Cy5.5 (Cyanine 5.5) 的熒光激發(fā)峰和發(fā)射峰分別在680和710 nm左右，是一種發(fā)近紅外（NIR）熒光的花青素熒光染料。它的消光系數(shù)高，熒光也很亮，并且對pH不敏感，并且由于它的熒光波長（Em：710nm）恰好處于肌體組織近紅外窗口 I 的區(qū)域（肌體的血液，體液和組織此區(qū)域背景熒光弱，而長波長穿透性強），所以Cy5.5常應用于小動物活體體內(nèi)成像中。

Cy5.5可以用來標記蛋白，抗體，多肽，核酸分子，納米粒等，它常見的使用是標記核酸分子（DNA和RNA）。

磺化Cy5.5水溶性非常好，所以可以在水相的標記反應體系中直接使用，不需要有機溶劑助溶，特別適合標記對有機溶劑敏感的生物分子。另外磺化Cy5.5本身帶電荷，標記到蛋白表面后不會引發(fā)疏水性蛋白聚集，提高熒光標記產(chǎn)物的穩(wěn)定性?；腔疌y5.5標記染料也溶于甲醇，DMSO，DMF等有機溶劑，標記反應也可以在純有機溶劑中進行。如需脂溶性Cy5.5染料，應選擇普通花青素（cyanine），即普通Cy5.5。

磺化Cy5.5水溶性非常好，所以可以在水相的標記反應體系中直接使用，不需要有機溶劑助溶，特別適合標記對有機溶劑敏感的生物分子。另外磺化Cy5.5本身帶電荷，標記到蛋白表面后不會引發(fā)疏水性蛋白聚集，提高熒光標記產(chǎn)物的穩(wěn)定性?；腔疌y5.5標記染料也溶于甲醇，DMSO，DMF等有機溶劑，標記反應也可以在純有機溶劑中進行。如需脂溶性Cy5.5染料，應選擇普通花青素（cyanine），即普通Cy5.5。