FlyCut™ 酶是一系列能夠快速消化DNA的工程限制性酶。所有FlyCut™酶在通用CutOne中顯示出優(yōu)異的活性™ 和CutOne™ 彩色緩沖液,能夠在5~15分鐘內(nèi)消化DNA。這使得任何限制性酶的組合都能在一個(gè)反應(yīng)管中同時(shí)工作,并消除了連續(xù)消化的需要。FlyCut™ 酶已通過多項(xiàng)嚴(yán)格的質(zhì)量控制,可用于消化質(zhì)粒、基因組和病毒DNA以及PCR產(chǎn)物。CutOne™ Color Buffer包括密度試劑以及紅色和黃色跟蹤染料,可以將反應(yīng)混合物直接裝載在凝膠上。CutOne的紅色染料™ 彩色緩沖液在1%瓊脂糖凝膠中與2.5kb雙鏈DNA片段一起遷移,黃色染料在1%瓊脂凝膠中與10bp雙鏈DNA碎片一起遷移。
艾美捷快速內(nèi)切酶EcoRV:
Cat #: C-BSM537
Size: 200 rxns
Storage: -20°C
快速內(nèi)切酶EcoRV組分:
推薦反應(yīng)條件
1x CutOne“”緩沖器;在37°C下培養(yǎng);有關(guān)反應(yīng)設(shè)置,請參閱“快速DNA消化方案”。
熱滅活
在80°C下培養(yǎng)20分鐘。
質(zhì)量控制
功能測試
在含有1μgλDNA和1μl FlyCut“”EcoRV的CutOne“緩沖液中,在37°C下孵育15分鐘,20μl反應(yīng)可通過瓊脂糖凝膠電泳確定完-全消化。
長時(shí)間培養(yǎng)/星形活性測定
在含有1μgλDNA和1μl FlyCut“EcoRV的CutOne”緩沖液中,在37℃下孵育3小時(shí),反應(yīng)20μl,瓊脂糖凝膠電泳檢測到DNA模式?jīng)]有可檢測的核酸酶降解。長期孵育可能導(dǎo)致星形活性。
結(jié)扎和清算
在37℃下用FlyCut’“”EcoRV消化10倍后,在22°C下可將>95%的DNA片段與T4 DNA配體連接。在這些連接的片段中,通過瓊脂糖凝膠電泳測定,>95%可以用FlyCut“”EcoRV重新切割。
非特異性核酸內(nèi)切酶活性
在含有1μg超螺旋質(zhì)粒和1μl FlyCut“”EcoRV的CutOne“緩沖液中,在37℃培養(yǎng)4小時(shí),進(jìn)行20μl反應(yīng),通過瓊脂糖凝膠電泳測定,轉(zhuǎn)化為刻痕或線性形式的轉(zhuǎn)化率<10%。
藍(lán)/白篩選試驗(yàn)
用1μl FlyCut消化含有lacZα基因的合適載體™ EcoRV。將消化產(chǎn)物連接并轉(zhuǎn)化為大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞。在含有X-Gal、IPTG和適當(dāng)抗生素的Luria Bertani培養(yǎng)板上,成功連接的β-半乳糖苷酶基因可以表達(dá)并產(chǎn)生藍(lán)色菌落,而中斷基因(即降解的DNA末端)產(chǎn)生白色菌落。FlyCut™ 限制性內(nèi)切酶必須產(chǎn)生少于1%的白色菌落。
在推薦的反應(yīng)條件下,該酶可在5~15分鐘內(nèi)消化單位底物。酶的最適反應(yīng)溫度為37℃。
當(dāng)?shù)孜?span style="font-family: Calibri;">DNA被CpG甲基化酶甲基化時(shí),這種限制性酶的切割可能被阻斷或受損。
當(dāng)?shù)孜?span style="font-family: Calibri;">DNA被EcoBI甲基化酶甲基化時(shí),這種限制性酶的切割可能被阻斷或受損。
該酶可以在80°C下孵育20分鐘進(jìn)行熱滅活。孵育3小時(shí)不會(huì)顯示星形活性,但孵育時(shí)間較長可能會(huì)導(dǎo)致星形活性。
快速DNA消化方案:
① 按照指示的順序在冰上混合下列反應(yīng)組分
Plasmid DNA PCR product Genomic DNA
ddH?O 15μl 16μl 30μl
10x CutOne' Buffer or 10xCutOne Color Buffer2μl 3μl2 5μl
DNA 2μl(up to 1μg) 10μ(~0.2μg) 10μl(5μg)
FlyCut" EcoRV 1μl 1μl 5μl
Total 20μl 30μl 50μl
對于純化的PCR產(chǎn)物。如果PCR產(chǎn)物未純化,則10×CutOne的量™ 緩沖液應(yīng)減少到2μl,以減少未純化的PCR產(chǎn)物中剩余的金屬離子。我們建議在消化前純化PCR產(chǎn)物,將其用于克隆,因?yàn)橐恍?span style="font-family: Calibri;">DNA聚合酶的核酸外切酶活性可能會(huì)改變切割DNA的末端
② 輕輕混合并向下旋轉(zhuǎn);
③ 在37°C下培養(yǎng)15分鐘(質(zhì)粒DNA)或15~30分鐘(PCR產(chǎn)物)或30~60分鐘(基因組DNA);
④可選:在80°C下加熱20分鐘使酶失活;
⑤如果CutOne™ 在反應(yīng)中使用顏色緩沖液,將反應(yīng)混合物的等分試樣直接裝入凝膠中。
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