ahead of print. PMID: 37119575.



微信搜索公眾號(hào)“Naturethink”,了解更多細(xì)胞體外仿生培養(yǎng)技術(shù)及應(yīng)用。




免責(zé)聲明

  • 凡本網(wǎng)注明“來源:化工儀器網(wǎng)”的所有作品,均為浙江興旺寶明通網(wǎng)絡(luò)有限公司-化工儀器網(wǎng)合法擁有版權(quán)或有權(quán)使用的作品,未經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)不得轉(zhuǎn)載、摘編或利用其它方式使用上述作品。已經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)使用作品的,應(yīng)在授權(quán)范圍內(nèi)使用,并注明“來源:化工儀器網(wǎng)”。違反上述聲明者,本網(wǎng)將追究其相關(guān)法律責(zé)任。
  • 本網(wǎng)轉(zhuǎn)載并注明自其他來源(非化工儀器網(wǎng))的作品,目的在于傳遞更多信息,并不代表本網(wǎng)贊同其觀點(diǎn)和對(duì)其真實(shí)性負(fù)責(zé),不承擔(dān)此類作品侵權(quán)行為的直接責(zé)任及連帶責(zé)任。其他媒體、網(wǎng)站或個(gè)人從本網(wǎng)轉(zhuǎn)載時(shí),必須保留本網(wǎng)注明的作品第一來源,并自負(fù)版權(quán)等法律責(zé)任。
  • 如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)等問題,請(qǐng)?jiān)谧髌钒l(fā)表之日起一周內(nèi)與本網(wǎng)聯(lián)系,否則視為放棄相關(guān)權(quán)利。
企業(yè)未開通此功能
詳詢客服 : 0571-87858618
建始县| 兴城市| 常德市| 新巴尔虎左旗| 天峻县| 佳木斯市| 宜春市| 凤城市| 平乡县| 九龙坡区| 荔波县| 江陵县| 锡林郭勒盟| 巨鹿县| 将乐县| 自治县| 蒲江县| 阜宁县| 雅江县| 五大连池市| 兴化市| 紫金县| 西充县| 泾源县| 张北县| 鄂托克旗| 华亭县| 延庆县| 社会| 佛教| 德令哈市| 体育| 海晏县| 罗平县| 彭阳县| 石城县| 甘孜| 阳江市| 土默特左旗| 巴青县| 梨树县|