質(zhì)粒小科普

質(zhì)粒（Plasmid）是廣泛存在于生物界中的環(huán)狀雙鏈DNA分子。目前在細(xì)菌、放線菌、真菌和不少動(dòng)植物細(xì)胞中均發(fā)現(xiàn)有質(zhì)粒的存在，其中細(xì)菌質(zhì)粒是研究最深入、應(yīng)用廣泛的［１］。因?yàn)橘|(zhì)粒分子本身具有復(fù)制功能的遺傳結(jié)構(gòu)，可攜帶一些遺傳信息，并且其自我復(fù)制能力和攜帶遺傳信息能力非常強(qiáng)大，經(jīng)過(guò)基因表達(dá)后可使其宿主細(xì)胞表現(xiàn)相應(yīng)的性狀，所以質(zhì)粒常被用作基因載體，在分子生物學(xué)、生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)等學(xué)科中得到廣泛的應(yīng)用［2］。

圖1 大腸桿菌質(zhì)粒分子結(jié)構(gòu)示意圖

質(zhì)粒提取方法及原理

質(zhì)粒的提取是分子克隆中常用的一種技術(shù)，即去除RNA，將質(zhì)粒與細(xì)菌基因組DNA分開(kāi)，去除蛋白質(zhì)及其它雜質(zhì)，以得到相對(duì)純凈的質(zhì)粒的過(guò)程。質(zhì)粒的質(zhì)量直接影響到基因操作的后續(xù)步驟，如轉(zhuǎn)化、酶切和序列分析等，因此獲得足夠量的質(zhì)粒是質(zhì)粒應(yīng)用的重要一步。生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中質(zhì)粒的獲取方式主要是通過(guò)在大腸桿菌中擴(kuò)增，從而獲取大量的含有目的基因的載體質(zhì)粒。其主要過(guò)程是對(duì)感受態(tài)細(xì)菌進(jìn)行轉(zhuǎn)化，挑取克隆菌落，在LB培養(yǎng)基中搖菌進(jìn)行擴(kuò)增和質(zhì)粒抽提［3］?？蒲泄ぷ髡咭呀?jīng)開(kāi)發(fā)出很多質(zhì)粒抽提的方法，目前普遍采用的質(zhì)粒提取方法主要有堿裂解法、煮沸法、SDS裂解法和有機(jī)溶劑法等。堿裂解法提取質(zhì)粒具有得率高，適用面廣，快速，純度高等特點(diǎn)，因此堿裂解法目前被廣泛采用。下面著重介紹堿裂解法提取質(zhì)粒的原理。

圖2 質(zhì)粒提取過(guò)程

堿裂解法提取質(zhì)粒主要原理是利用共價(jià)閉合環(huán)狀質(zhì)粒和線性染色質(zhì)在拓?fù)鋵W(xué)上的差異。利用NaOH和SDS溶液使細(xì)胞裂解,在堿性溶液中,線性的大分子量細(xì)菌染色體DNA氫鍵斷裂,雙螺旋結(jié)構(gòu)遭破壞而發(fā)生變性,但由于質(zhì)粒DNA分子量相對(duì)較小,且呈環(huán)狀超螺旋結(jié)構(gòu),即使在高堿性pH條件下,兩條互補(bǔ)鏈也不會(huì)充分分離。當(dāng)加入中性緩沖液調(diào)和時(shí),變性的質(zhì)粒DNA又恢復(fù)到原來(lái)的構(gòu)型,而染色體DNA不能復(fù)性,它們之間交聯(lián)形成不溶性網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),并與細(xì)胞碎片、蛋白質(zhì)、SDS等結(jié)合沉淀下來(lái)。通過(guò)離心沉淀，細(xì)胞碎片、染色體DNA及大部分蛋白質(zhì)等可被除去,而質(zhì)粒DNA小分子量的RNA留在上清液中，混雜的RNA用RNaseA除去。一些可溶性蛋白，可通過(guò)酚/氯仿抽提除去，最后獲得純度較高的質(zhì)粒DNA。由于堿裂解法的眾多優(yōu)勢(shì)，市面上大多數(shù)的質(zhì)粒抽提試劑盒基本采用的方法是堿裂解法。

質(zhì)粒提取分類(lèi)

大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室都會(huì)選擇基于堿裂解法的質(zhì)粒提取試劑盒來(lái)提取質(zhì)粒，根據(jù)不同的樣本量及獲取目標(biāo)質(zhì)粒的產(chǎn)量分為質(zhì)粒小提、質(zhì)粒中提、質(zhì)粒大提。

1、質(zhì)粒小提

質(zhì)粒小提主要是對(duì)于1-5mL的菌液中質(zhì)粒DNA進(jìn)行小量提取,獲得的質(zhì)粒用來(lái)進(jìn)行常規(guī)的載體構(gòu)建實(shí)驗(yàn)。

Absin金牌產(chǎn)品

·無(wú)內(nèi)毒素高純度質(zhì)粒小量快速提取試劑盒（abs60023）

1、采用改進(jìn)SDS-堿裂解法裂解細(xì)胞，粗提物通過(guò)過(guò)濾柱除去內(nèi)毒素；
2、離心吸附柱內(nèi)硅基質(zhì)膜全部采用進(jìn)口特制吸附膜，柱與柱之間吸附量差異極小，可重復(fù)性好。
3、獨(dú)you的去蛋白液配方，可以高效去除核酸酶。即使是核酸酶含量豐富的菌株如JM系列、HB101也可以輕松去除。有效防止了質(zhì)粒被核酸酶降解。
4、獨(dú)te內(nèi)毒素清除方法，清除內(nèi)毒素效果一般小于<0.1 EU/μg。

Absin質(zhì)粒小提產(chǎn)品清單

2、質(zhì)粒中提

質(zhì)粒中提是在質(zhì)粒小提的基礎(chǔ)上進(jìn)一步去除菌液中的內(nèi)毒素,獲得的質(zhì)?？梢杂糜诩?xì)胞轉(zhuǎn)染,常規(guī)需要菌液量為10-15mL。

3、質(zhì)粒大提

質(zhì)粒大提與中提方法相同,一次可對(duì)100-200mL菌液進(jìn)行抽提,從而獲得大量質(zhì)粒。

Absin金牌產(chǎn)品：

• 去內(nèi)毒素中大量質(zhì)粒富集提取試劑盒（abs60300）

1、高效提取中大量菌液質(zhì)粒DNA，提取菌液量：5mL、10mL、20mL、50mL、100mL或以上；
2、提取質(zhì)粒DNA純度高，可高效去除質(zhì)粒中污染的內(nèi)毒素，內(nèi)毒素去除率可高達(dá)90%以上，有效提升質(zhì)粒轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)的成功率；
3、真空濃縮，大幅提升洗脫液中質(zhì)粒DNA濃度，DNA濃度可達(dá)2ug/uL以上；
4、用于培養(yǎng)菌液樣本中質(zhì)粒DNA的提取，提取后的質(zhì)粒DNA可用于細(xì)胞轉(zhuǎn)染、酶切、PCR、測(cè)序、體外轉(zhuǎn)錄與翻譯、構(gòu)建文庫(kù)等多種分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。

Absin質(zhì)粒中提、大提產(chǎn)品清單

質(zhì)粒提取其實(shí)并不難，但是選擇符合我們實(shí)驗(yàn)的質(zhì)粒提取方法和試劑盒非常重要，因?yàn)橛挚煊趾玫靥崛〕龇舷掠螌?shí)驗(yàn)要求的質(zhì)粒，無(wú)疑會(huì)對(duì)我們的實(shí)驗(yàn)起到錦上添花的作用。

本期的分子小課堂就到這里啦，祝大家實(shí)驗(yàn)順利，我們下期再見(jiàn)啦！

參考文獻(xiàn)

[1] Lars M?lbak, Tett A, Ussery D W, et al. The plasmid genome database.[J]. Microbiology, 2003, 149(Pt 11):3043-5. DOI:10.1099/mic.0.C0123-0.

[2] Diaz Ricci J C ,Hernández ME. Plasmid Effects on Escherichia coli Metabolism[J]. Critical Reviews in Biotechnology, 2000, 20(2):79-108. DOI:10.1080/07388550008984167.

[3] Li G , Liu J , Chen N, et al. A new method to recover L-tyrosine from E. coli fermentation broth A new method to recover L-tyrosine from E. coli fermentation broth[J].Bioengineered, 2020, 11(1):1080-1083.DOI:10.1080/21655979.2020.1827893.