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一種新的高光譜特征提取方法用于小麥葉片生物量監(jiān)測

來源:江蘇雙利合譜科技有限公司   2023年10月30日 08:27  

背景

高光譜遙感可獲得窄波段的連續(xù)光譜信息,可提供大量關(guān)于作物理化參數(shù)的豐富信息。但是使用全波段作為輸入變量會帶來較大的噪聲和冗余信息,同時必然會增加數(shù)據(jù)處理負荷、儀器成本和應(yīng)用的復(fù)雜性。因此現(xiàn)有研究中通常選擇一小組傳達數(shù)據(jù)主要信息的敏感特征來反演作物目標參數(shù)。

目前,協(xié)同區(qū)間偏最小二乘(SIPLS)或連續(xù)投影算法(SPA)已被成功應(yīng)用于優(yōu)特征的選擇。SIPLS可以保證所選波長的連續(xù)性,使模型性能穩(wěn)定。然而,研究中發(fā)現(xiàn)SIPLS選擇的區(qū)間位置和長度都是固定的,這表明優(yōu)選特征中存在無用信息和共線性。而SPA是建立在凸幾何端元搜索算法上的。因此,該方法可以降低對離群像素的敏感性,并生成真實的端元。同時,SPA的目標是在所有數(shù)據(jù)中選擇共線性最小的變量,這比其他算法提供的結(jié)果更具可重復(fù)性,但其所選擇的變量也可能存在信噪比低或共線性較小的現(xiàn)象。

為了克服這些缺點并促進高光譜數(shù)據(jù)的特征選擇,本研究提出了一種新的混合的特征選擇方法,命名為SIPLS-SPA,并將選取的優(yōu)光譜特征用于建立更準確、穩(wěn)定的小麥葉片生物量監(jiān)測模型。

 

試驗設(shè)計

南京農(nóng)業(yè)大學(xué)姚霞教授團隊利用江蘇雙利合譜公司可見/近紅外高光譜成像系統(tǒng)Gaiafield-V10E,獲取了小麥不同生育期的冠層高光譜影像,并對影像進行預(yù)處理從而獲得平均光譜(圖1)。

1 小麥冠層高光譜影像預(yù)處理流程

利用SIPLS-SPA進行特征優(yōu)選的主要步驟:(1)全波段(400-1000 nm)被分成P個區(qū)間(25-50);(2)結(jié)合QQ = 2,3,4)與相應(yīng)葉片生物量建立PLSR模型;(3)重復(fù)步驟(1)和(2),選擇使PLSR模型的RMSE最小時的PQ的值;(4)根據(jù)確定的PQ,得到敏感特征的光譜矩陣,設(shè)為XN*J,N為樣本數(shù),J為光譜變量數(shù));(5)隨機選取一列為Xj,其余定義為S;(6)分別計算XjS的投影。S的最大投影表示最小相關(guān)性,其對應(yīng)的列定義為Xi;(7)設(shè)置Xi而不是Xj,并重復(fù)步驟(5)和(6),直到所選變量的數(shù)量達到預(yù)設(shè)值M。M的值是通過多次數(shù)據(jù)計算確定的。在本研究中,M = 20;(8)將選擇的變量與相應(yīng)生物量擬合多元線性回歸(MLR)模型。最后,選擇使MLRRMSE最小的變量。

 

結(jié)論

通過步驟(1-4),成功獲得了每個PLSR模型的RMSEcv。結(jié)果表明,在P = 37Q = 4條件下獲得了RMSEcv z低的最佳PLSR模型(圖2)。這意味著當(dāng)整個光譜區(qū)域平均劃分為37個區(qū)間時,用4個區(qū)間(22、24、3037)構(gòu)建的PLSR模型表現(xiàn)最好。運行步驟(5-8),確定最佳高光譜變量為706724、734、806808、810、812816 nm。

2 不同PQ值下SIPLS模型的RMSEcv

利用SIPLS-SPA選擇的輸入變量,建立了小麥葉片生物量在五個生長階段的校準模型(圖3)。

3 SIPLS-SPA在校準(A)和驗證(B)中估算的小麥葉片生物量的實測值與預(yù)測值之間的1:1擬合關(guān)系

通過對比SIPLSSPASIPLS-SPA選擇的敏感特征(表1)。結(jié)果表明,SIPLS對小麥葉片生物量的敏感特征分別為694-706、722-734、806-816890-900 nm,而SPA的敏感特征分別為726、744、758、816830 nm。簡而言之,SIPLS選擇的敏感特征比SPASIPLS-SPA多。以SPA、SIPLSSPA-SIPLS選擇的敏感特征為輸入變量,構(gòu)建小麥葉片生物量PLSR模型。結(jié)果表明,SIPLS模型和全波段模型的Rc2最大(0.84),其次是SPA模型和SIPLS-SPA模型。而采用SIPLS-SPA模型得到的Rv2最大(Rv2 = 0.67),采用SIPLS模型得到的Rv2最小。利用SIPLS-SPA選擇的敏感特征建立的模型RMSEv最小(0.059 kg/m2),RRMSEv最小(38.55%)。

使用三個指標對PLSR模型的實用性進行評價(表2)。結(jié)果表明,SPA模型運行時間最短,其次是SIPLS-SPA模型,而全波段模型運行時間最長。SPA模型和SIPLS-SPA模型的矩陣復(fù)雜度和計算復(fù)雜度相似且較低,但全波段模型的矩陣復(fù)雜度和計算復(fù)雜度最高。

1 SIPLS、SPASIPLS-SPA選擇的敏感特征

 

2 利用SIPLS、SPASIPLS-SPA方法提取敏感變量建立PLSR模型的實用性

 

作者信息

姚霞,博士,南京農(nóng)業(yè)大學(xué)國家信息農(nóng)業(yè)工程技術(shù)中心教授,博士生導(dǎo)師。

主要研究方向:基于高光譜/日光誘導(dǎo)葉綠素?zé)晒?/font>/激光雷達的星--地作物生長監(jiān)測;作物表型高通量獲取等。

參考文獻:

Jia, M., Li, W., Wang, K., Zhou, C., Cheng, T., Tian, Y., Zhu, Y., Cao, W., & Yao, X. (2019). A newly developed method to extract the optimal hyperspectral feature for monitoring leaf biomass in wheat. Computers and Electronics in Agriculture, 165. 

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